9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3786 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_3786  outer membrane autotransporter  100 
 
 		 573 aa  1152    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.968521 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3285  Outer membrane autotransporter barrel  22.01 
 
 		 1895 aa  61.2  0.00000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.761058 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5260  hypothetical protein  29.41 
 
 		 1879 aa  52.4  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2696  outer membrane autotransporter  24.76 
 
 		 2194 aa  50.8  0.00007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.533245 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3478  autotransporter beta-domain-containing protein  25.23 
 
 		 321 aa  49.7  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000213958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3764  putative esterase/lipase/outer membrane autotransporter  26.38 
 
 		 723 aa  50.1  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.216349  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2063  pathogenicity protein, putative  28.35 
 
 		 630 aa  48.5  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2781  outer membrane autotransporter  21.74 
 
 		 2886 aa  47.4  0.0007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0251  outer membrane autotransporter  20.75 
 
 		 1359 aa  45.8  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0490823  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>