24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3285 on replicon NC_008043
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008043  TM1040_3285  Outer membrane autotransporter barrel  100 
 
 		 1895 aa  3656    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.761058 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2696  outer membrane autotransporter  30.52 
 
 		 2194 aa  169  2.9999999999999998e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.533245 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0251  outer membrane autotransporter  30.71 
 
 		 1359 aa  166  3e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0490823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2781  outer membrane autotransporter  29.56 
 
 		 2886 aa  165  7e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1588  Outer membrane autotransporter barrel  32.03 
 
 		 1184 aa  122  4.9999999999999996e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.635077 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1075  beta-glycosidase-like protein  27.59 
 
 		 2690 aa  96.3  5e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.243053 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0749  conserved repeat domain-containing protein  39.46 
 
 		 1129 aa  93.6  3e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5260  hypothetical protein  28.46 
 
 		 1879 aa  91.3  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3003  Outer membrane autotransporter barrel  27.64 
 
 		 1695 aa  79  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.277946 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1640  polymorphic outer membrane protein  46.73 
 
 		 767 aa  68.6  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5456  hypothetical protein  30.9 
 
 		 672 aa  65.9  0.000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0343  hypothetical protein  29.52 
 
 		 1802 aa  63.9  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.691393 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2841  polymorphic outer membrane protein  42.99 
 
 		 759 aa  62.4  0.00000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3786  outer membrane autotransporter  22.01 
 
 		 573 aa  60.1  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.968521 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1892  hypothetical protein  31.5 
 
 		 577 aa  60.1  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0353065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1677  hypothetical protein  36.09 
 
 		 2233 aa  57  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4990  Ig domain-containing protein  42.98 
 
 		 1532 aa  54.7  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5514  hypothetical protein  47.3 
 
 		 1504 aa  53.9  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0756  polymorphic outer membrane protein  40.16 
 
 		 2042 aa  51.2  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.442384  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0045  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  36.44 
 
 		 1468 aa  48.5  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.292772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3640  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.15 
 
 		 1673 aa  47.8  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0632  outer membrane adhesin like proteiin  26.47 
 
 		 7233 aa  47.8  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0115  putative hemagglutinin-related protein  26.11 
 
 		 1672 aa  47.4  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1924  FG-GAP repeat protein  27.95 
 
 		 1029 aa  46.6  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>