47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4856 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_4856  hypothetical protein  100 
 
 		 1315 aa  2618    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.212334  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4998  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  33.82 
 
 		 1800 aa  211  6e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.329522  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1240  parallel beta-helix repeat-containing protein  31.35 
 
 		 717 aa  118  7.999999999999999e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.516491 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3220  hypothetical protein  34.88 
 
 		 1980 aa  107  1e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.782341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0786  parallel beta-helix repeat-containing protein  34.51 
 
 		 711 aa  100  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0899698 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3733  hypothetical protein  30.75 
 
 		 1439 aa  99  5e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00226773 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3244  parallel beta-helix repeat-containing protein  32.74 
 
 		 1829 aa  98.6  6e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.443436  normal  0.888185 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3732  parallel beta-helix repeat-containing protein  34.91 
 
 		 1822 aa  94.7  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00976047 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3077  hypothetical protein  26.81 
 
 		 755 aa  93.6  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0518712  normal  0.893514 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3245  hypothetical protein  30.23 
 
 		 1439 aa  90.9  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0883783 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0929  Cna B domain-containing protein  34.44 
 
 		 2876 aa  86.3  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.213129 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3152  conserved repeat domain protein  30.62 
 
 		 1716 aa  85.9  0.000000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4292  Cna B domain-containing protein  34.09 
 
 		 2890 aa  85.5  0.000000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.339674 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4951  hypothetical protein  37.24 
 
 		 3394 aa  84.3  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0489  lysyl endopeptidase  29.24 
 
 		 868 aa  83.6  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000398143  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1640  polymorphic outer membrane protein  36.91 
 
 		 767 aa  76.6  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3450  hypothetical protein  27.78 
 
 		 5453 aa  75.5  0.000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.119049 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2841  polymorphic outer membrane protein  34.23 
 
 		 759 aa  71.6  0.00000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3153  hypothetical protein  29.09 
 
 		 1238 aa  66.6  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1647  chitin-binding domain-containing protein  42.62 
 
 		 356 aa  63.9  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0765002  normal  0.540301 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3743  hypothetical protein  27.69 
 
 		 1193 aa  64.3  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0292  Cna B domain protein  33.88 
 
 		 2112 aa  60.8  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  51.65 
 
 		 846 aa  60.5  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3141  protease domain-containing protein  33.08 
 
 		 1393 aa  60.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1144  hypothetical protein  32.06 
 
 		 271 aa  60.1  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.069789 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0810  laminin G  56.58 
 
 		 433 aa  59.7  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.478954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44995  predicted protein  27.4 
 
 		 1217 aa  58.9  0.0000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00833272  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0642  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  25.98 
 
 		 2281 aa  57.8  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4336  alpha amylase catalytic region  39.84 
 
 		 914 aa  57.4  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2819  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) protein-like omain  59.49 
 
 		 1394 aa  56.2  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0967207  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4621  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  52.17 
 
 		 830 aa  56.2  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.184337  normal  0.0506116 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0797  protease domain-containing protein  31.54 
 
 		 1393 aa  55.5  0.000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0437  peptidase M4 thermolysin  25.38 
 
 		 1017 aa  53.9  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00224619  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0343  proprotein convertase P  40.96 
 
 		 730 aa  53.5  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000557566  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0948  hypothetical protein  36.22 
 
 		 560 aa  51.2  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.265105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0098  hypothetical protein  48.57 
 
 		 605 aa  50.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0997115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0679  hypothetical protein  47.95 
 
 		 625 aa  49.7  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00239733  hitchhiker  0.00966173 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48493  predicted protein  36.56 
 
 		 551 aa  49.3  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0000192267  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3035  protease domain-containing protein  40 
 
 		 1053 aa  48.9  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.559762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1526  RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG  26.89 
 
 		 411 aa  48.5  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.597121  normal  0.0174426 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44994  predicted protein  31.03 
 
 		 840 aa  47.8  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0685164  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3767  protease domain-containing protein  28.49 
 
 		 1311 aa  47.8  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000363962 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33106  predicted protein  38.53 
 
 		 657 aa  47  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4505  PT repeat-containing protein  56.92 
 
 		 453 aa  47  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1666  cellulose-binding family II protein  52.38 
 
 		 455 aa  47.8  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000449243  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4504  PT repeat-containing protein  53.52 
 
 		 456 aa  45.8  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0267  type 3a, cellulose-binding  43.48 
 
 		 671 aa  45.1  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>