More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0313 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_0313  putative outer membrane adhesin like proteiin  100 
 
 		 4836 aa  9178    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.971398 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4139  putative outer membrane adhesin like proteiin  40.38 
 
 		 4122 aa  1320    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0382  putative outer membrane adhesin like proteiin  63.67 
 
 		 5839 aa  670    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  31.38 
 
 		 4978 aa  820    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3591  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.61 
 
 		 4220 aa  1080    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2342  putative outer membrane adhesin like proteiin  58.33 
 
 		 2812 aa  1030    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000136287 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  35.37 
 
 		 5745 aa  1095    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0384  putative outer membrane adhesin like protein  59.42 
 
 		 5442 aa  660    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0436  putative outer membrane adhesin like proteiin  62.3 
 
 		 5787 aa  642    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4317  RTX toxin, putative  65.67 
 
 		 2768 aa  565  1.0000000000000001e-159  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0491  outer membrane adhesin like proteiin  30.95 
 
 		 7149 aa  557  1e-156  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3982  putative outer membrane adhesin like proteiin  61.65 
 
 		 6683 aa  548  1e-153  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3905  outer membrane adhesin like proteiin  62.91 
 
 		 6779 aa  548  1e-153  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0384  hypothetical protein  60.93 
 
 		 4285 aa  540  1e-151  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4098  outer membrane adhesin like proteiin  63.39 
 
 		 6662 aa  530  1e-148  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003404  putative RTX toxin  29.34 
 
 		 4848 aa  490  1e-136  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3642  putative outer membrane adhesin like protein  47.63 
 
 		 4791 aa  476  1e-132  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  32.22 
 
 		 3191 aa  473  1.0000000000000001e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4004  putative outer membrane adhesin like proteiin  43.94 
 
 		 2239 aa  464  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.328168  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0168  surface adhesion protein, putative  40.95 
 
 		 8682 aa  424  1e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.810778 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0186  hypothetical protein  42.77 
 
 		 6753 aa  423  1e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306412 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  31.26 
 
 		 3927 aa  424  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0188  hypothetical protein  40.72 
 
 		 9030 aa  423  1e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220008 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5060  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  40.06 
 
 		 5962 aa  420  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.943676 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0133  von Willebrand factor, type A  41.68 
 
 		 5218 aa  418  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.809343 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3060  von Willebrand factor type A  39.16 
 
 		 4678 aa  391  1e-106  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1167  putative outer membrane adhesin like proteiin  35.11 
 
 		 1884 aa  349  8e-94  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0368  cadherin  47.98 
 
 		 5444 aa  268  1e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3258  putative outer membrane adhesin like protein  33.09 
 
 		 4214 aa  253  7e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.523735 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0105  VCBS  32.56 
 
 		 1597 aa  244  2e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00289742  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4149  RTX toxin, putative  27.81 
 
 		 5020 aa  232  2e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4138  hypothetical protein  28.34 
 
 		 3182 aa  231  2e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0477  outer membrane adhesin like proteiin  43.96 
 
 		 16322 aa  228  2e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4137  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.4 
 
 		 1599 aa  218  2.9999999999999995e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1291  outer membrane adhesin like proteiin  31.97 
 
 		 2555 aa  217  3.9999999999999995e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.983971 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1227  cadherin domain-containing protein  47.81 
 
 		 2251 aa  216  7.999999999999999e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3063  VCBS  29.78 
 
 		 1269 aa  213  6e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3161  outer membrane adhesin-like protein  30.07 
 
 		 1269 aa  201  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0478  outer membrane adhesin like proteiin  43.99 
 
 		 3259 aa  199  1e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3256  outer membrane adhesin like proteiin  31.72 
 
 		 1268 aa  197  4e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0563  type 1 secretion C-terminal target domain protein  28.45 
 
 		 1706 aa  182  1e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1215  type 1 secretion target domain protein  45.96 
 
 		 2542 aa  169  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0506  putative outer membrane adhesin like protein  29.66 
 
 		 2816 aa  168  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1152  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.52 
 
 		 3363 aa  157  5.9999999999999996e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0594  von Willebrand factor, type A  30.78 
 
 		 686 aa  139  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.855968  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0314  putative outer membrane adhesin like proteiin  49.71 
 
 		 1553 aa  137  3.9999999999999996e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0526571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1242  VCBS  25.42 
 
 		 16311 aa  135  2.0000000000000002e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3199  VCBS  28.57 
 
 		 4854 aa  131  3e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0369  putative outer membrane adhesin like proteiin  45.63 
 
 		 2067 aa  127  4e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.936845  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3766  hemolysin-type calcium-binding protein  46.75 
 
 		 1166 aa  126  9e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.234003  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3808  outer membrane adhesin like proteiin  27.71 
 
 		 2524 aa  125  3e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000355585 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1294  polyhydroxyalkanoate synthesis repressor PhaR  47.02 
 
 		 8321 aa  122  9.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.359322 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1018  hypothetical protein  26.68 
 
 		 2767 aa  123  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.556407 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0798  hypothetical protein  31.46 
 
 		 3474 aa  119  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1979  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.67 
 
 		 3038 aa  116  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.109352 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1806  hemolysin-type calcium-binding region  30.7 
 
 		 3184 aa  116  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.387385 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4603  outer membrane adhesin like proteiin  26.75 
 
 		 1867 aa  114  5e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.873009  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2094  outer membrane adhesin like proteiin  27.49 
 
 		 1428 aa  114  6e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06128  hypothetical protein  29.92 
 
 		 6211 aa  112  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1877  hypothetical protein  43.07 
 
 		 1699 aa  112  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.070874 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4855  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.96 
 
 		 2114 aa  111  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.656621  normal  0.707732 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3075  outer membrane adhesin like proteiin  28.93 
 
 		 3508 aa  111  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5407  hypothetical protein  27.27 
 
 		 3714 aa  109  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02378  hypothetical protein  31.2 
 
 		 814 aa  107  7e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  30.09 
 
 		 2807 aa  106  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0699  structural toxin protein RtxA  28.28 
 
 		 7679 aa  105  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0681  structural toxin protein RtxA  28.54 
 
 		 7919 aa  101  3e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2814  peptidase-like  27.68 
 
 		 2334 aa  102  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0006  von Willebrand factor type A  42.86 
 
 		 2452 aa  99.8  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2430  VBCS repeat-containing protein  24.67 
 
 		 3758 aa  98.6  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05070  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  39.38 
 
 		 4106 aa  97.8  5e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0479  outer membrane adhesin like proteiin  30.77 
 
 		 3229 aa  95.1  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0379  VCBS  26.93 
 
 		 7284 aa  95.1  3e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.943155 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  28.49 
 
 		 2839 aa  94.4  5e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3323  hypothetical protein  33.95 
 
 		 3477 aa  94  6e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195201 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3709  hemolysin-type calcium-binding region  44.6 
 
 		 2704 aa  92.4  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.406778 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  41.94 
 
 		 2678 aa  91.7  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0008  Hemolysin-type calcium-binding region  38.78 
 
 		 2336 aa  91.3  5e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4079  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  51.55 
 
 		 485 aa  90.5  8e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.237943  normal  0.0279439 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3869  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.51 
 
 		 3816 aa  90.5  8e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0055  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  36.49 
 
 		 3314 aa  88.6  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0797  outer membrane adhesin like proteiin  24.96 
 
 		 1141 aa  89  0.000000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000422857  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0577  outer membrane adhesin like proteiin  26.22 
 
 		 2074 aa  88.6  0.000000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.144033 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1310  hypothetical protein  41.86 
 
 		 542 aa  88.2  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0330443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1702  hypothetical protein  28.13 
 
 		 1512 aa  84.7  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1854  hemolysin-type calcium-binding region  53.93 
 
 		 5171 aa  84.7  0.00000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000611986 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0949  fibronectin, type III domain-containing protein  29.61 
 
 		 892 aa  84.7  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2055  hemolysin-type calcium-binding region  49.04 
 
 		 652 aa  82.4  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.660296 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000324  autotransporter adhesin  26.23 
 
 		 5123 aa  82.4  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3154  hemolysin-type calcium-binding region  52 
 
 		 202 aa  81.6  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0996816 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3509  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  52 
 
 		 202 aa  81.6  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001580  rTX toxin putative  35.52 
 
 		 2743 aa  81.3  0.0000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3539  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  42.58 
 
 		 556 aa  80.1  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223263  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0304  hypothetical protein  29.65 
 
 		 1806 aa  80.1  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1367  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.79 
 
 		 3396 aa  80.1  0.000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.410312 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4728  endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.93 
 
 		 2346 aa  78.6  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3467  hemolysin-type calcium-binding region  44.74 
 
 		 1175 aa  78.6  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  37.04 
 
 		 3427 aa  78.6  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  38.78 
 
 		 1883 aa  78.2  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2591  cadherin  30.7 
 
 		 2145 aa  77.4  0.000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.213456 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>