157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2679 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU2038  hypothetical protein  43.41 
 
 
1895 aa  689    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0987  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  45.31 
 
 
1669 aa  1261    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2679  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  100 
 
 
1627 aa  3310    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000064285 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2345  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  62.5 
 
 
1590 aa  2038    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2155  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  43.65 
 
 
1686 aa  1271    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1804  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  42.42 
 
 
1482 aa  955    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1536  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  39.04 
 
 
1568 aa  700    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2913  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  37.08 
 
 
1488 aa  625  1e-177  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0246207 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1370  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  37.31 
 
 
1299 aa  622  1e-176  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3425  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  26.98 
 
 
1288 aa  318  8e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1694  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  26.37 
 
 
1296 aa  302  4e-80  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0847615  decreased coverage  0.00494316 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1017  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  26.62 
 
 
1270 aa  278  6e-73  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000312457  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2557  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like  27.94 
 
 
1946 aa  236  3e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2558  1-deoxy-D-xylulose 5-phosphate reductoisomerase  25.79 
 
 
1714 aa  194  1e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.156102 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3432  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  28.42 
 
 
1281 aa  165  8.000000000000001e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3036  putative Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1  25.57 
 
 
1544 aa  136  3e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.583565  normal  0.438129 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0967  type IV pilin biogenesis protein, putative  24.62 
 
 
1030 aa  134  1.0000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1298  hypothetical protein  34.95 
 
 
651 aa  131  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.910785 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0737  type IV pilus assembly protein PilY1  27.55 
 
 
991 aa  129  3e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.465349  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2909  type IV fimbrial biogenesis protein PilY1  26.55 
 
 
1309 aa  124  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.940828 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2155  Tfp pilus assembly protein, tip-associated adhesin PilY1  26.58 
 
 
1581 aa  121  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.197712  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1066  hypothetical protein  27.15 
 
 
1014 aa  117  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.797091  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2483  hypothetical protein  36.44 
 
 
656 aa  117  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2518  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  24.28 
 
 
1245 aa  114  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2254  hypothetical protein  40.93 
 
 
663 aa  107  1e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.017887  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3909  hypothetical protein  35.02 
 
 
1838 aa  106  4e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2274  fimbrial assembly protein  25.65 
 
 
1470 aa  105  5e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.211915  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1914  hypothetical protein  37.96 
 
 
595 aa  103  3e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1382  PilY1 protein  24.07 
 
 
1254 aa  103  3e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.660708  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1703  fimbrial assembly protein  24.7 
 
 
1521 aa  102  9e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0874412  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1765  fimbrial assembly protein  24.7 
 
 
1521 aa  101  1e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.143841  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3225  putative type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  24.05 
 
 
1181 aa  100  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0779  S-layer domain-containing protein  38.81 
 
 
693 aa  99  6e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.725533  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3011  LamG domain-containing protein  28.98 
 
 
4761 aa  99  6e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1017  Ig-like, group 2  37.61 
 
 
486 aa  98.2  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2885  fimbrial assembly protein  25.19 
 
 
1493 aa  97.8  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.694358  normal  0.827989 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2743  cytoplasmic membrane protein  34.8 
 
 
352 aa  95.5  8e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000491523  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0815  type IV pilus-associated protein, putative  26.04 
 
 
1067 aa  89.7  5e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1318  hypothetical protein  36.55 
 
 
648 aa  88.2  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.181823  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0023  pilus tip-associated protein  23.89 
 
 
1214 aa  87.8  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.639019  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01324  PilY1  25.32 
 
 
1327 aa  88.2  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.338969  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0497  pilus tip-associated protein  23.94 
 
 
1225 aa  87.8  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0719  type IV pilus-associated protein, putative  25.28 
 
 
1069 aa  86.7  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.677662  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0561  PilY1 gene product  23.89 
 
 
1228 aa  86.3  0.000000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.762386  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0027  PilY1-like protein  23.89 
 
 
1215 aa  86.3  0.000000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1915  hypothetical protein  32.58 
 
 
482 aa  84.3  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0958  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  23.53 
 
 
1227 aa  84.3  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.327934 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0787  putative type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  24.24 
 
 
1223 aa  82.8  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2777  Kelch repeat-containing protein  36.62 
 
 
1762 aa  82.8  0.00000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1087  undecaprenol kinase., rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  22.49 
 
 
1223 aa  82.4  0.00000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.485932  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0334  hypothetical protein  31.68 
 
 
1026 aa  82  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0760219  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2668  Pyrrolo-quinoline quinone  24.96 
 
 
1200 aa  81.3  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.66041  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4843  type IV pilus-associated protein, putative  27.18 
 
 
1014 aa  79.7  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.930911  normal  0.847694 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3408  pilus tip-associated protein  25.13 
 
 
1273 aa  78.2  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0199627 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3103  type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  32.3 
 
 
1115 aa  74.7  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0232  antifreeze-related protein  42.98 
 
 
368 aa  74.3  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.420023  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0674  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  23.08 
 
 
1122 aa  73.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.920198 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0675  Pyrrolo-quinoline quinone  29.86 
 
 
3066 aa  73.6  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00895028 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0717  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  23.09 
 
 
1122 aa  72.8  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.441406  normal  0.313915 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0871  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like  24.68 
 
 
1056 aa  72  0.00000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1087  type IV pilin biogenesis protein, putative  21.16 
 
 
1223 aa  72  0.00000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0346  hypothetical protein  30.15 
 
 
635 aa  71.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1009  type IV pilin biogenesis protein, putative  27.34 
 
 
1148 aa  71.6  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0364  subtilisin-like serine protease-like  33.77 
 
 
692 aa  70.9  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.75506  normal  0.695654 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1300  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  28.83 
 
 
2002 aa  70.9  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.64211  normal  0.760951 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1974  hypothetical protein  32.16 
 
 
7434 aa  70.1  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2190  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  28.1 
 
 
2002 aa  70.5  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.753636 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5194  type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  23.04 
 
 
1155 aa  70.5  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.948738  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0160  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  28.67 
 
 
2156 aa  69.7  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5197  FG-GAP repeat-containing protein  30.4 
 
 
1182 aa  69.7  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.578151  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1153  type IV pilin biogenesis protein, putative  21.93 
 
 
1223 aa  66.6  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.591357 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3149  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  33.85 
 
 
1717 aa  67  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.308905 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0242  Ig-like, group 2  44.34 
 
 
536 aa  65.9  0.000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0661  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  26.82 
 
 
1723 aa  65.9  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0627  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like  26.05 
 
 
1722 aa  65.5  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0661  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  26.82 
 
 
1722 aa  65.5  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0120  S-layer domain protein  35.04 
 
 
767 aa  65.5  0.000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0243  hypothetical protein  36.67 
 
 
685 aa  65.1  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1357  outer membrane protein  28.69 
 
 
4830 aa  63.9  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.381537 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1066  type IV pilin biogenesis protein, putative  24.15 
 
 
1165 aa  64.3  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1756  Fibronectin type III domain protein  35.59 
 
 
2135 aa  63.5  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.527885 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0665  hypothetical protein  25.15 
 
 
1169 aa  63.5  0.00000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4143  outer membrane protein  28.69 
 
 
3864 aa  63.9  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0210  Neisseria PilC domain protein  23.58 
 
 
1174 aa  63.2  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0317884 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0682  hypothetical protein  23.31 
 
 
1169 aa  62.8  0.00000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3825  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  33.6 
 
 
1658 aa  63.2  0.00000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0358491  normal  0.103915 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0724  putative type-4 fimbrial biogenesis pily1-related signal peptide protein  24.73 
 
 
1323 aa  62.8  0.00000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.542451  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0378  outer membrane protein  33.33 
 
 
860 aa  62.4  0.00000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.906993  normal  0.228365 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3205  hypothetical protein  32.99 
 
 
873 aa  62.8  0.00000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4144  hypothetical protein  33.7 
 
 
781 aa  62  0.00000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.612931  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60310  type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  25.16 
 
 
1158 aa  61.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000469014 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0504  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  34.4 
 
 
1676 aa  62  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1976  outer membrane protein  31.86 
 
 
1196 aa  61.6  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.839593  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1073  Pyrrolo-quinoline quinone  25.45 
 
 
1378 aa  60.5  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.321275  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1700  Pyrrolo-quinoline quinone  25.45 
 
 
1378 aa  60.5  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2825  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  26.24 
 
 
1517 aa  60.5  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.12879 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8496  hypothetical protein  41.03 
 
 
1282 aa  60.1  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.200313  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4029  hypothetical protein  36.92 
 
 
824 aa  59.7  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0283808  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1106  type IV pilin biogenesis protein, putative  26.33 
 
 
1182 aa  59.3  0.0000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.332365  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2870  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  28.4 
 
 
2191 aa  59.3  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>