More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0384 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_3905  outer membrane adhesin like proteiin  58.83 
 
 		 6779 aa  649    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4149  RTX toxin, putative  34.81 
 
 		 5020 aa  934    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0479  outer membrane adhesin like proteiin  43.87 
 
 		 3229 aa  1346    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3199  VCBS  36.08 
 
 		 4854 aa  1215    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3331  outer membrane adhesin like proteiin  33.9 
 
 		 3439 aa  853    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0676  VCBS  48.01 
 
 		 4661 aa  2506    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000119465 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1242  VCBS  36.61 
 
 		 16311 aa  850    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0369  putative outer membrane adhesin like proteiin  43.77 
 
 		 2067 aa  800    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.936845  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3982  putative outer membrane adhesin like proteiin  58.83 
 
 		 6683 aa  649    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0478  outer membrane adhesin like proteiin  38.58 
 
 		 3259 aa  898    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0384  hypothetical protein  100 
 
 		 4285 aa  8268    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5959  outer membrane adhesin like proteiin  38.76 
 
 		 2567 aa  796    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.33422  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4004  putative outer membrane adhesin like proteiin  78.58 
 
 		 2239 aa  854    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.328168  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4098  outer membrane adhesin like proteiin  58.83 
 
 		 6662 aa  649    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1638  VCBS  39.26 
 
 		 5094 aa  625  1e-177  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1122  outer membrane adhesin like proteiin  30.23 
 
 		 2784 aa  603  1e-170  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0436  putative outer membrane adhesin like proteiin  59.01 
 
 		 5787 aa  598  1e-169  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2342  putative outer membrane adhesin like proteiin  34.16 
 
 		 2812 aa  580  1.0000000000000001e-163  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000136287 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3642  putative outer membrane adhesin like protein  61.61 
 
 		 4791 aa  580  1.0000000000000001e-163  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4139  putative outer membrane adhesin like proteiin  43.84 
 
 		 4122 aa  575  1.0000000000000001e-162  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0382  putative outer membrane adhesin like proteiin  60.49 
 
 		 5839 aa  577  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0384  putative outer membrane adhesin like protein  57.4 
 
 		 5442 aa  576  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0510  putative outer membrane adhesin like proteiin  34.24 
 
 		 2812 aa  557  1e-156  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0313  putative outer membrane adhesin like proteiin  39.86 
 
 		 4836 aa  545  1e-153  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.971398 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4317  RTX toxin, putative  65.14 
 
 		 2768 aa  541  1e-151  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0367  VCBS  33.91 
 
 		 6678 aa  518  1.0000000000000001e-145  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.410615 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4138  hypothetical protein  28.97 
 
 		 3182 aa  503  1e-140  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1294  polyhydroxyalkanoate synthesis repressor PhaR  29.67 
 
 		 8321 aa  489  1e-136  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.359322 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2430  VBCS repeat-containing protein  27.28 
 
 		 3758 aa  476  1e-132  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0314  putative outer membrane adhesin like proteiin  42.74 
 
 		 1553 aa  439  1e-121  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0526571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  34.52 
 
 		 1883 aa  426  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0491  outer membrane adhesin like proteiin  69.06 
 
 		 7149 aa  418  1e-114  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0368  cadherin  50 
 
 		 5444 aa  410  1.0000000000000001e-112  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  30.99 
 
 		 8871 aa  394  1e-107  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02371  hypothetical protein  36.48 
 
 		 2127 aa  382  1e-103  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001580  rTX toxin putative  30.9 
 
 		 2743 aa  354  3e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3591  putative outer membrane adhesin like proteiin  45.12 
 
 		 4220 aa  318  9.999999999999999e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3182  putative outer membrane adhesin-like protein  29.04 
 
 		 3132 aa  317  4.999999999999999e-84  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1637  VCBS  32.3 
 
 		 2127 aa  306  6.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0150  outer membrane adhesin like proteiin  33.49 
 
 		 1206 aa  281  2e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4137  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.37 
 
 		 1599 aa  266  4.999999999999999e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5407  hypothetical protein  29.98 
 
 		 3714 aa  258  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  26.07 
 
 		 4978 aa  238  2.0000000000000002e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0276  outer membrane adhesin like proteiin  26.15 
 
 		 3091 aa  235  2e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2179  putative outer membrane adhesin like proteiin  34.77 
 
 		 14916 aa  234  2e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003404  putative RTX toxin  31.19 
 
 		 4848 aa  233  8e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3075  outer membrane adhesin like proteiin  28.71 
 
 		 3508 aa  230  6e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0477  outer membrane adhesin like proteiin  45.11 
 
 		 16322 aa  229  9e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0133  von Willebrand factor, type A  45.52 
 
 		 5218 aa  228  2e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.809343 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5060  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  45.39 
 
 		 5962 aa  227  3e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.943676 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  26.16 
 
 		 5745 aa  226  7e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0186  hypothetical protein  45.93 
 
 		 6753 aa  220  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306412 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1227  cadherin domain-containing protein  50.96 
 
 		 2251 aa  219  9.999999999999999e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0168  surface adhesion protein, putative  45.02 
 
 		 8682 aa  214  3e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.810778 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0188  hypothetical protein  45.02 
 
 		 9030 aa  214  3e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220008 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3060  von Willebrand factor type A  43.73 
 
 		 4678 aa  201  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  27.85 
 
 		 3191 aa  192  1e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3258  putative outer membrane adhesin like protein  51.56 
 
 		 4214 aa  191  3e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.523735 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1905  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.82 
 
 		 1963 aa  188  2.0000000000000003e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.849124 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0105  VCBS  30.96 
 
 		 1597 aa  176  1e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00289742  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1806  hemolysin-type calcium-binding region  34.84 
 
 		 3184 aa  172  1e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.387385 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4603  outer membrane adhesin like proteiin  28.47 
 
 		 1867 aa  171  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.873009  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1291  outer membrane adhesin like proteiin  31.64 
 
 		 2555 aa  167  6e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.983971 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  26.49 
 
 		 3699 aa  163  6e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3808  outer membrane adhesin like proteiin  27.54 
 
 		 2524 aa  153  6e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000355585 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1215  type 1 secretion target domain protein  40.74 
 
 		 2542 aa  152  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1167  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.63 
 
 		 1884 aa  152  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.03 
 
 		 3699 aa  145  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0797  outer membrane adhesin like proteiin  29.97 
 
 		 1141 aa  140  8e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000422857  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1463  VCBS  26.07 
 
 		 2887 aa  137  6e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.743526 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0594  von Willebrand factor, type A  29.82 
 
 		 686 aa  130  6e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.855968  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  26.29 
 
 		 3544 aa  129  9e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1239  VCBS  29.89 
 
 		 2461 aa  123  6e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1854  hemolysin-type calcium-binding region  29.9 
 
 		 5171 aa  119  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000611986 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0563  type 1 secretion C-terminal target domain protein  33 
 
 		 1706 aa  119  1.0000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0798  hypothetical protein  28.44 
 
 		 3474 aa  113  7.000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1979  putative outer membrane adhesin like proteiin  25.8 
 
 		 3038 aa  111  3e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.109352 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  25.27 
 
 		 11716 aa  107  5e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1877  hypothetical protein  44.75 
 
 		 1699 aa  104  4e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.070874 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  25.78 
 
 		 3927 aa  104  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3766  hemolysin-type calcium-binding protein  42.38 
 
 		 1166 aa  103  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.234003  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0379  VCBS  28.17 
 
 		 7284 aa  100  5e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.943155 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0506  putative outer membrane adhesin like protein  33.93 
 
 		 2816 aa  100  9e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1310  hypothetical protein  48.18 
 
 		 542 aa  99.4  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0330443  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0470  Ig family protein  25.71 
 
 		 2853 aa  95.5  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3709  hemolysin-type calcium-binding region  41.06 
 
 		 2704 aa  95.5  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.406778 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3256  outer membrane adhesin like proteiin  34.2 
 
 		 1268 aa  94  7e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1152  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.77 
 
 		 3363 aa  93.6  8e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3063  VCBS  34.25 
 
 		 1269 aa  93.2  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1367  putative outer membrane adhesin like proteiin  25.3 
 
 		 3396 aa  93.2  1e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.410312 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0055  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  43.5 
 
 		 3314 aa  92.4  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2550  putative outer membrane adhesin like protein  27.74 
 
 		 3598 aa  90.9  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3161  outer membrane adhesin-like protein  34.83 
 
 		 1269 aa  90.9  6e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2094  outer membrane adhesin like proteiin  31.18 
 
 		 1428 aa  89.7  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  38.89 
 
 		 9867 aa  89  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0006  von Willebrand factor type A  47.11 
 
 		 2452 aa  88.2  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0398  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.93 
 
 		 1073 aa  88.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0681  structural toxin protein RtxA  41.46 
 
 		 7919 aa  87  0.000000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  26.93 
 
 		 2839 aa  86.7  0.000000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3323  hypothetical protein  34.93 
 
 		 3477 aa  85.9  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195201 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>