55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4145 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_1974  hypothetical protein  64.92 
 
 
7434 aa  891    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4143  outer membrane protein  59.49 
 
 
3864 aa  808    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4141  hypothetical protein  66 
 
 
819 aa  919    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.166079  normal  0.580525 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4139  outer membrane protein  57.29 
 
 
764 aa  738    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.609816  normal  0.559542 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3205  hypothetical protein  81.94 
 
 
873 aa  1038    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2587  outer membrane protein  54 
 
 
889 aa  658    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00407649 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4144  hypothetical protein  74.65 
 
 
781 aa  1065    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.612931  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1980  outer membrane protein  52.18 
 
 
768 aa  659    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1978  outer membrane protein  52.84 
 
 
770 aa  664    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.206942  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1976  outer membrane protein  68.94 
 
 
1196 aa  953    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.839593  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1524  outer membrane protein  52.03 
 
 
777 aa  655    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.312083  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1357  outer membrane protein  60.1 
 
 
4830 aa  806    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.381537 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1130  hypothetical protein  80.49 
 
 
768 aa  1161    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.541884 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4145  hypothetical protein  100 
 
 
756 aa  1502    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.686732  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4342  outer membrane protein  55.19 
 
 
790 aa  726    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.302573  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0378  outer membrane protein  72.25 
 
 
860 aa  935    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.906993  normal  0.228365 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4987  outer membrane protein  49.87 
 
 
763 aa  593  1e-168  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3608  hypothetical protein  62.41 
 
 
918 aa  575  1.0000000000000001e-162  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.886331  normal  0.889402 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2034  outer membrane protein  63.42 
 
 
465 aa  502  1e-141  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.549347  normal  0.451307 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2038  outer membrane protein  53.88 
 
 
479 aa  431  1e-119  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.476107 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3203  outer membrane protein  52.3 
 
 
954 aa  424  1e-117  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4344  hypothetical protein  41.56 
 
 
846 aa  324  3e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.000873034  normal  0.549716 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4997  outer membrane protein  50.94 
 
 
4428 aa  286  1.0000000000000001e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4242  outer membrane protein  47.58 
 
 
3340 aa  278  3e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3607  hypothetical protein  88.97 
 
 
145 aa  271  2.9999999999999997e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.615518  normal  0.658248 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2861  outer membrane protein  50.7 
 
 
1641 aa  266  8.999999999999999e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4431  outer membrane protein  46.7 
 
 
2796 aa  262  1e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.876357  normal  0.690174 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0160  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  36.22 
 
 
2156 aa  198  3e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0675  Pyrrolo-quinoline quinone  36.81 
 
 
3066 aa  192  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00895028 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4433  outer membrane protein  47.14 
 
 
1099 aa  171  6e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.200125 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0384  putative outer membrane adhesin like protein  36.82 
 
 
5442 aa  148  3e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4317  RTX toxin, putative  33.72 
 
 
2768 aa  134  6.999999999999999e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1919  hypothetical protein  36.47 
 
 
1526 aa  131  4.0000000000000003e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.369591  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0529  hypothetical protein  36.46 
 
 
4697 aa  128  5e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2037  hypothetical protein  33.33 
 
 
308 aa  108  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.259898 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  33.21 
 
 
2839 aa  92.4  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2847  cadherin domain-containing protein  34.65 
 
 
1699 aa  90.5  9e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2195  hypothetical protein  38.16 
 
 
1151 aa  81.3  0.00000000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.175885  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4328  cadherin domain-containing protein  45.36 
 
 
2193 aa  73.2  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.859375  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2679  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  33.16 
 
 
1627 aa  67  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000064285 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2273  FG-GAP repeat protein  37.35 
 
 
1827 aa  67  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2781  outer membrane autotransporter  35.71 
 
 
2886 aa  66.6  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2848  hemagglutinin/hemolysin-related protein  32.21 
 
 
4480 aa  64.7  0.000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1161  hypothetical protein  37.07 
 
 
1902 aa  59.3  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.125794  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0251  outer membrane autotransporter  31.27 
 
 
1359 aa  57  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0490823  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2696  outer membrane autotransporter  30.41 
 
 
2194 aa  57.4  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.533245 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  33.6 
 
 
2927 aa  54.3  0.000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1733  hypothetical protein  27.75 
 
 
746 aa  48.9  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.658961  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1994  hypothetical protein  27.95 
 
 
1321 aa  47.8  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0311677  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4272  hypothetical protein  32.45 
 
 
852 aa  47.8  0.0009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.176048  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05624  hypothetical protein  27.47 
 
 
3146 aa  47.4  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  28.63 
 
 
3699 aa  47.4  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4189  Ig family protein  28.63 
 
 
2503 aa  47.4  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3060  von Willebrand factor type A  28.31 
 
 
4678 aa  47  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5863  Cadherin  28.7 
 
 
3227 aa  44.7  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.510613 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>