239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0529 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_0529  hypothetical protein  100 
 
 		 4697 aa  8890    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1357  outer membrane protein  24.72 
 
 		 4830 aa  363  3e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.381537 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4143  outer membrane protein  24.15 
 
 		 3864 aa  328  2e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0384  putative outer membrane adhesin like protein  25.65 
 
 		 5442 aa  306  8.000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1974  hypothetical protein  25.16 
 
 		 7434 aa  300  5e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0160  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.47 
 
 		 2156 aa  236  8.000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  47.93 
 
 		 2927 aa  220  4e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0675  Pyrrolo-quinoline quinone  26.26 
 
 		 3066 aa  218  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895028 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2848  hemagglutinin/hemolysin-related protein  26.58 
 
 		 4480 aa  218  1.9999999999999998e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1976  outer membrane protein  37.99 
 
 		 1196 aa  194  4e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.839593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3608  hypothetical protein  39.69 
 
 		 918 aa  174  3e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.886331  normal  0.889402 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4317  RTX toxin, putative  39.58 
 
 		 2768 aa  165  2e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  42.15 
 
 		 2839 aa  156  1e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0378  outer membrane protein  36.14 
 
 		 860 aa  137  3.9999999999999996e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.906993  normal  0.228365 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4141  hypothetical protein  34.67 
 
 		 819 aa  132  1.0000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.166079  normal  0.580525 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3203  outer membrane protein  33.65 
 
 		 954 aa  133  1.0000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4242  outer membrane protein  26.62 
 
 		 3340 aa  130  6e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2847  cadherin domain-containing protein  28.27 
 
 		 1699 aa  122  9.999999999999999e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4144  hypothetical protein  34.11 
 
 		 781 aa  122  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.612931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1919  hypothetical protein  35.7 
 
 		 1526 aa  118  3e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.369591  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4145  hypothetical protein  36.45 
 
 		 756 aa  117  4.0000000000000004e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.686732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1130  hypothetical protein  34.45 
 
 		 768 aa  116  8.000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.541884 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3205  hypothetical protein  35.14 
 
 		 873 aa  111  4e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1978  outer membrane protein  33.72 
 
 		 770 aa  110  7e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.206942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0364  subtilisin-like serine protease-like  37.14 
 
 		 692 aa  106  1e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.75506  normal  0.695654 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1161  hypothetical protein  33.39 
 
 		 1902 aa  103  9e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.125794  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1022  hypothetical protein  35.37 
 
 		 1933 aa  97.1  8e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1385  putative extracellular nuclease  34.11 
 
 		 751 aa  96.3  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.14292  normal  0.827149 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2195  hypothetical protein  40.3 
 
 		 1151 aa  93.6  8e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.175885  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2037  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.26 
 
 		 1372 aa  93.2  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.884942  normal  0.0586303 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1547  S-layer domain protein  23.75 
 
 		 3320 aa  91.7  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2587  outer membrane protein  35.06 
 
 		 889 aa  92  3e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00407649 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1980  outer membrane protein  33.8 
 
 		 768 aa  90.9  5e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0779  S-layer domain-containing protein  36.09 
 
 		 693 aa  90.1  8e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.725533  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  48.21 
 
 		 1838 aa  87  0.000000000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4139  outer membrane protein  32.36 
 
 		 764 aa  86.7  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.609816  normal  0.559542 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2372  5'-Nucleotidase domain protein  50 
 
 		 2796 aa  83.6  0.00000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.308667 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4342  outer membrane protein  29.77 
 
 		 790 aa  82.8  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.302573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4829  Animal heme peroxidase  26.65 
 
 		 2342 aa  82  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0108  Animal heme peroxidase  26.65 
 
 		 2342 aa  80.5  0.0000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4987  outer membrane protein  28.54 
 
 		 763 aa  78.6  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0251  outer membrane autotransporter  32.53 
 
 		 1359 aa  79  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0490823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1750  5'-nucleotidase domain-containing protein  40.35 
 
 		 3977 aa  79  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4344  hypothetical protein  32.72 
 
 		 846 aa  75.1  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.000873034  normal  0.549716 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2696  outer membrane autotransporter  35.48 
 
 		 2194 aa  75.5  0.00000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.533245 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  43.31 
 
 		 8871 aa  74.7  0.00000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1524  outer membrane protein  29.76 
 
 		 777 aa  74.3  0.00000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.312083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  26.47 
 
 		 3089 aa  73.9  0.00000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2781  outer membrane autotransporter  32.73 
 
 		 2886 aa  72.8  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3665  endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.74 
 
 		 1052 aa  71.2  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.27613 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2009  autotransporter-associated beta strand repeat protein  29.27 
 
 		 1806 aa  70.9  0.0000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.979207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1722  hypothetical protein  34.92 
 
 		 1013 aa  70.1  0.0000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.919333  n/a   
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2154  peptidase C11 clostripain  25.96 
 
 		 766 aa  69.3  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.372371  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1685  5'-Nucleotidase domain protein  39.85 
 
 		 2852 aa  68.9  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6992  hypothetical protein  38.6 
 
 		 1087 aa  68.6  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160611  normal  0.0433397 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1250  hypothetical protein  25.83 
 
 		 849 aa  68.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1235  hypothetical protein  34.75 
 
 		 2024 aa  65.9  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1026  C-type lectin  34.45 
 
 		 4379 aa  65.1  0.00000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1690  beta strand repeat-containing protein  28.46 
 
 		 1632 aa  64.3  0.00000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.638042 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0242  Ig-like, group 2  40.34 
 
 		 536 aa  62.4  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2108  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.4 
 
 		 995 aa  62  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.557195  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1242  VCBS  41.41 
 
 		 16311 aa  62  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.16 
 
 		 2678 aa  62  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3193  metalloprotease, putative  45.24 
 
 		 535 aa  61.2  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.839169  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  29.94 
 
 		 3209 aa  61.6  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2207  Alkaline phosphatase  33.61 
 
 		 1587 aa  61.6  0.0000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  29.23 
 
 		 2775 aa  61.6  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2424  glycoside hydrolase family protein  36.61 
 
 		 467 aa  61.2  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.443188 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4552  glycoside hydrolase family protein  36.43 
 
 		 686 aa  61.2  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.4064 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6263  hemolysin-type calcium-binding region  34.92 
 
 		 260 aa  60.5  0.0000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0113819 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1733  Ig family protein  31.11 
 
 		 395 aa  59.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4655  hemolysin-type calcium-binding region  36.61 
 
 		 375 aa  59.7  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12591  hypothetical protein  24.15 
 
 		 1214 aa  59.7  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1619  cadherin  36.84 
 
 		 1202 aa  58.9  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42147  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2165  glycoside hydrolase family protein  29.78 
 
 		 475 aa  58.9  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.669505  normal  0.045019 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  44.68 
 
 		 1236 aa  58.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0384  hypothetical protein  43.84 
 
 		 4285 aa  58.5  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1914  hypothetical protein  28.48 
 
 		 595 aa  58.5  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1944  hypothetical protein  31.11 
 
 		 621 aa  58.5  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.69459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001580  rTX toxin putative  39.13 
 
 		 2743 aa  58.2  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3011  LamG domain-containing protein  35.53 
 
 		 4761 aa  58.2  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.29 
 
 		 588 aa  57.8  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0760067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0513  hypothetical protein  29.89 
 
 		 475 aa  57.4  0.000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6876  Hemolysin-type calcium-binding region  34.38 
 
 		 547 aa  57.4  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  44.58 
 
 		 1883 aa  57  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3059  hemolysin-type calcium-binding region:peptidase M10A and M12B, matrixin and adamalysin  40.48 
 
 		 535 aa  56.6  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  44.68 
 
 		 2667 aa  56.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2273  FG-GAP repeat protein  33.08 
 
 		 1827 aa  56.2  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  39.6 
 
 		 1712 aa  56.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6850  Hemolysin-type calcium-binding region  49.32 
 
 		 565 aa  56.6  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1253  glycosyl transferase family 2  24.51 
 
 		 1067 aa  56.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1597  hypothetical protein  34.68 
 
 		 1289 aa  55.5  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1708  Hemolysin-type calcium-binding region  37.78 
 
 		 395 aa  55.5  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1294  polyhydroxyalkanoate synthesis repressor PhaR  40.96 
 
 		 8321 aa  55.8  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.359322 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4004  putative outer membrane adhesin like proteiin  44.87 
 
 		 2239 aa  55.8  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.328168  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1662  hemolysin-type calcium-binding region  34.75 
 
 		 260 aa  55.5  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  41.67 
 
 		 1019 aa  55.1  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0583  putative Ig  39.18 
 
 		 1055 aa  55.1  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0804  hemolysin-type calcium-binding region  43.62 
 
 		 2885 aa  55.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3353  heme peroxidase  33.95 
 
 		 3608 aa  55.1  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>