More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2342 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_0313  putative outer membrane adhesin like proteiin  58.25 
 
 		 4836 aa  1030    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.971398 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0384  putative outer membrane adhesin like protein  61.74 
 
 		 5442 aa  640    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3642  putative outer membrane adhesin like protein  61.32 
 
 		 4791 aa  640    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4139  putative outer membrane adhesin like proteiin  48.04 
 
 		 4122 aa  832    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0382  putative outer membrane adhesin like proteiin  61.57 
 
 		 5839 aa  648    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2342  putative outer membrane adhesin like proteiin  100 
 
 		 2812 aa  5447    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000136287 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4004  putative outer membrane adhesin like proteiin  41.81 
 
 		 2239 aa  636  1e-180  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.328168  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0436  putative outer membrane adhesin like proteiin  41.1 
 
 		 5787 aa  618  1e-175  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0384  hypothetical protein  34.16 
 
 		 4285 aa  580  1.0000000000000001e-163  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4098  outer membrane adhesin like proteiin  59.58 
 
 		 6662 aa  565  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3905  outer membrane adhesin like proteiin  59.58 
 
 		 6779 aa  565  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3982  putative outer membrane adhesin like proteiin  59.58 
 
 		 6683 aa  565  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4317  RTX toxin, putative  58.76 
 
 		 2768 aa  508  9.999999999999999e-143  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0491  outer membrane adhesin like proteiin  71.19 
 
 		 7149 aa  405  1e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  34.24 
 
 		 5745 aa  352  4e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02371  hypothetical protein  44.47 
 
 		 2127 aa  350  3e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  31.81 
 
 		 4978 aa  323  3e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3591  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.59 
 
 		 4220 aa  311  8e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0477  outer membrane adhesin like proteiin  32.96 
 
 		 16322 aa  277  2.0000000000000002e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  30.45 
 
 		 3191 aa  253  5e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0105  VCBS  32.69 
 
 		 1597 aa  232  6e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00289742  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1167  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.14 
 
 		 1884 aa  220  2.9999999999999998e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1227  cadherin domain-containing protein  45.39 
 
 		 2251 aa  209  7e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003404  putative RTX toxin  27.66 
 
 		 4848 aa  196  6e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1463  VCBS  29.61 
 
 		 2887 aa  194  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.743526 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3258  putative outer membrane adhesin like protein  56.54 
 
 		 4214 aa  191  2e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.523735 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4137  putative outer membrane adhesin like proteiin  40.06 
 
 		 1599 aa  181  1e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4138  hypothetical protein  33.82 
 
 		 3182 aa  178  9.999999999999999e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1291  outer membrane adhesin like proteiin  28.72 
 
 		 2555 aa  175  1e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.983971 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  32.2 
 
 		 3927 aa  172  7e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4603  outer membrane adhesin like proteiin  29.05 
 
 		 1867 aa  168  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.873009  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0563  type 1 secretion C-terminal target domain protein  31.01 
 
 		 1706 aa  166  9e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0368  cadherin  51.19 
 
 		 5444 aa  152  9e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  25.05 
 
 		 9867 aa  143  4.999999999999999e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3063  VCBS  28.33 
 
 		 1269 aa  142  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3161  outer membrane adhesin-like protein  29.64 
 
 		 1269 aa  141  1e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0506  putative outer membrane adhesin like protein  31.04 
 
 		 2816 aa  141  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3256  outer membrane adhesin like proteiin  29.65 
 
 		 1268 aa  140  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1854  hemolysin-type calcium-binding region  32.38 
 
 		 5171 aa  134  3e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000611986 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0798  hypothetical protein  30.86 
 
 		 3474 aa  129  9e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02378  hypothetical protein  31.82 
 
 		 814 aa  129  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3199  VCBS  26.2 
 
 		 4854 aa  127  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1018  hypothetical protein  26.54 
 
 		 2767 aa  127  4e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.556407 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0747  outer membrane adhesin like proteiin  34.03 
 
 		 1598 aa  124  3e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.525894 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1294  polyhydroxyalkanoate synthesis repressor PhaR  35.73 
 
 		 8321 aa  123  3.9999999999999996e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.359322 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1152  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.38 
 
 		 3363 aa  122  9e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3766  hemolysin-type calcium-binding protein  30.31 
 
 		 1166 aa  120  3e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.234003  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2094  outer membrane adhesin like proteiin  30.88 
 
 		 1428 aa  120  3.9999999999999997e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1665  outer membrane adhesin like proteiin  32.07 
 
 		 2825 aa  117  3e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0782  von Willebrand factor type A  30.84 
 
 		 5009 aa  116  7.000000000000001e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0168  surface adhesion protein, putative  46.31 
 
 		 8682 aa  114  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.810778 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0188  hypothetical protein  46.31 
 
 		 9030 aa  114  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220008 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1662  von Willebrand factor type A  28.3 
 
 		 6006 aa  113  6e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0186  hypothetical protein  53.7 
 
 		 6753 aa  110  5e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306412 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0133  von Willebrand factor, type A  55.43 
 
 		 5218 aa  106  7e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.809343 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5060  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  44.88 
 
 		 5962 aa  106  7e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.943676 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1877  hypothetical protein  39.79 
 
 		 1699 aa  104  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.070874 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0314  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.97 
 
 		 1553 aa  103  5e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0526571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4855  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.43 
 
 		 2114 aa  102  8e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.656621  normal  0.707732 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0369  putative outer membrane adhesin like proteiin  42.11 
 
 		 2067 aa  102  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.936845  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1979  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.78 
 
 		 3038 aa  101  2e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.109352 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  30.69 
 
 		 2807 aa  101  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0594  von Willebrand factor, type A  49.23 
 
 		 686 aa  99.8  7e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.855968  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0577  outer membrane adhesin like proteiin  25.89 
 
 		 2074 aa  99.4  9e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.144033 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3808  outer membrane adhesin like proteiin  42.76 
 
 		 2524 aa  99.4  9e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000355585 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1495  von Willebrand factor type A  30.81 
 
 		 2478 aa  99.4  9e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0478  outer membrane adhesin like proteiin  36 
 
 		 3259 aa  98.6  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4149  RTX toxin, putative  25.88 
 
 		 5020 aa  97.4  3e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1666  von Willebrand factor type A  30 
 
 		 1232 aa  97.8  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.854406  normal  0.168302 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3869  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.75 
 
 		 3816 aa  97.8  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  43.94 
 
 		 1883 aa  90.1  5e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3233  hypothetical protein  28.96 
 
 		 4465 aa  90.1  5e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.226873 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001580  rTX toxin putative  43.51 
 
 		 2743 aa  87  0.000000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3075  outer membrane adhesin like proteiin  28.76 
 
 		 3508 aa  86.7  0.000000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05070  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  40.43 
 
 		 4106 aa  85.9  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1806  hemolysin-type calcium-binding region  42.38 
 
 		 3184 aa  85.5  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.387385 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  25.89 
 
 		 2839 aa  85.1  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  45.19 
 
 		 1424 aa  84.7  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3060  von Willebrand factor type A  44.12 
 
 		 4678 aa  84.7  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1310  hypothetical protein  42.21 
 
 		 542 aa  84.3  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0330443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3709  hemolysin-type calcium-binding region  40.85 
 
 		 2704 aa  82.8  0.00000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.406778 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1215  type 1 secretion target domain protein  46.24 
 
 		 2542 aa  82.8  0.00000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3694  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.3 
 
 		 2507 aa  81.6  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1367  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.74 
 
 		 3396 aa  80.1  0.0000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.410312 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43897  predicted protein  38.06 
 
 		 2125 aa  79  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0681  structural toxin protein RtxA  39.87 
 
 		 7919 aa  78.2  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  27.68 
 
 		 2377 aa  78.2  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20050  hypothetical protein  30.98 
 
 		 721 aa  77.8  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.127306  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3323  hypothetical protein  33.09 
 
 		 3477 aa  77.4  0.000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195201 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0020  hemolysin-type calcium-binding protein  52.63 
 
 		 2890 aa  77  0.000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0055  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  35.64 
 
 		 3314 aa  77  0.000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3331  outer membrane adhesin like proteiin  24.44 
 
 		 3439 aa  76.3  0.000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0006  von Willebrand factor type A  41.38 
 
 		 2452 aa  76.6  0.000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0398  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.72 
 
 		 1073 aa  75.9  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06128  hypothetical protein  36.5 
 
 		 6211 aa  74.7  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0699  structural toxin protein RtxA  40.26 
 
 		 7679 aa  74.7  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4143  alkaline metalloproteinase precursor  41.53 
 
 		 479 aa  73.9  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.100514  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  42.98 
 
 		 3209 aa  72.8  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000324  autotransporter adhesin  35.07 
 
 		 5123 aa  72  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0479  outer membrane adhesin like proteiin  35.53 
 
 		 3229 aa  71.6  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>