59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1976 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_1524  outer membrane protein  53.16 
 
 
777 aa  671    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.312083  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4143  outer membrane protein  60.31 
 
 
3864 aa  1264    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4141  hypothetical protein  61.19 
 
 
819 aa  825    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.166079  normal  0.580525 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4139  outer membrane protein  83.71 
 
 
764 aa  707    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.609816  normal  0.559542 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3608  hypothetical protein  80.82 
 
 
918 aa  1162    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.886331  normal  0.889402 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3205  hypothetical protein  58.71 
 
 
873 aa  846    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1976  outer membrane protein  100 
 
 
1196 aa  2369    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.839593  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1974  hypothetical protein  62.73 
 
 
7434 aa  1316    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1357  outer membrane protein  60.59 
 
 
4830 aa  1268    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.381537 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1130  hypothetical protein  66.29 
 
 
768 aa  914    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.541884 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0378  outer membrane protein  68.44 
 
 
860 aa  1090    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.906993  normal  0.228365 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4144  hypothetical protein  61.92 
 
 
781 aa  828    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.612931  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4342  outer membrane protein  51.69 
 
 
790 aa  658    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.302573  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4145  hypothetical protein  68.94 
 
 
756 aa  937    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.686732  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1978  outer membrane protein  51.27 
 
 
770 aa  635  1e-180  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.206942  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2587  outer membrane protein  49.69 
 
 
889 aa  627  1e-178  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00407649 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1980  outer membrane protein  48.69 
 
 
768 aa  607  9.999999999999999e-173  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4987  outer membrane protein  48.8 
 
 
763 aa  553  1e-156  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3203  outer membrane protein  50.73 
 
 
954 aa  526  1e-147  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2034  outer membrane protein  64.43 
 
 
465 aa  513  1e-144  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.549347  normal  0.451307 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0160  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  39.23 
 
 
2156 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2038  outer membrane protein  54.45 
 
 
479 aa  435  1e-120  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.476107 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0675  Pyrrolo-quinoline quinone  38.66 
 
 
3066 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00895028 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4344  hypothetical protein  61.71 
 
 
846 aa  379  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.000873034  normal  0.549716 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4997  outer membrane protein  51.42 
 
 
4428 aa  287  1.0000000000000001e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0384  putative outer membrane adhesin like protein  35.51 
 
 
5442 aa  277  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2861  outer membrane protein  50.83 
 
 
1641 aa  273  1e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3607  hypothetical protein  89.66 
 
 
145 aa  273  2e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.615518  normal  0.658248 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2037  hypothetical protein  54.61 
 
 
308 aa  267  1e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.259898 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4242  outer membrane protein  45.58 
 
 
3340 aa  263  2e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4431  outer membrane protein  45.91 
 
 
2796 aa  255  4.0000000000000004e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.876357  normal  0.690174 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1919  hypothetical protein  33.86 
 
 
1526 aa  206  2e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.369591  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0529  hypothetical protein  37.99 
 
 
4697 aa  194  1e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4317  RTX toxin, putative  31.33 
 
 
2768 aa  188  6e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4433  outer membrane protein  49.48 
 
 
1099 aa  169  2e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.200125 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2847  cadherin domain-containing protein  34.2 
 
 
1699 aa  159  4e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2781  outer membrane autotransporter  30.78 
 
 
2886 aa  122  4.9999999999999996e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2848  hemagglutinin/hemolysin-related protein  29.51 
 
 
4480 aa  115  6e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1161  hypothetical protein  30.47 
 
 
1902 aa  99.4  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.125794  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  31.83 
 
 
2839 aa  95.1  6e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3060  von Willebrand factor type A  27.44 
 
 
4678 aa  94  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2696  outer membrane autotransporter  27.57 
 
 
2194 aa  86.7  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.533245 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0251  outer membrane autotransporter  30.55 
 
 
1359 aa  86.3  0.000000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0490823  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2195  hypothetical protein  36.28 
 
 
1151 aa  83.2  0.00000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.175885  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  34.53 
 
 
2927 aa  78.6  0.0000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5863  Cadherin  29.47 
 
 
3227 aa  78.2  0.0000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.510613 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4272  hypothetical protein  31.25 
 
 
852 aa  73.2  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.176048  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4328  cadherin domain-containing protein  44.21 
 
 
2193 aa  68.6  0.0000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.859375  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4251  Ig family protein  28.53 
 
 
2802 aa  65.1  0.000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.676511 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2679  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  31.86 
 
 
1627 aa  62.4  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000064285 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2273  FG-GAP repeat protein  37.1 
 
 
1827 aa  61.6  0.00000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000456  hypothetical protein  24.07 
 
 
3470 aa  56.6  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0380  VCBS  39.13 
 
 
1586 aa  56.6  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.101859  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2849  RTX toxin-like protein  32.26 
 
 
1092 aa  53.5  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05624  hypothetical protein  27.6 
 
 
3146 aa  48.5  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1733  hypothetical protein  28.29 
 
 
746 aa  47.8  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.658961  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0994  hypothetical protein  26.91 
 
 
4874 aa  46.6  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2345  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  31.25 
 
 
1590 aa  46.2  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4189  Ig family protein  25.14 
 
 
2503 aa  44.7  0.01  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>