55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0251 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2781  outer membrane autotransporter  38.81 
 
 		 2886 aa  650    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2696  outer membrane autotransporter  45.7 
 
 		 2194 aa  903    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.533245 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0251  outer membrane autotransporter  100 
 
 		 1359 aa  2661    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0490823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1161  hypothetical protein  41.32 
 
 		 1902 aa  276  2.0000000000000002e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.125794  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2847  cadherin domain-containing protein  35.67 
 
 		 1699 aa  232  4e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2848  hemagglutinin/hemolysin-related protein  32.84 
 
 		 4480 aa  204  9.999999999999999e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3285  Outer membrane autotransporter barrel  30.71 
 
 		 1895 aa  166  3e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.761058 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0384  putative outer membrane adhesin like protein  36.23 
 
 		 5442 aa  154  1e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0160  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  33.86 
 
 		 2156 aa  136  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5863  Cadherin  35.71 
 
 		 3227 aa  134  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.510613 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0675  Pyrrolo-quinoline quinone  34.9 
 
 		 3066 aa  130  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895028 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1677  hypothetical protein  30.87 
 
 		 2233 aa  123  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1974  hypothetical protein  31.4 
 
 		 7434 aa  122  3e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1357  outer membrane protein  31.36 
 
 		 4830 aa  122  6e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.381537 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4143  outer membrane protein  31.19 
 
 		 3864 aa  116  3e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4272  hypothetical protein  35.55 
 
 		 852 aa  112  5e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.176048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1588  Outer membrane autotransporter barrel  24.8 
 
 		 1184 aa  105  7e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.635077 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4317  RTX toxin, putative  31.34 
 
 		 2768 aa  102  4e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3608  hypothetical protein  31.16 
 
 		 918 aa  101  8e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.886331  normal  0.889402 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5260  hypothetical protein  26.3 
 
 		 1879 aa  98.6  7e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1672  beta strand repeat-containing protein  46.3 
 
 		 3391 aa  93.6  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848841 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  41.2 
 
 		 2839 aa  92.8  4e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2849  RTX toxin-like protein  37.22 
 
 		 1092 aa  91.3  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1976  outer membrane protein  30.62 
 
 		 1196 aa  86.7  0.000000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.839593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0529  hypothetical protein  32.6 
 
 		 4697 aa  83.2  0.00000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1919  hypothetical protein  33.24 
 
 		 1526 aa  79  0.0000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.369591  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2195  hypothetical protein  37.19 
 
 		 1151 aa  79  0.0000000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.175885  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3203  outer membrane protein  31.18 
 
 		 954 aa  77  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0378  outer membrane protein  32.05 
 
 		 860 aa  76.6  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.906993  normal  0.228365 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01455  cell wall associated biofilm protein  31.41 
 
 		 3089 aa  75.5  0.000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4141  hypothetical protein  35.24 
 
 		 819 aa  68.6  0.0000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.166079  normal  0.580525 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4344  hypothetical protein  28.47 
 
 		 846 aa  67.8  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.000873034  normal  0.549716 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1799  hypothetical protein  32.54 
 
 		 562 aa  65.9  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4144  hypothetical protein  32.55 
 
 		 781 aa  64.3  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.612931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4342  outer membrane protein  27.63 
 
 		 790 aa  63.5  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.302573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1130  hypothetical protein  33.64 
 
 		 768 aa  62.4  0.00000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.541884 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3205  hypothetical protein  30.95 
 
 		 873 aa  60.8  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4139  outer membrane protein  30.65 
 
 		 764 aa  60.8  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.609816  normal  0.559542 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4113  hypothetical protein  34.01 
 
 		 3562 aa  59.7  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0537133 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4987  outer membrane protein  28.8 
 
 		 763 aa  57.8  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1524  outer membrane protein  29.1 
 
 		 777 aa  57.8  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.312083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1980  outer membrane protein  29.06 
 
 		 768 aa  57.4  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2587  outer membrane protein  25.63 
 
 		 889 aa  53.5  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00407649 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1978  outer membrane protein  28.82 
 
 		 770 aa  53.5  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.206942  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0189  fibronectin type III domain-containing protein  45 
 
 		 2522 aa  52.4  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2273  FG-GAP repeat protein  29.1 
 
 		 1827 aa  51.2  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1945  fibronectin type III domain-containing protein  28.39 
 
 		 1047 aa  49.7  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.771273  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4242  outer membrane protein  29.63 
 
 		 3340 aa  49.7  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0068  fibronectin, type III domain-containing protein  26.67 
 
 		 1695 aa  49.3  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4145  hypothetical protein  32.2 
 
 		 756 aa  49.3  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.686732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0380  VCBS  36 
 
 		 1586 aa  48.5  0.0009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.101859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3003  Outer membrane autotransporter barrel  23.89 
 
 		 1695 aa  48.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.277946 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4251  Ig family protein  29.18 
 
 		 2802 aa  46.6  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.676511 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3786  outer membrane autotransporter  20.75 
 
 		 573 aa  45.8  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.968521 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2451  Fibronectin type III domain protein  28.33 
 
 		 1219 aa  45.4  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>