171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3027 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3027  hypothetical protein  100 
 
 		 1278 aa  2507    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1001  C-type lectin domain-containing protein  46.45 
 
 		 3325 aa  298  4e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05070  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  45.29 
 
 		 4106 aa  254  9.000000000000001e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  43.31 
 
 		 2927 aa  249  3e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3119  putative outer membrane adhesin like proteiin  41.47 
 
 		 3552 aa  233  2e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0912825 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3017  VCBS repeat-containing protein  38.26 
 
 		 3739 aa  227  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4113  hypothetical protein  40.46 
 
 		 3562 aa  227  1e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0537133 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2903  large repetitive protein  36.33 
 
 		 3721 aa  227  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2886  large repetitive protein  38.26 
 
 		 3824 aa  226  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.659132 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2905  large repetitive protein  38.03 
 
 		 3824 aa  224  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2835  VCBS repeat-containing protein  37.79 
 
 		 3824 aa  223  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2063  type I secretion target repeat-containing protein  36.63 
 
 		 3204 aa  193  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2201  cable pili-associated 22 kDa adhesin protein  36.72 
 
 		 2911 aa  191  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.266239  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3709  hemolysin-type calcium-binding region  42.67 
 
 		 2704 aa  183  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.406778 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0055  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  37.24 
 
 		 3314 aa  162  3e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2848  hemagglutinin/hemolysin-related protein  33 
 
 		 4480 aa  139  4e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4520  putative Ig domain protein  31.89 
 
 		 5561 aa  130  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4512  large repetitive protein  31.89 
 
 		 5561 aa  130  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4606  large repetitive protein  31.89 
 
 		 5559 aa  130  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4656  hypothetical protein  31.89 
 
 		 5559 aa  130  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4605  putative Ig domain family protein  31.89 
 
 		 5561 aa  130  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3412  hypothetical protein  38.69 
 
 		 2625 aa  129  5e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40260  hypothetical protein  36.78 
 
 		 2456 aa  122  6e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.702086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1026  hypothetical protein  31.26 
 
 		 3516 aa  121  7e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.301497 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0899  large repetitive protein  34.39 
 
 		 5080 aa  117  2.0000000000000002e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  33.18 
 
 		 2839 aa  114  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1925  hypothetical protein  36.25 
 
 		 401 aa  113  2.0000000000000002e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.11551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0745  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  35.78 
 
 		 545 aa  107  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556771  hitchhiker  0.00012998 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4098  outer membrane adhesin like proteiin  27.76 
 
 		 6662 aa  105  5e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3905  outer membrane adhesin like proteiin  27.76 
 
 		 6779 aa  105  7e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3982  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.5 
 
 		 6683 aa  104  9e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1051  hypothetical protein  31.99 
 
 		 4430 aa  102  4e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3150  hypothetical protein  32.93 
 
 		 959 aa  102  5e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3420  cellulase  41.18 
 
 		 635 aa  100  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.342079 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0830  glycoprotein  33.07 
 
 		 8064 aa  100  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.51381 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3385  hypothetical protein  31.01 
 
 		 1792 aa  100  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.477011 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0186  hypothetical protein  32.28 
 
 		 395 aa  98.6  7e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0637616  normal  0.177188 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  47.12 
 
 		 1712 aa  97.1  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  46.15 
 
 		 2775 aa  96.7  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0806  surface adhesion protein, putative  32.64 
 
 		 6310 aa  96.3  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0845  hypothetical protein  31.7 
 
 		 5451 aa  96.7  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1924  hypothetical protein  36.4 
 
 		 523 aa  92  6e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.754501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1696  amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  35.53 
 
 		 1586 aa  92  6e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3022  hypothetical protein  30.24 
 
 		 3586 aa  92  7e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1926  hypothetical protein  36.44 
 
 		 266 aa  90.9  1e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0804  hemolysin-type calcium-binding region  42.42 
 
 		 2885 aa  89  6e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  39.29 
 
 		 2667 aa  87.8  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  39.29 
 
 		 1236 aa  87  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1029  hemolysin-type calcium-binding region  31.94 
 
 		 1529 aa  85.9  0.000000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.297534 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0927  phosphoesterase, PA-phosphatase related  27.15 
 
 		 5216 aa  83.2  0.00000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0384  putative outer membrane adhesin like protein  30.82 
 
 		 5442 aa  81.6  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1000  Parallel beta-helix repeat protein  31.54 
 
 		 710 aa  80.9  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.349147  hitchhiker  0.00938388 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6493  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  41.24 
 
 		 1102 aa  80.5  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0382  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.05 
 
 		 5839 aa  79.7  0.0000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4380  hypothetical protein  30.11 
 
 		 3923 aa  79.3  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2522  hypothetical protein  29.86 
 
 		 346 aa  75.5  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.165755  normal  0.604183 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0281  protein of unknown function DUF839  36.29 
 
 		 686 aa  75.1  0.000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4608  Hemolysin-type calcium-binding region  45.19 
 
 		 491 aa  74.3  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.912572 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0779  periplasmic copper-binding protein  25.91 
 
 		 1332 aa  73.6  0.00000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.195346  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3642  putative outer membrane adhesin like protein  30.19 
 
 		 4791 aa  71.6  0.00000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  36.28 
 
 		 2105 aa  71.2  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4802  glycoside hydrolase family protein  37.5 
 
 		 907 aa  70.5  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.609138 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4494  Hemolysin-type calcium-binding region  44.23 
 
 		 497 aa  70.1  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.486287  normal  0.131139 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4126  hemolysin-type calcium-binding region  44.23 
 
 		 497 aa  70.1  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.560509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  37.86 
 
 		 980 aa  68.9  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7343  Hemolysin-type calcium-binding region  38.46 
 
 		 615 aa  68.2  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.63 
 
 		 1795 aa  67.4  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0540  hypothetical protein  28.46 
 
 		 1061 aa  66.6  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2852  beta-glycosidase-like protein  26.92 
 
 		 1152 aa  66.6  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.359276  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1569  Hemolysin-type calcium-binding region  36.94 
 
 		 341 aa  66.2  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.722713  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1854  hemolysin-type calcium-binding region  31.18 
 
 		 5171 aa  66.2  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000611986 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7966  Hemolysin-type calcium-binding region  36.94 
 
 		 341 aa  65.9  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1945  fibronectin type III domain-containing protein  30.65 
 
 		 1047 aa  65.5  0.000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.771273  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4127  hemolysin-type calcium-binding region  41.9 
 
 		 475 aa  65.5  0.000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5716  CHRD domain containing protein  35.14 
 
 		 460 aa  65.1  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6224  endo-1,3-1,4-beta-glycanase, C-terminal secretion signal protein  33.86 
 
 		 475 aa  64.3  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.380521  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1919  hypothetical protein  30.87 
 
 		 1526 aa  64.3  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.369591  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4609  Hemolysin-type calcium-binding region  38.46 
 
 		 480 aa  63.9  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0571  hypothetical protein  39.81 
 
 		 2682 aa  63.5  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4495  Hemolysin-type calcium-binding region  40 
 
 		 475 aa  63.2  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.970189  normal  0.186376 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4114  hypothetical protein  34.78 
 
 		 747 aa  63.2  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.842824 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2430  VBCS repeat-containing protein  31.94 
 
 		 3758 aa  62.8  0.00000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1799  Fibronectin type III domain protein  32.79 
 
 		 1096 aa  62.8  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0160  Hemolysin-type calcium-binding protein  30.99 
 
 		 1390 aa  62.4  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6816  Hemolysin-type calcium-binding region  38.46 
 
 		 526 aa  62.4  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0491  outer membrane adhesin like proteiin  29.26 
 
 		 7149 aa  62.4  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1936  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.27 
 
 		 1016 aa  62  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0484  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  34.23 
 
 		 2668 aa  61.6  0.00000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0553  hypothetical protein  27.99 
 
 		 500 aa  61.6  0.00000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0105  VCBS  32.64 
 
 		 1597 aa  60.8  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00289742  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3132  hypothetical protein  31.45 
 
 		 739 aa  60.5  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.756366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8151  CHRD domain containing protein  33.33 
 
 		 460 aa  60.5  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.159577  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0650  hypothetical protein  28.03 
 
 		 300 aa  60.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.297052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4931  glycoside hydrolase family protein  32.73 
 
 		 465 aa  60.8  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.533696 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2782  Ig domain protein group 1 domain protein  36.47 
 
 		 4672 aa  59.3  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.117201 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7154  hypothetical protein  34.91 
 
 		 2039 aa  59.3  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1864  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase chain N  32.12 
 
 		 747 aa  58.5  0.0000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0649  hypothetical protein  30.88 
 
 		 642 aa  58.5  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0994  hypothetical protein  28.23 
 
 		 4874 aa  57.8  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3430  hypothetical protein  25 
 
 		 913 aa  58.2  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.836468  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>