52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4342 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_4143  outer membrane protein  52.85 
 
 		 3864 aa  675    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4139  outer membrane protein  67.01 
 
 		 764 aa  922    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.609816  normal  0.559542 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2587  outer membrane protein  57.7 
 
 		 889 aa  643    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00407649 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4987  outer membrane protein  82.68 
 
 		 763 aa  1214    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1980  outer membrane protein  58.05 
 
 		 768 aa  767    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1978  outer membrane protein  58.28 
 
 		 770 aa  760    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.206942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1976  outer membrane protein  51.56 
 
 		 1196 aa  652    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.839593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4342  outer membrane protein  100 
 
 		 790 aa  1579    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.302573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4145  hypothetical protein  54.94 
 
 		 756 aa  700    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.686732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0378  outer membrane protein  56.75 
 
 		 860 aa  640    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.906993  normal  0.228365 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1130  hypothetical protein  54.55 
 
 		 768 aa  703    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.541884 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1357  outer membrane protein  52.93 
 
 		 4830 aa  674    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.381537 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1524  outer membrane protein  56.75 
 
 		 777 aa  768    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.312083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1974  hypothetical protein  50.19 
 
 		 7434 aa  616  1e-175  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3205  hypothetical protein  54.49 
 
 		 873 aa  612  1e-173  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4144  hypothetical protein  50.06 
 
 		 781 aa  602  1.0000000000000001e-171  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.612931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4141  hypothetical protein  48.56 
 
 		 819 aa  582  1e-164  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.166079  normal  0.580525 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2034  outer membrane protein  69.16 
 
 		 465 aa  570  1e-161  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.549347  normal  0.451307 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2038  outer membrane protein  63.64 
 
 		 479 aa  550  1e-155  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.476107 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4344  hypothetical protein  48.48 
 
 		 846 aa  470  1.0000000000000001e-131  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.000873034  normal  0.549716 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3608  hypothetical protein  51.34 
 
 		 918 aa  367  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.886331  normal  0.889402 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3203  outer membrane protein  78.43 
 
 		 954 aa  311  2.9999999999999997e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4997  outer membrane protein  49.24 
 
 		 4428 aa  285  3.0000000000000004e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4242  outer membrane protein  45.41 
 
 		 3340 aa  277  5e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3607  hypothetical protein  84.83 
 
 		 145 aa  258  4e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.615518  normal  0.658248 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4431  outer membrane protein  47.28 
 
 		 2796 aa  257  5e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.876357  normal  0.690174 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2861  outer membrane protein  47.51 
 
 		 1641 aa  252  2e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0160  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  37.01 
 
 		 2156 aa  191  5e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0675  Pyrrolo-quinoline quinone  36.11 
 
 		 3066 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895028 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4433  outer membrane protein  46.19 
 
 		 1099 aa  169  2e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.200125 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2037  hypothetical protein  39.34 
 
 		 308 aa  145  3e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.259898 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1919  hypothetical protein  33.7 
 
 		 1526 aa  140  1e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.369591  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4317  RTX toxin, putative  33.44 
 
 		 2768 aa  119  3e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0384  putative outer membrane adhesin like protein  34.6 
 
 		 5442 aa  105  4e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0529  hypothetical protein  29.77 
 
 		 4697 aa  82.8  0.00000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2847  cadherin domain-containing protein  30.23 
 
 		 1699 aa  80.5  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  34.48 
 
 		 2927 aa  77  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1161  hypothetical protein  31.23 
 
 		 1902 aa  70.9  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.125794  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2781  outer membrane autotransporter  31.46 
 
 		 2886 aa  67  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4328  cadherin domain-containing protein  33.88 
 
 		 2193 aa  63.2  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.859375  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0251  outer membrane autotransporter  27.17 
 
 		 1359 aa  58.2  0.0000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0490823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2848  hemagglutinin/hemolysin-related protein  27.88 
 
 		 4480 aa  56.2  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  28.89 
 
 		 2839 aa  56.6  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2696  outer membrane autotransporter  26.26 
 
 		 2194 aa  55.1  0.000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.533245 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4272  hypothetical protein  31.17 
 
 		 852 aa  53.9  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.176048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2273  FG-GAP repeat protein  36.27 
 
 		 1827 aa  51.2  0.00008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5863  Cadherin  28.18 
 
 		 3227 aa  50.8  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.510613 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000456  hypothetical protein  24.7 
 
 		 3470 aa  49.7  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2849  RTX toxin-like protein  31.87 
 
 		 1092 aa  47.8  0.0007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05624  hypothetical protein  27.04 
 
 		 3146 aa  45.1  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2345  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  28.63 
 
 		 1590 aa  45.1  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1733  hypothetical protein  29.35 
 
 		 746 aa  44.7  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.658961  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>