More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_13810 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_13810  Alginate lyase  100 
 
 		 417 aa  822    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3286  Poly(beta-D-mannuronate) lyase  35.32 
 
 		 343 aa  109  7.000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00739048  normal  0.539484 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2873  Poly(beta-D-mannuronate) lyase  33.48 
 
 		 1554 aa  102  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0258698 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2547  translation initiation factor SUI1  33.04 
 
 		 611 aa  94.4  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.858491  hitchhiker  0.00146085 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1215  type 1 secretion target domain protein  48.57 
 
 		 2542 aa  91.3  3e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  34.12 
 
 		 3209 aa  90.9  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  47.06 
 
 		 2678 aa  90.5  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4079  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  32.66 
 
 		 485 aa  90.5  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.237943  normal  0.0279439 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  42.76 
 
 		 3427 aa  90.1  7e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3060  von Willebrand factor type A  47.71 
 
 		 4678 aa  88.6  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1877  hypothetical protein  44.09 
 
 		 1699 aa  87  5e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.070874 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1974  peptidase-like  50.56 
 
 		 1594 aa  87  6e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.195376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3521  hypothetical protein  48.96 
 
 		 161 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0357588  normal  0.598556 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1619  cadherin  45.28 
 
 		 1202 aa  85.5  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42147  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3591  putative outer membrane adhesin like proteiin  39.86 
 
 		 4220 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3539  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  47.06 
 
 		 556 aa  84.7  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223263  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4728  endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.18 
 
 		 2346 aa  84  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0382  putative outer membrane adhesin like proteiin  39.22 
 
 		 5839 aa  84  0.000000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3605  lyase, putative  34.87 
 
 		 222 aa  83.6  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.903035  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  39.31 
 
 		 1883 aa  83.6  0.000000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2577  hemolysin-type calcium-binding region  51.04 
 
 		 1383 aa  83.2  0.000000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0100249  normal  0.0162919 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3376  lyase, putative  34.87 
 
 		 222 aa  83.2  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0555978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1854  hemolysin-type calcium-binding region  36.14 
 
 		 5171 aa  82.8  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000611986 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0006  von Willebrand factor type A  37.7 
 
 		 2452 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3057  hypothetical protein  34.9 
 
 		 238 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0328593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2478  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  30.53 
 
 		 524 aa  82  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0798  hypothetical protein  46.08 
 
 		 1538 aa  82.4  0.00000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1599  hemolysin-type calcium-binding region  42.34 
 
 		 303 aa  80.9  0.00000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0042965  normal  0.464742 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2777  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  44.76 
 
 		 1372 aa  80.1  0.00000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.878054  decreased coverage  0.00575711 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2102  hypothetical protein  30.2 
 
 		 229 aa  79.7  0.00000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00164411  normal  0.0561114 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4186  hypothetical protein  31.76 
 
 		 760 aa  79.7  0.00000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.394785 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  51.22 
 
 		 3954 aa  79.7  0.00000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4004  putative outer membrane adhesin like proteiin  40.31 
 
 		 2239 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.328168  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3709  hemolysin-type calcium-binding region  39.26 
 
 		 2704 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.406778 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  51.81 
 
 		 813 aa  79.3  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0327  hemolysin-type calcium binding protein  49.44 
 
 		 1814 aa  79  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0391395  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0124  hemolysin-type calcium-binding region  46.32 
 
 		 515 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.968152 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3982  putative outer membrane adhesin like proteiin  40.31 
 
 		 6683 aa  79  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5060  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  46.94 
 
 		 5962 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.943676 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  45.67 
 
 		 1019 aa  79  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0133  von Willebrand factor, type A  46.88 
 
 		 5218 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.809343 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3905  outer membrane adhesin like proteiin  40.31 
 
 		 6779 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0008  Hemolysin-type calcium-binding region  36.5 
 
 		 2336 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  49.5 
 
 		 1424 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4098  outer membrane adhesin like proteiin  40.31 
 
 		 6662 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3353  heme peroxidase  34.01 
 
 		 3608 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1294  polyhydroxyalkanoate synthesis repressor PhaR  39.87 
 
 		 8321 aa  77.8  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.359322 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2165  glycoside hydrolase family protein  38.67 
 
 		 475 aa  77.4  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.669505  normal  0.045019 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0477  outer membrane adhesin like proteiin  48.42 
 
 		 16322 aa  77.4  0.0000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  42.15 
 
 		 3619 aa  77  0.0000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0313  putative outer membrane adhesin like proteiin  46 
 
 		 4836 aa  76.6  0.0000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.971398 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5716  CHRD domain containing protein  36.2 
 
 		 460 aa  76.3  0.0000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4191  hemolysin-type calcium-binding region  44.76 
 
 		 982 aa  75.9  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.735923  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  51.19 
 
 		 1499 aa  75.9  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0513  hypothetical protein  38 
 
 		 475 aa  75.9  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3885  RTX cytolytic toxin protein A  51.85 
 
 		 1394 aa  76.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1606  Alginate lyase 2  36.79 
 
 		 274 aa  75.9  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139119  normal  0.151509 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0793  hemolysin-type calcium-binding region  56.72 
 
 		 795 aa  75.9  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873812  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3435  hemolysin-type calcium-binding region  50 
 
 		 219 aa  75.9  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.489484  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2705  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  46.6 
 
 		 517 aa  76.3  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0718596 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3548  glycoside hydrolase family 16  45.19 
 
 		 486 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0246  putative calcium binding hemolysin protein  51.81 
 
 		 1156 aa  75.5  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.383795  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51190  Secreted mannuronan C-5 epimerase  40.79 
 
 		 1403 aa  75.1  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.156968  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1919  hypothetical protein  46.34 
 
 		 1526 aa  75.5  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.369591  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0616  peptidase, metallopeptidases  44.07 
 
 		 745 aa  75.5  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  46.6 
 
 		 588 aa  75.5  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0760067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1741  Hemolysin-type calcium-binding region  40.94 
 
 		 329 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5015  lyase, putative  31.63 
 
 		 223 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0491  outer membrane adhesin like proteiin  48.1 
 
 		 7149 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1717  Hemolysin-type calcium-binding region  40.94 
 
 		 329 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0060  peptidase, metallopeptidase  38.21 
 
 		 421 aa  74.7  0.000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.210793  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4711  putative secreted calcium-binding protein  46.85 
 
 		 219 aa  74.7  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.779916  normal  0.14825 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0314  putative outer membrane adhesin like proteiin  42.05 
 
 		 1553 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0526571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1995  Hemolysin-type calcium-binding region  48.57 
 
 		 257 aa  74.7  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0203272  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0281  protein of unknown function DUF839  36.55 
 
 		 686 aa  74.3  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  43.64 
 
 		 1712 aa  74.3  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  41.32 
 
 		 3619 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1952  triacylglycerol lipase  45.05 
 
 		 622 aa  74.3  0.000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1441  Ig family protein  46.15 
 
 		 2245 aa  73.9  0.000000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.195412  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  43.24 
 
 		 4798 aa  73.9  0.000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2424  glycoside hydrolase family protein  43.16 
 
 		 467 aa  73.9  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.443188 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3922  hemolysin-type calcium-binding protein  41.88 
 
 		 313 aa  73.9  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3766  hemolysin-type calcium-binding protein  36.2 
 
 		 1166 aa  73.9  0.000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.234003  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1997  Hemolysin-type calcium-binding region  46.08 
 
 		 786 aa  73.9  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.177214 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3933  PKD domain containing protein  39.13 
 
 		 1502 aa  73.9  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114839  normal  0.527223 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11483  hypothetical protein  27.96 
 
 		 301 aa  73.9  0.000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0186  hypothetical protein  45.92 
 
 		 6753 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306412 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1998  Hemolysin-type calcium-binding region  46.6 
 
 		 817 aa  73.6  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0671214 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4091  hemolysin-type calcium-binding region  41.88 
 
 		 313 aa  73.6  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.402698 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0168  surface adhesion protein, putative  44.9 
 
 		 8682 aa  73.6  0.000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.810778 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0722  hemolysin-type calcium-binding region  48.28 
 
 		 851 aa  73.6  0.000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1963  hypothetical protein  36.51 
 
 		 1306 aa  73.2  0.000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0276  outer membrane adhesin like proteiin  43.36 
 
 		 3091 aa  73.2  0.000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3878  lipase  45.63 
 
 		 709 aa  73.2  0.000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0292806 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0384  hypothetical protein  41.01 
 
 		 4285 aa  73.2  0.000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49320  hypothetical protein  32.14 
 
 		 223 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.52458  normal  0.0698049 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1361  hypothetical protein  30.4 
 
 		 2329 aa  72.8  0.00000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0713283 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2582  hypothetical protein  31.16 
 
 		 370 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0495255  hitchhiker  0.0081508 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0188  hypothetical protein  44.9 
 
 		 9030 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220008 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  48.84 
 
 		 2667 aa  72.4  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>