36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0244 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0244  hypothetical protein  100 
 
 		 647 aa  1273    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.601423  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3191  hypothetical protein  30.4 
 
 		 593 aa  71.2  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000124226  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0754  fibronectin type III domain-containing protein  32.65 
 
 		 2192 aa  66.2  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2393  polymorphic outer membrane protein  29.24 
 
 		 659 aa  66.2  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1640  polymorphic outer membrane protein  31.47 
 
 		 767 aa  65.1  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2841  polymorphic outer membrane protein  33.9 
 
 		 759 aa  64.3  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2405  hypothetical protein  28.63 
 
 		 601 aa  63.2  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000140285  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0756  polymorphic outer membrane protein  33 
 
 		 2042 aa  62.4  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.442384  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2726  polymorphic outer membrane protein  22.99 
 
 		 593 aa  62  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0479266  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2314  polymorphic outer membrane protein  31.22 
 
 		 541 aa  59.7  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2253  polymorphic outer membrane protein  32.31 
 
 		 572 aa  58.2  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0130989  normal  0.262802 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4725  polymorphic membrane protein  28.69 
 
 		 1037 aa  57.4  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.708929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3634  polymorphic outer membrane protein  30.7 
 
 		 655 aa  55.8  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2348  hypothetical protein  31.15 
 
 		 545 aa  54.7  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10338  probable extracellular nuclease  30.99 
 
 		 2160 aa  54.3  0.000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0540  hypothetical protein  29.33 
 
 		 1061 aa  54.3  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2401  polymorphic outer membrane protein  38.38 
 
 		 362 aa  54.3  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1997  Hemolysin-type calcium-binding region  36.76 
 
 		 786 aa  53.9  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.177214 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3132  polymorphic membrane protein  30.12 
 
 		 546 aa  52.8  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4219  hypothetical protein  28.99 
 
 		 466 aa  52.4  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.958199 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3086  polymorphic outer membrane protein  28.57 
 
 		 665 aa  51.2  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0033  hypothetical protein  27.65 
 
 		 591 aa  50.4  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0376  hypothetical protein  43.21 
 
 		 870 aa  49.7  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5974  cysteine-rich repeat protein  25.33 
 
 		 731 aa  48.9  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.681553 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3707  polymorphic outer membrane protein  28.46 
 
 		 518 aa  48.1  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000878669  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1998  Hemolysin-type calcium-binding region  50 
 
 		 817 aa  48.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0671214 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0210  hypothetical protein  42.86 
 
 		 460 aa  48.5  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2593  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  31.22 
 
 		 1197 aa  48.1  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0238559  normal  0.0624657 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2874  polymorphic outer membrane protein  32.65 
 
 		 412 aa  47.8  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.234984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1609  hypothetical protein  41.82 
 
 		 435 aa  47.8  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.44696  normal  0.0279779 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2850  hypothetical protein  26.55 
 
 		 665 aa  47.4  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2246  hypothetical protein  27.7 
 
 		 591 aa  45.8  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.105015  normal  0.0180285 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2283  polymorphic outer membrane protein  28.57 
 
 		 575 aa  46.6  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1704  polymorphic outer membrane protein  27.35 
 
 		 1755 aa  44.7  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.041755  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1229  hypothetical protein  32.66 
 
 		 481 aa  44.3  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0257494  normal  0.865842 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3399  polymorphic outer membrane protein  31.91 
 
 		 483 aa  43.9  0.009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>