41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4997 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_4431  outer membrane protein  42.26 
 
 		 2796 aa  1379    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.876357  normal  0.690174 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4242  outer membrane protein  43.81 
 
 		 3340 aa  1621    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4997  outer membrane protein  100 
 
 		 4428 aa  8610    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2861  outer membrane protein  45.52 
 
 		 1641 aa  578  1.0000000000000001e-162  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4433  outer membrane protein  45.89 
 
 		 1099 aa  345  2e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.200125 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4145  hypothetical protein  51.89 
 
 		 756 aa  310  4.0000000000000004e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.686732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4342  outer membrane protein  50.15 
 
 		 790 aa  309  1.0000000000000001e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.302573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0378  outer membrane protein  52.38 
 
 		 860 aa  308  1.0000000000000001e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.906993  normal  0.228365 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1524  outer membrane protein  42.04 
 
 		 777 aa  309  1.0000000000000001e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.312083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1130  hypothetical protein  51.59 
 
 		 768 aa  306  8.000000000000001e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.541884 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4139  outer membrane protein  47.8 
 
 		 764 aa  300  4e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.609816  normal  0.559542 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1976  outer membrane protein  51.42 
 
 		 1196 aa  298  1e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.839593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1978  outer membrane protein  41.98 
 
 		 770 aa  287  3.0000000000000004e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.206942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1980  outer membrane protein  40.04 
 
 		 768 aa  284  3e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1974  hypothetical protein  49.85 
 
 		 7434 aa  277  4.0000000000000004e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3205  hypothetical protein  41.37 
 
 		 873 aa  275  2e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4143  outer membrane protein  48.76 
 
 		 3864 aa  271  2e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2034  outer membrane protein  41.54 
 
 		 465 aa  270  5.999999999999999e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.549347  normal  0.451307 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1357  outer membrane protein  48.35 
 
 		 4830 aa  267  4e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.381537 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4144  hypothetical protein  40.16 
 
 		 781 aa  265  1e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.612931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4141  hypothetical protein  42.59 
 
 		 819 aa  265  2e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.166079  normal  0.580525 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2587  outer membrane protein  49.55 
 
 		 889 aa  263  4e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00407649 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4987  outer membrane protein  49.23 
 
 		 763 aa  256  7e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3203  outer membrane protein  58.33 
 
 		 954 aa  218  1.9999999999999998e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2038  outer membrane protein  55 
 
 		 479 aa  199  9e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.476107 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3607  hypothetical protein  54.42 
 
 		 145 aa  171  2.9999999999999998e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.615518  normal  0.658248 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1051  hypothetical protein  27.57 
 
 		 4430 aa  127  5e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4344  hypothetical protein  37.05 
 
 		 846 aa  121  3e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.000873034  normal  0.549716 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3608  hypothetical protein  33.43 
 
 		 918 aa  105  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.886331  normal  0.889402 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1919  hypothetical protein  33.85 
 
 		 1526 aa  85.9  0.00000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.369591  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0830  glycoprotein  25.1 
 
 		 8064 aa  78.2  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.51381 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0675  Pyrrolo-quinoline quinone  30.86 
 
 		 3066 aa  63.2  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895028 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4380  hypothetical protein  26.18 
 
 		 3923 aa  54.7  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0845  hypothetical protein  25.41 
 
 		 5451 aa  54.3  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1733  hypothetical protein  27.78 
 
 		 746 aa  52.8  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.658961  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0806  surface adhesion protein, putative  26.09 
 
 		 6310 aa  53.1  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0160  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  30.67 
 
 		 2156 aa  52  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1750  5'-nucleotidase domain-containing protein  33.98 
 
 		 3977 aa  47.4  0.007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0406  alkaline phosphatase  28 
 
 		 2182 aa  47  0.008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1994  hypothetical protein  31.65 
 
 		 1321 aa  47  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0311677  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0754  fibronectin type III domain-containing protein  35.14 
 
 		 2192 aa  47  0.009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>