86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1640 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1640  polymorphic outer membrane protein  100 
 
 		 767 aa  1523    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2841  polymorphic outer membrane protein  73.39 
 
 		 759 aa  1079    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4292  Cna B domain-containing protein  43.48 
 
 		 2890 aa  137  9e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.339674 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0292  Cna B domain protein  43.83 
 
 		 2112 aa  101  4e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2393  polymorphic outer membrane protein  30.27 
 
 		 659 aa  100  9e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0754  fibronectin type III domain-containing protein  31.31 
 
 		 2192 aa  98.2  5e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0540  hypothetical protein  29.22 
 
 		 1061 aa  95.5  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3086  polymorphic outer membrane protein  29.44 
 
 		 665 aa  90.5  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0756  polymorphic outer membrane protein  37.36 
 
 		 2042 aa  89.4  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.442384  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1997  Hemolysin-type calcium-binding region  40.32 
 
 		 786 aa  89.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.177214 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0859  OmpA/MotB domain protein  29.7 
 
 		 913 aa  87  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.181215 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2348  hypothetical protein  28.81 
 
 		 545 aa  84.3  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3634  polymorphic outer membrane protein  30.81 
 
 		 655 aa  79.3  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2246  hypothetical protein  30.27 
 
 		 591 aa  78.6  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.105015  normal  0.0180285 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4920  hypothetical protein  32.44 
 
 		 468 aa  77.8  0.0000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0390615  normal  0.0715167 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0033  hypothetical protein  27.82 
 
 		 591 aa  77  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3132  polymorphic membrane protein  30.48 
 
 		 546 aa  77  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4856  hypothetical protein  36.24 
 
 		 1315 aa  75.5  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.212334  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3399  polymorphic outer membrane protein  30.47 
 
 		 483 aa  74.3  0.000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1229  hypothetical protein  31.13 
 
 		 481 aa  73.2  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0257494  normal  0.865842 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1998  Hemolysin-type calcium-binding region  40.58 
 
 		 817 aa  72.8  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0671214 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1075  beta-glycosidase-like protein  42.52 
 
 		 2690 aa  71.2  0.00000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.243053 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2988  polymorphic outer membrane protein  29.3 
 
 		 575 aa  71.2  0.00000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0583035  hitchhiker  0.000382857 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3043  hypothetical protein  28.25 
 
 		 464 aa  70.9  0.00000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4430  polymorphic outer membrane protein  28.53 
 
 		 465 aa  70.9  0.00000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3329  polymorphic outer membrane protein  28.68 
 
 		 558 aa  70.5  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000300518 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2509  hypothetical protein  29.38 
 
 		 476 aa  69.7  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.16291  normal  0.0412393 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2405  hypothetical protein  25.21 
 
 		 601 aa  69.7  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000140285  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3707  polymorphic outer membrane protein  26.05 
 
 		 518 aa  67.8  0.0000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000878669  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2283  polymorphic outer membrane protein  31.9 
 
 		 575 aa  67.8  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3406  parallel beta-helix repeat-containing protein  31.64 
 
 		 479 aa  67  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.525217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2897  polymorphic outer membrane protein  28.35 
 
 		 459 aa  67  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.966498  normal  0.981249 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0320  polymorphic membrane protein  30.06 
 
 		 361 aa  67.4  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.960666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0244  hypothetical protein  31.74 
 
 		 647 aa  66.6  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.601423  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2156  polymorphic outer membrane protein  32.54 
 
 		 526 aa  67.4  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.927153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3408  polymorphic outer membrane protein  29.04 
 
 		 461 aa  66.2  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0376  hypothetical protein  61.67 
 
 		 870 aa  65.9  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2593  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  29.84 
 
 		 1197 aa  65.1  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0238559  normal  0.0624657 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3285  Outer membrane autotransporter barrel  43.93 
 
 		 1895 aa  64.7  0.000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.761058 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2511  polymorphic membrane protein  25.62 
 
 		 477 aa  64.7  0.000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.238754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4951  hypothetical protein  31.79 
 
 		 3394 aa  63.5  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2726  polymorphic outer membrane protein  27.7 
 
 		 593 aa  63.2  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0479266  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3646  polymorphic outer membrane protein  28.88 
 
 		 509 aa  62.8  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.749989  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2695  polymorphic membrane protein  25.19 
 
 		 483 aa  61.6  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0661586  hitchhiker  0.000503026 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10338  probable extracellular nuclease  33.33 
 
 		 2160 aa  61.6  0.00000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1619  hypothetical protein  28.25 
 
 		 454 aa  61.6  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.892418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5974  cysteine-rich repeat protein  29.18 
 
 		 731 aa  61.6  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.681553 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2803  polymorphic outer membrane protein  30.53 
 
 		 527 aa  60.8  0.00000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.850053  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4725  polymorphic membrane protein  33.33 
 
 		 1037 aa  60.8  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.708929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4376  parallel beta-helix repeat-containing protein  30.18 
 
 		 464 aa  59.3  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.632591  decreased coverage  0.0000519323 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3990  hypothetical protein  30.15 
 
 		 439 aa  57.4  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4374  polymorphic outer membrane protein  27.64 
 
 		 459 aa  57.4  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000585185 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1615  hypothetical protein  31.75 
 
 		 452 aa  56.2  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3407  hypothetical protein  28.61 
 
 		 454 aa  56.6  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3191  hypothetical protein  27.7 
 
 		 593 aa  56.2  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000124226  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3992  hypothetical protein  31.19 
 
 		 457 aa  56.2  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.688493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2314  polymorphic outer membrane protein  30.83 
 
 		 541 aa  56.6  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2401  polymorphic outer membrane protein  38.41 
 
 		 362 aa  55.8  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3987  hypothetical protein  30.4 
 
 		 467 aa  55.1  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3059  hypothetical protein  26.56 
 
 		 523 aa  55.1  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.938529  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3647  hypothetical protein  27.06 
 
 		 464 aa  55.1  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.279677  hitchhiker  0.00645734 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4272  hypothetical protein  28.64 
 
 		 852 aa  54.7  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.176048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2358  hypothetical protein  28.51 
 
 		 477 aa  54.3  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.640506  normal  0.200266 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2258  hypothetical protein  26.65 
 
 		 530 aa  54.3  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2874  polymorphic outer membrane protein  28.76 
 
 		 412 aa  53.9  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.234984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4370  polymorphic outer membrane protein  30.13 
 
 		 450 aa  53.9  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293469 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3367  adhesin  34.56 
 
 		 1234 aa  53.5  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1610  polymorphic outer membrane protein  31.12 
 
 		 433 aa  52.8  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00898059 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1020  hypothetical protein  29.52 
 
 		 435 aa  52.4  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0321  hypothetical protein  31.58 
 
 		 457 aa  52.4  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.584072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1127  hypothetical protein  29.88 
 
 		 461 aa  52  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.5274  normal  0.895772 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4397  hypothetical protein  27 
 
 		 454 aa  50.8  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.792915  normal  0.0309659 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2781  outer membrane autotransporter  38.55 
 
 		 2886 aa  49.7  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3415  hypothetical protein  27.27 
 
 		 455 aa  49.3  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.253351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2873  polymorphic outer membrane protein  30.5 
 
 		 717 aa  48.5  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.406525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1626  hypothetical protein  30.36 
 
 		 489 aa  48.1  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.38383  normal  0.636637 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4998  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  35.15 
 
 		 1800 aa  47.8  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.329522  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1120  polymorphic outer membrane protein  27.05 
 
 		 441 aa  47  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00052776 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2450  APHP  30.87 
 
 		 1619 aa  46.6  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.804574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2253  polymorphic outer membrane protein  26.85 
 
 		 572 aa  45.8  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0130989  normal  0.262802 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1617  polymorphic membrane protein  28.99 
 
 		 505 aa  45.4  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.926452  normal  0.174352 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0210  hypothetical protein  24.17 
 
 		 460 aa  45.1  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1921  hypothetical protein  28.38 
 
 		 350 aa  45.4  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.884061  normal  0.370126 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1297  hypothetical protein  25.65 
 
 		 432 aa  45.4  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.442891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2618  polymorphic outer membrane protein  30.95 
 
 		 863 aa  44.7  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1787  polymorphic outer membrane protein  28.57 
 
 		 1332 aa  44.3  0.01  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>