50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4242 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_4242  outer membrane protein  100 
 
 		 3340 aa  6412    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4997  outer membrane protein  43.75 
 
 		 4428 aa  1599    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2861  outer membrane protein  43.81 
 
 		 1641 aa  684    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4431  outer membrane protein  75.82 
 
 		 2796 aa  3628    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.876357  normal  0.690174 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0378  outer membrane protein  47.78 
 
 		 860 aa  280  3e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.906993  normal  0.228365 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1130  hypothetical protein  47.85 
 
 		 768 aa  279  6e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.541884 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4139  outer membrane protein  49.4 
 
 		 764 aa  278  9e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.609816  normal  0.559542 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4342  outer membrane protein  45.41 
 
 		 790 aa  277  2.0000000000000002e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.302573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4145  hypothetical protein  47.58 
 
 		 756 aa  277  3e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.686732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1524  outer membrane protein  48.82 
 
 		 777 aa  273  5.9999999999999995e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.312083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4433  outer membrane protein  39.9 
 
 		 1099 aa  272  7e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.200125 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4143  outer membrane protein  48.71 
 
 		 3864 aa  272  8e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1978  outer membrane protein  44.02 
 
 		 770 aa  265  8.999999999999999e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.206942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1357  outer membrane protein  47.43 
 
 		 4830 aa  265  2e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.381537 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3205  hypothetical protein  46.76 
 
 		 873 aa  262  8e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1980  outer membrane protein  43.78 
 
 		 768 aa  259  6e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1974  hypothetical protein  44.9 
 
 		 7434 aa  258  1.0000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1976  outer membrane protein  45.15 
 
 		 1196 aa  258  2.0000000000000002e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.839593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4141  hypothetical protein  45.51 
 
 		 819 aa  254  1e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.166079  normal  0.580525 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4144  hypothetical protein  43.72 
 
 		 781 aa  254  3e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.612931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2587  outer membrane protein  45.85 
 
 		 889 aa  253  5e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00407649 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4987  outer membrane protein  47.48 
 
 		 763 aa  250  4e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3608  hypothetical protein  37.15 
 
 		 918 aa  233  6e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.886331  normal  0.889402 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2034  outer membrane protein  41.94 
 
 		 465 aa  221  2e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.549347  normal  0.451307 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3203  outer membrane protein  53.11 
 
 		 954 aa  214  2e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0160  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  39.36 
 
 		 2156 aa  207  3e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2038  outer membrane protein  61.69 
 
 		 479 aa  199  1e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.476107 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3607  hypothetical protein  60.69 
 
 		 145 aa  190  3e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.615518  normal  0.658248 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0675  Pyrrolo-quinoline quinone  37.01 
 
 		 3066 aa  179  9e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895028 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4344  hypothetical protein  34 
 
 		 846 aa  142  1e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.000873034  normal  0.549716 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0384  putative outer membrane adhesin like protein  34.47 
 
 		 5442 aa  134  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1919  hypothetical protein  32.43 
 
 		 1526 aa  129  1e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.369591  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1026  hypothetical protein  24.5 
 
 		 3516 aa  119  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.301497 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0529  hypothetical protein  26.57 
 
 		 4697 aa  103  7e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2847  cadherin domain-containing protein  25.04 
 
 		 1699 aa  96.7  8e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  36.4 
 
 		 2839 aa  87.8  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4317  RTX toxin, putative  37.14 
 
 		 2768 aa  71.2  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2273  FG-GAP repeat protein  43.59 
 
 		 1827 aa  68.6  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2195  hypothetical protein  36.57 
 
 		 1151 aa  67  0.000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.175885  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0845  hypothetical protein  30.75 
 
 		 5451 aa  65.1  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0806  surface adhesion protein, putative  30.68 
 
 		 6310 aa  65.1  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0830  glycoprotein  30.15 
 
 		 8064 aa  63.2  0.00000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.51381 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2781  outer membrane autotransporter  25.19 
 
 		 2886 aa  62  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5057  hypothetical protein  23.99 
 
 		 3378 aa  57.4  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2037  hypothetical protein  28 
 
 		 308 aa  56.2  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.259898 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4272  hypothetical protein  29.38 
 
 		 852 aa  52.8  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.176048  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4328  cadherin domain-containing protein  43.01 
 
 		 2193 aa  52.8  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.859375  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1161  hypothetical protein  26.42 
 
 		 1902 aa  52  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.125794  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0251  outer membrane autotransporter  29.63 
 
 		 1359 aa  49.3  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0490823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  36.51 
 
 		 2927 aa  46.6  0.009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.761605 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>