98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2848 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_2848  hemagglutinin/hemolysin-related protein  100 
 
 		 4480 aa  8613    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2847  cadherin domain-containing protein  67.03 
 
 		 1699 aa  1317    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05070  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  37.6 
 
 		 4106 aa  517  1e-144  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0384  putative outer membrane adhesin like protein  27.62 
 
 		 5442 aa  503  1e-140  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2849  RTX toxin-like protein  53.48 
 
 		 1092 aa  496  9.999999999999999e-139  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2903  large repetitive protein  31.23 
 
 		 3721 aa  479  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2835  VCBS repeat-containing protein  31.3 
 
 		 3824 aa  473  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2886  large repetitive protein  31.2 
 
 		 3824 aa  474  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.659132 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3709  hemolysin-type calcium-binding region  35.5 
 
 		 2704 aa  474  1.0000000000000001e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.406778 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3017  VCBS repeat-containing protein  31.09 
 
 		 3739 aa  470  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2905  large repetitive protein  31.16 
 
 		 3824 aa  459  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1357  outer membrane protein  30.26 
 
 		 4830 aa  416  1e-114  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.381537 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2781  outer membrane autotransporter  33.3 
 
 		 2886 aa  403  9.999999999999999e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4143  outer membrane protein  30.11 
 
 		 3864 aa  400  1e-109  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0160  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  34.6 
 
 		 2156 aa  399  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3119  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.35 
 
 		 3552 aa  394  1e-107  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0912825 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1001  C-type lectin domain-containing protein  32.01 
 
 		 3325 aa  380  1e-103  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1974  hypothetical protein  29.78 
 
 		 7434 aa  317  4.999999999999999e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1026  hypothetical protein  33.15 
 
 		 3516 aa  311  2.0000000000000002e-82  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.301497 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  29.08 
 
 		 2927 aa  281  3e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0675  Pyrrolo-quinoline quinone  30.8 
 
 		 3066 aa  274  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895028 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2696  outer membrane autotransporter  27.75 
 
 		 2194 aa  256  9.000000000000001e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.533245 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4113  hypothetical protein  27.29 
 
 		 3562 aa  225  1.9999999999999999e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0537133 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1161  hypothetical protein  37.97 
 
 		 1902 aa  214  3e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.125794  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0251  outer membrane autotransporter  32.68 
 
 		 1359 aa  193  5e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0490823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2201  cable pili-associated 22 kDa adhesin protein  27.62 
 
 		 2911 aa  189  9e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.266239  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0529  hypothetical protein  26.13 
 
 		 4697 aa  186  1e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2063  type I secretion target repeat-containing protein  28.87 
 
 		 3204 aa  182  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3060  von Willebrand factor type A  30.02 
 
 		 4678 aa  166  7e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4328  cadherin domain-containing protein  51.02 
 
 		 2193 aa  153  6e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.859375  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2593  conserved repeat domain protein  25.65 
 
 		 3793 aa  151  3e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.073398 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3027  hypothetical protein  33 
 
 		 1278 aa  139  9.999999999999999e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0899  large repetitive protein  23.81 
 
 		 5080 aa  125  9.999999999999999e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4380  hypothetical protein  27.08 
 
 		 3923 aa  123  9e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0055  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  29.35 
 
 		 3314 aa  120  5e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40260  hypothetical protein  26.86 
 
 		 2456 aa  120  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.702086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0845  hypothetical protein  27.99 
 
 		 5451 aa  116  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1976  outer membrane protein  29.51 
 
 		 1196 aa  115  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.839593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3412  hypothetical protein  26.42 
 
 		 2625 aa  114  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  40.59 
 
 		 2839 aa  112  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4606  large repetitive protein  25.52 
 
 		 5559 aa  110  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5863  Cadherin  29.31 
 
 		 3227 aa  110  7e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.510613 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4512  large repetitive protein  25.42 
 
 		 5561 aa  109  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4605  putative Ig domain family protein  25.67 
 
 		 5561 aa  109  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4520  putative Ig domain protein  25.46 
 
 		 5561 aa  105  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0491  outer membrane adhesin like proteiin  26.95 
 
 		 7149 aa  105  3e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0830  glycoprotein  28.1 
 
 		 8064 aa  103  7e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.51381 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0806  surface adhesion protein, putative  27.11 
 
 		 6310 aa  100  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1677  hypothetical protein  28.95 
 
 		 2233 aa  101  4e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1601  hypothetical protein  29.81 
 
 		 6715 aa  100  6e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2195  hypothetical protein  40.31 
 
 		 1151 aa  98.2  3e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.175885  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6371  hypothetical protein  30.77 
 
 		 3736 aa  96.7  8e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1051  hypothetical protein  25.27 
 
 		 4430 aa  95.5  2e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4656  hypothetical protein  25.1 
 
 		 5559 aa  92.8  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3608  hypothetical protein  28.24 
 
 		 918 aa  90.5  6e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.886331  normal  0.889402 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3905  outer membrane adhesin like proteiin  25.72 
 
 		 6779 aa  85.9  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6074  hypothetical protein  30.1 
 
 		 3734 aa  85.1  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0378  outer membrane protein  32.88 
 
 		 860 aa  82.8  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.906993  normal  0.228365 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1952  hypothetical protein  46.43 
 
 		 1538 aa  82  0.0000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0131034  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0927  phosphoesterase, PA-phosphatase related  26.38 
 
 		 5216 aa  77.8  0.000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1919  hypothetical protein  31.99 
 
 		 1526 aa  74.3  0.00000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.369591  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3982  putative outer membrane adhesin like proteiin  25.82 
 
 		 6683 aa  74.3  0.00000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1029  hemolysin-type calcium-binding region  32.67 
 
 		 1529 aa  73.6  0.00000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.297534 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4098  outer membrane adhesin like proteiin  25.53 
 
 		 6662 aa  70.5  0.0000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3022  hypothetical protein  27.16 
 
 		 3586 aa  68.9  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3203  outer membrane protein  29.22 
 
 		 954 aa  65.9  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4272  hypothetical protein  30.61 
 
 		 852 aa  63.9  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.176048  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4317  RTX toxin, putative  29.13 
 
 		 2768 aa  63.2  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0783  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.04 
 
 		 3323 aa  63.2  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4144  hypothetical protein  30.94 
 
 		 781 aa  62.4  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.612931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3205  hypothetical protein  29.95 
 
 		 873 aa  60.1  0.0000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2451  Fibronectin type III domain protein  24.3 
 
 		 1219 aa  58.9  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4145  hypothetical protein  32.64 
 
 		 756 aa  58.5  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.686732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4987  outer membrane protein  27.72 
 
 		 763 aa  58.2  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3174  dystroglycan-type cadherin domain-containing protein  27.28 
 
 		 2715 aa  58.2  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2392  cell wall associated biofilm protein  24.54 
 
 		 2402 aa  57.8  0.000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4141  hypothetical protein  28.28 
 
 		 819 aa  57.8  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.166079  normal  0.580525 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4344  hypothetical protein  26.44 
 
 		 846 aa  56.6  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.000873034  normal  0.549716 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1690  hypothetical protein  21.72 
 
 		 2713 aa  55.5  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4342  outer membrane protein  27.88 
 
 		 790 aa  56.2  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.302573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1524  outer membrane protein  28.17 
 
 		 777 aa  55.5  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.312083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1854  hemolysin-type calcium-binding region  29.11 
 
 		 5171 aa  55.5  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000611986 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0581  PKD domain protein  28.27 
 
 		 1461 aa  55.1  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1978  outer membrane protein  28.34 
 
 		 770 aa  53.5  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.206942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0608  putative invasin  26.27 
 
 		 2795 aa  51.6  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1315  Ig domain-containing protein  27 
 
 		 1976 aa  50.4  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.454335  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0994  hypothetical protein  35.92 
 
 		 4874 aa  49.7  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1945  fibronectin type III domain-containing protein  32.71 
 
 		 1047 aa  50.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.771273  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3420  cellulase  33.73 
 
 		 635 aa  49.7  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.342079 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0993  Carbohydrate-binding family 9  31.29 
 
 		 2286 aa  47.8  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.938361  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0540  hypothetical protein  29.87 
 
 		 1061 aa  47.8  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5260  hypothetical protein  26.43 
 
 		 1879 aa  47.4  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2157  fibronectin, type III domain-containing protein  25.03 
 
 		 1141 aa  47.4  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.445714  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3561  Fibronectin type III domain protein  33.74 
 
 		 2178 aa  47.4  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1980  outer membrane protein  27.48 
 
 		 768 aa  47.4  0.007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0531  hypothetical protein  35.92 
 
 		 850 aa  47.4  0.007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.744468  normal  0.643161 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2987  Fibronectin type III domain protein  26.68 
 
 		 1301 aa  47  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0839301 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3323  hypothetical protein  30.59 
 
 		 3477 aa  47  0.01  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195201 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>