More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_3982 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_0491  outer membrane adhesin like proteiin  48.02 
 
 
7149 aa  2664    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05070  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  33.02 
 
 
4106 aa  654    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4317  RTX toxin, putative  69.67 
 
 
2768 aa  1187    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0368  cadherin  32.37 
 
 
5444 aa  639    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4004  putative outer membrane adhesin like proteiin  97.82 
 
 
2239 aa  3046    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.328168  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3905  outer membrane adhesin like proteiin  93.17 
 
 
6779 aa  11140    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1026  hypothetical protein  31.96 
 
 
3516 aa  645    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.301497 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4098  outer membrane adhesin like proteiin  99.41 
 
 
6662 aa  12270    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0384  hypothetical protein  31.54 
 
 
4285 aa  691    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2658  hypothetical protein  31.14 
 
 
4689 aa  669    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3982  putative outer membrane adhesin like proteiin  100 
 
 
6683 aa  12480    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0384  putative outer membrane adhesin like protein  68.63 
 
 
5442 aa  1662    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3642  putative outer membrane adhesin like protein  45.48 
 
 
4791 aa  1790    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0382  putative outer membrane adhesin like proteiin  40.94 
 
 
5839 aa  2170    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4605  putative Ig domain family protein  29 
 
 
5561 aa  607  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4656  hypothetical protein  29.12 
 
 
5559 aa  604  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4606  large repetitive protein  28.98 
 
 
5559 aa  602  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4520  putative Ig domain protein  28.88 
 
 
5561 aa  596  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4512  large repetitive protein  29.03 
 
 
5561 aa  598  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2342  putative outer membrane adhesin like proteiin  59.58 
 
 
2812 aa  587  1.0000000000000001e-165  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000136287 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4139  putative outer membrane adhesin like proteiin  60.72 
 
 
4122 aa  566  1.0000000000000001e-159  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0436  putative outer membrane adhesin like proteiin  64.54 
 
 
5787 aa  556  1e-156  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0313  putative outer membrane adhesin like proteiin  61.65 
 
 
4836 aa  548  1e-153  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.971398 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0994  hypothetical protein  27.37 
 
 
4874 aa  513  1e-143  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1854  hemolysin-type calcium-binding region  39.6 
 
 
5171 aa  502  1e-140  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000611986 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0477  outer membrane adhesin like proteiin  74.21 
 
 
16322 aa  500  1e-139  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1001  C-type lectin domain-containing protein  31.52 
 
 
3325 aa  499  1e-139  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4113  hypothetical protein  32.64 
 
 
3562 aa  468  1e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0537133 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0133  von Willebrand factor, type A  44.22 
 
 
5218 aa  448  1e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.809343 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5060  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  40.42 
 
 
5962 aa  417  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.943676 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0186  hypothetical protein  36.68 
 
 
6753 aa  412  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.306412 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3060  von Willebrand factor type A  33.99 
 
 
4678 aa  408  1e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1051  hypothetical protein  28.64 
 
 
4430 aa  404  9.999999999999999e-111  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003404  putative RTX toxin  31.88 
 
 
4848 aa  390  1e-106  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02371  hypothetical protein  45.32 
 
 
2127 aa  353  5e-95  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2835  VCBS repeat-containing protein  29.42 
 
 
3824 aa  298  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2903  large repetitive protein  29.82 
 
 
3721 aa  288  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3258  putative outer membrane adhesin like protein  34.14 
 
 
4214 aa  280  9e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.523735 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01400  RTX toxin, putative  49.64 
 
 
606 aa  274  4e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2063  type I secretion target repeat-containing protein  29.39 
 
 
3204 aa  274  5.9999999999999995e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3591  putative outer membrane adhesin like proteiin  53.53 
 
 
4220 aa  266  8.999999999999999e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3119  putative outer membrane adhesin like proteiin  29 
 
 
3552 aa  266  1e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0912825 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40260  hypothetical protein  28.13 
 
 
2456 aa  260  6e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.702086  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2886  large repetitive protein  28.51 
 
 
3824 aa  244  5e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.659132 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3017  VCBS repeat-containing protein  28.95 
 
 
3739 aa  241  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2905  large repetitive protein  28.97 
 
 
3824 aa  238  4.0000000000000004e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0581  PKD domain protein  28.18 
 
 
1461 aa  230  7e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6371  hypothetical protein  26.69 
 
 
3736 aa  228  3e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1227  cadherin domain-containing protein  49.82 
 
 
2251 aa  216  2e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0478  outer membrane adhesin like proteiin  46.08 
 
 
3259 aa  215  2e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2201  cable pili-associated 22 kDa adhesin protein  29.02 
 
 
2911 aa  209  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.266239  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6074  hypothetical protein  26.08 
 
 
3734 aa  206  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0055  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  31.34 
 
 
3314 aa  202  2.0000000000000003e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3412  hypothetical protein  26.23 
 
 
2625 aa  199  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  32.06 
 
 
2927 aa  197  6e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0899  large repetitive protein  25.6 
 
 
5080 aa  195  2.9999999999999997e-47  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4137  putative outer membrane adhesin like proteiin  50.22 
 
 
1599 aa  176  2e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1215  type 1 secretion target domain protein  49.19 
 
 
2542 aa  175  3e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1601  hypothetical protein  27.3 
 
 
6715 aa  171  4e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4138  hypothetical protein  49.55 
 
 
3182 aa  169  2.0000000000000002e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3709  hemolysin-type calcium-binding region  29.13 
 
 
2704 aa  155  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.406778 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  40.14 
 
 
5745 aa  154  6e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  37.37 
 
 
4978 aa  141  5e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0105  VCBS  31.47 
 
 
1597 aa  134  5.0000000000000004e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00289742  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2392  cell wall associated biofilm protein  26.41 
 
 
2402 aa  130  6e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3132  hypothetical protein  36.53 
 
 
739 aa  125  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.756366  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  37.76 
 
 
3191 aa  116  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0314  putative outer membrane adhesin like proteiin  43.24 
 
 
1553 aa  116  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0526571  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1294  polyhydroxyalkanoate synthesis repressor PhaR  45.68 
 
 
8321 aa  114  6e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.359322 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0594  von Willebrand factor, type A  34.02 
 
 
686 aa  112  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.855968  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3766  hemolysin-type calcium-binding protein  46.46 
 
 
1166 aa  108  4e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.234003  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1877  hypothetical protein  42.33 
 
 
1699 aa  108  5e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.070874 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1806  hemolysin-type calcium-binding region  35.88 
 
 
3184 aa  106  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.387385 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0699  structural toxin protein RtxA  27 
 
 
7679 aa  105  3e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1463  VCBS  46.82 
 
 
2887 aa  104  5e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.743526 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3808  outer membrane adhesin like proteiin  44.14 
 
 
2524 aa  101  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000355585 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3027  hypothetical protein  27.83 
 
 
1278 aa  100  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3199  VCBS  38.78 
 
 
4854 aa  99.8  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1152  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.88 
 
 
3363 aa  99.4  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1310  hypothetical protein  44.44 
 
 
542 aa  98.2  4e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0330443  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02378  hypothetical protein  30.79 
 
 
814 aa  95.9  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0798  hypothetical protein  35.09 
 
 
3474 aa  95.1  4e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0369  putative outer membrane adhesin like proteiin  38.46 
 
 
2067 aa  94.7  5e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.936845  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3256  outer membrane adhesin like proteiin  34.39 
 
 
1268 aa  94.4  6e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0681  structural toxin protein RtxA  27.14 
 
 
7919 aa  94  8e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3063  VCBS  31.96 
 
 
1269 aa  93.6  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0479  outer membrane adhesin like proteiin  34.98 
 
 
3229 aa  92  4e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2849  RTX toxin-like protein  30.56 
 
 
1092 aa  92  4e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1291  outer membrane adhesin like proteiin  34.83 
 
 
2555 aa  91.3  6e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.983971 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3161  outer membrane adhesin-like protein  33.92 
 
 
1269 aa  90.1  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0006  von Willebrand factor type A  44 
 
 
2452 aa  89.4  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0563  type 1 secretion C-terminal target domain protein  30.86 
 
 
1706 aa  89.7  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  47.06 
 
 
1424 aa  89  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  32.59 
 
 
3927 aa  89  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4208  autotransporter adhesin  30.22 
 
 
3333 aa  88.6  0.000000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0020  hemolysin-type calcium-binding protein  26.52 
 
 
2890 aa  88.6  0.000000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3075  outer membrane adhesin like proteiin  33.02 
 
 
3508 aa  87.4  0.000000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0531  hypothetical protein  29.9 
 
 
850 aa  87  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.744468  normal  0.643161 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4603  outer membrane adhesin like proteiin  38.1 
 
 
1867 aa  86.3  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.873009  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1979  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.07 
 
 
3038 aa  85.1  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.109352 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>