19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05624 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013457  VEA_000456  hypothetical protein  54.23 
 
 
3470 aa  3174    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05624  hypothetical protein  100 
 
 
3146 aa  6381    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0378  outer membrane protein  29.11 
 
 
860 aa  58.9  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.906993  normal  0.228365 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3203  outer membrane protein  28.3 
 
 
954 aa  58.9  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1974  hypothetical protein  27.04 
 
 
7434 aa  59.3  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1357  outer membrane protein  30.81 
 
 
4830 aa  58.2  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.381537 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3608  hypothetical protein  26.63 
 
 
918 aa  56.6  0.000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.886331  normal  0.889402 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4143  outer membrane protein  28.34 
 
 
3864 aa  55.1  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4141  hypothetical protein  28.97 
 
 
819 aa  53.1  0.00007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.166079  normal  0.580525 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3205  hypothetical protein  27.68 
 
 
873 aa  52.8  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4208  autotransporter adhesin  25.31 
 
 
3333 aa  52.8  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4344  hypothetical protein  23.1 
 
 
846 aa  50.8  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.000873034  normal  0.549716 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3152  hypothetical protein  26.05 
 
 
315 aa  49.7  0.0009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.918105  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0055  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  30.33 
 
 
3314 aa  49.7  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1976  outer membrane protein  27.6 
 
 
1196 aa  48.9  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.839593  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4987  outer membrane protein  27.33 
 
 
763 aa  47.4  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4145  hypothetical protein  27.78 
 
 
756 aa  46.2  0.01  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.686732  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0757  hypothetical protein  35.05 
 
 
386 aa  46.2  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00827619  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0768  hypothetical protein  35.05 
 
 
385 aa  46.2  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.855521  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>