54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0378 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_1974  hypothetical protein  66.07 
 
 
7434 aa  1030    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4144  hypothetical protein  67.01 
 
 
781 aa  803    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.612931  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4143  outer membrane protein  60.88 
 
 
3864 aa  934    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4141  hypothetical protein  64.66 
 
 
819 aa  777    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.166079  normal  0.580525 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3608  hypothetical protein  70.46 
 
 
918 aa  703    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.886331  normal  0.889402 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3205  hypothetical protein  57.1 
 
 
873 aa  835    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4145  hypothetical protein  67.27 
 
 
756 aa  917    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.686732  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1976  outer membrane protein  68.71 
 
 
1196 aa  1082    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.839593  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1524  outer membrane protein  50.82 
 
 
777 aa  644    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.312083  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1357  outer membrane protein  61.2 
 
 
4830 aa  939    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.381537 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1130  hypothetical protein  73.26 
 
 
768 aa  920    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.541884 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0378  outer membrane protein  100 
 
 
860 aa  1712    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.906993  normal  0.228365 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4342  outer membrane protein  50.5 
 
 
790 aa  644    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.302573  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4139  outer membrane protein  54.62 
 
 
764 aa  630  1e-179  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.609816  normal  0.559542 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3203  outer membrane protein  55.11 
 
 
954 aa  617  1e-175  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2587  outer membrane protein  45.25 
 
 
889 aa  590  1e-167  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00407649 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1978  outer membrane protein  53.37 
 
 
770 aa  575  1.0000000000000001e-162  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.206942  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1980  outer membrane protein  46.41 
 
 
768 aa  550  1e-155  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4987  outer membrane protein  47.89 
 
 
763 aa  541  9.999999999999999e-153  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2034  outer membrane protein  61.66 
 
 
465 aa  494  9.999999999999999e-139  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.549347  normal  0.451307 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4997  outer membrane protein  52.06 
 
 
4428 aa  286  1.0000000000000001e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2038  outer membrane protein  74.75 
 
 
479 aa  285  3.0000000000000004e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.476107 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2861  outer membrane protein  52.1 
 
 
1641 aa  283  1e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4344  hypothetical protein  44.19 
 
 
846 aa  282  2e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.000873034  normal  0.549716 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4242  outer membrane protein  47.78 
 
 
3340 aa  281  5e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4431  outer membrane protein  48.18 
 
 
2796 aa  280  7e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.876357  normal  0.690174 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3607  hypothetical protein  91.03 
 
 
145 aa  280  1e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.615518  normal  0.658248 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0160  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  37.92 
 
 
2156 aa  259  2e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0675  Pyrrolo-quinoline quinone  35.55 
 
 
3066 aa  245  3e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00895028 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0384  putative outer membrane adhesin like protein  37.08 
 
 
5442 aa  182  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4433  outer membrane protein  48.44 
 
 
1099 aa  165  3e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.200125 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1919  hypothetical protein  35.63 
 
 
1526 aa  157  8e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.369591  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0529  hypothetical protein  36.31 
 
 
4697 aa  139  2e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4317  RTX toxin, putative  37.17 
 
 
2768 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2847  cadherin domain-containing protein  35.5 
 
 
1699 aa  103  1e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2037  hypothetical protein  37.81 
 
 
308 aa  100  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.259898 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  34.44 
 
 
2839 aa  88.6  5e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2781  outer membrane autotransporter  32.77 
 
 
2886 aa  86.7  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2848  hemagglutinin/hemolysin-related protein  33.56 
 
 
4480 aa  85.1  0.000000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0251  outer membrane autotransporter  31.57 
 
 
1359 aa  79.3  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0490823  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2195  hypothetical protein  33.21 
 
 
1151 aa  76.6  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.175885  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2696  outer membrane autotransporter  30.38 
 
 
2194 aa  72.4  0.00000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.533245 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4328  cadherin domain-containing protein  33.91 
 
 
2193 aa  66.6  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.859375  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2273  FG-GAP repeat protein  38.53 
 
 
1827 aa  64.7  0.000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2679  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  33.33 
 
 
1627 aa  63.2  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000064285 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05624  hypothetical protein  29.11 
 
 
3146 aa  59.3  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1161  hypothetical protein  30.54 
 
 
1902 aa  58.5  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.125794  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  37.21 
 
 
2927 aa  58.2  0.0000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3060  von Willebrand factor type A  28.78 
 
 
4678 aa  54.7  0.000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4272  hypothetical protein  29.81 
 
 
852 aa  52  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.176048  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0779  S-layer domain-containing protein  33.33 
 
 
693 aa  51.6  0.00006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.725533  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2849  RTX toxin-like protein  31.47 
 
 
1092 aa  48.9  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1733  hypothetical protein  24.74 
 
 
746 aa  45.4  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.658961  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5863  Cadherin  26.86 
 
 
3227 aa  45.1  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.510613 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>