More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_4004 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_4098  outer membrane adhesin like proteiin  97.82 
 
 		 6662 aa  3041    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3982  putative outer membrane adhesin like proteiin  97.82 
 
 		 6683 aa  3045    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4004  putative outer membrane adhesin like proteiin  100 
 
 		 2239 aa  4402    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.328168  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0382  putative outer membrane adhesin like proteiin  60.83 
 
 		 5839 aa  1342    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0384  hypothetical protein  50.55 
 
 		 4285 aa  861    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3905  outer membrane adhesin like proteiin  90.22 
 
 		 6779 aa  2809    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2342  putative outer membrane adhesin like proteiin  41.81 
 
 		 2812 aa  648    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000136287 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0313  putative outer membrane adhesin like proteiin  43.94 
 
 		 4836 aa  466  1e-129  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.971398 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0491  outer membrane adhesin like proteiin  36.25 
 
 		 7149 aa  453  1e-125  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0133  von Willebrand factor, type A  44.52 
 
 		 5218 aa  446  1e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.809343 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3591  putative outer membrane adhesin like proteiin  70.64 
 
 		 4220 aa  419  9.999999999999999e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5060  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  41.75 
 
 		 5962 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.943676 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0186  hypothetical protein  36.76 
 
 		 6753 aa  410  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306412 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4139  putative outer membrane adhesin like proteiin  41.97 
 
 		 4122 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0384  putative outer membrane adhesin like protein  50.5 
 
 		 5442 aa  405  1e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3642  putative outer membrane adhesin like protein  50.18 
 
 		 4791 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4317  RTX toxin, putative  57.92 
 
 		 2768 aa  394  1e-107  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3060  von Willebrand factor type A  33.97 
 
 		 4678 aa  387  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003404  putative RTX toxin  31.78 
 
 		 4848 aa  379  1e-103  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0436  putative outer membrane adhesin like proteiin  41.3 
 
 		 5787 aa  362  4e-98  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02371  hypothetical protein  44.8 
 
 		 2127 aa  345  8e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5959  outer membrane adhesin like proteiin  44.44 
 
 		 2567 aa  336  4e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.33422  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3331  outer membrane adhesin like proteiin  38.21 
 
 		 3439 aa  315  5.999999999999999e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0510  putative outer membrane adhesin like proteiin  41.32 
 
 		 2812 aa  286  3.0000000000000004e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1638  VCBS  40.7 
 
 		 5094 aa  277  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4149  RTX toxin, putative  40.77 
 
 		 5020 aa  264  2e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0478  outer membrane adhesin like proteiin  33.84 
 
 		 3259 aa  252  5e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001580  rTX toxin putative  36.14 
 
 		 2743 aa  249  4e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2179  putative outer membrane adhesin like proteiin  37.1 
 
 		 14916 aa  248  9.999999999999999e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0314  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.54 
 
 		 1553 aa  245  9e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0526571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  37 
 
 		 1883 aa  236  5e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1637  VCBS  35.93 
 
 		 2127 aa  232  5e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3199  VCBS  40.99 
 
 		 4854 aa  229  5.0000000000000005e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0477  outer membrane adhesin like proteiin  51.35 
 
 		 16322 aa  228  1e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0368  cadherin  43.27 
 
 		 5444 aa  227  2e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2430  VBCS repeat-containing protein  36.1 
 
 		 3758 aa  213  5e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0479  outer membrane adhesin like proteiin  33.16 
 
 		 3229 aa  205  8e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0150  outer membrane adhesin like proteiin  41.36 
 
 		 1206 aa  202  5e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3258  putative outer membrane adhesin like protein  58.29 
 
 		 4214 aa  199  6e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.523735 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0797  outer membrane adhesin like proteiin  33.54 
 
 		 1141 aa  197  2e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000422857  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0369  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.93 
 
 		 2067 aa  191  2e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.936845  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0676  VCBS  32.06 
 
 		 4661 aa  182  7e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000119465 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1122  outer membrane adhesin like proteiin  33.8 
 
 		 2784 aa  181  2e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1242  VCBS  31.07 
 
 		 16311 aa  174  1e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4138  hypothetical protein  32.47 
 
 		 3182 aa  173  3e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1215  type 1 secretion target domain protein  49.19 
 
 		 2542 aa  173  4e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4137  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.21 
 
 		 1599 aa  159  5.0000000000000005e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1854  hemolysin-type calcium-binding region  31.86 
 
 		 5171 aa  146  4e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000611986 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0367  VCBS  32.78 
 
 		 6678 aa  142  6e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.410615 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3182  putative outer membrane adhesin-like protein  28.79 
 
 		 3132 aa  135  1.0000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3075  outer membrane adhesin like proteiin  29.75 
 
 		 3508 aa  123  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  39.3 
 
 		 8871 aa  121  9.999999999999999e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1239  VCBS  31.12 
 
 		 2461 aa  119  5e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0594  von Willebrand factor, type A  33.55 
 
 		 686 aa  113  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.855968  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5407  hypothetical protein  27.82 
 
 		 3714 aa  113  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1294  polyhydroxyalkanoate synthesis repressor PhaR  45.68 
 
 		 8321 aa  112  7.000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.359322 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1806  hemolysin-type calcium-binding region  36.72 
 
 		 3184 aa  109  8e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.387385 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0699  structural toxin protein RtxA  27 
 
 		 7679 aa  107  2e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1877  hypothetical protein  42.33 
 
 		 1699 aa  107  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.070874 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4603  outer membrane adhesin like proteiin  30.16 
 
 		 1867 aa  107  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.873009  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3766  hemolysin-type calcium-binding protein  46.46 
 
 		 1166 aa  107  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.234003  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1979  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.36 
 
 		 3038 aa  105  7e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.109352 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1463  VCBS  35.5 
 
 		 2887 aa  106  7e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.743526 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3808  outer membrane adhesin like proteiin  42.07 
 
 		 2524 aa  102  7e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000355585 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1227  cadherin domain-containing protein  38.92 
 
 		 2251 aa  101  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1310  hypothetical protein  44.44 
 
 		 542 aa  100  3e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0330443  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0681  structural toxin protein RtxA  43.24 
 
 		 7919 aa  95.5  9e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1291  outer membrane adhesin like proteiin  28.28 
 
 		 2555 aa  92.8  6e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.983971 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  32.36 
 
 		 5745 aa  91.7  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1905  putative outer membrane adhesin like proteiin  25.29 
 
 		 1963 aa  90.5  3e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.849124 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0006  von Willebrand factor type A  44 
 
 		 2452 aa  89.7  6e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  46.1 
 
 		 1424 aa  89.4  7e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05070  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  38.85 
 
 		 4106 aa  87  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1167  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.2 
 
 		 1884 aa  86.7  0.000000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  40.85 
 
 		 1164 aa  85.9  0.000000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0276  outer membrane adhesin like proteiin  27.85 
 
 		 3091 aa  85.1  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  29.66 
 
 		 3191 aa  84.7  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3709  hemolysin-type calcium-binding region  39.24 
 
 		 2704 aa  84  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.406778 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1662  hemolysin-type calcium-binding region  41.56 
 
 		 260 aa  83.6  0.00000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  47.06 
 
 		 3209 aa  82  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0563  type 1 secretion C-terminal target domain protein  28.51 
 
 		 1706 aa  82  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0379  VCBS  28.19 
 
 		 7284 aa  82  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.943155 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0008  Hemolysin-type calcium-binding region  39.53 
 
 		 2336 aa  82  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0560  hemolysin-type calcium-binding region  40.11 
 
 		 1079 aa  82  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545421  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4079  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  50 
 
 		 485 aa  82  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.237943  normal  0.0279439 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0747  outer membrane adhesin like proteiin  39.16 
 
 		 1598 aa  81.3  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.525894 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000324  autotransporter adhesin  24.09 
 
 		 5123 aa  80.5  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0020  hemolysin-type calcium-binding protein  25.85 
 
 		 2890 aa  80.9  0.0000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0822  peptidase domain-containing protein  34.57 
 
 		 820 aa  80.5  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0055  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  36.92 
 
 		 3314 aa  80.1  0.0000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  42.31 
 
 		 1534 aa  79.7  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  28.34 
 
 		 4978 aa  79.7  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06128  hypothetical protein  25.37 
 
 		 6211 aa  79.7  0.0000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0398  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.94 
 
 		 1073 aa  78.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2715  VCBS  30.74 
 
 		 3026 aa  79  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2165  glycoside hydrolase family protein  50 
 
 		 475 aa  77.8  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.669505  normal  0.045019 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0412  beta-Ig-H3/fasciclin  42.42 
 
 		 510 aa  77.4  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.821212  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13810  Alginate lyase  40.31 
 
 		 417 aa  77.4  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0513  hypothetical protein  48.94 
 
 		 475 aa  76.6  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4711  putative secreted calcium-binding protein  38.58 
 
 		 219 aa  77  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.779916  normal  0.14825 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>