82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1127 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1127  hypothetical protein  100 
 
 		 461 aa  904    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.5274  normal  0.895772 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3987  hypothetical protein  61.67 
 
 		 467 aa  499  1e-140  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1020  hypothetical protein  65.98 
 
 		 435 aa  491  1e-137  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3407  hypothetical protein  59.78 
 
 		 454 aa  484  1e-135  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4370  polymorphic outer membrane protein  62.02 
 
 		 450 aa  468  1.0000000000000001e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293469 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4430  polymorphic outer membrane protein  59.11 
 
 		 465 aa  454  1.0000000000000001e-126  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4375  parallel beta-helix repeat-containing protein  58.28 
 
 		 465 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000665337 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3406  parallel beta-helix repeat-containing protein  59.32 
 
 		 479 aa  448  1.0000000000000001e-124  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.525217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1623  hypothetical protein  60.91 
 
 		 557 aa  437  1e-121  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3992  hypothetical protein  60.93 
 
 		 457 aa  423  1e-117  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.688493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3408  polymorphic outer membrane protein  56.26 
 
 		 461 aa  424  1e-117  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1626  hypothetical protein  56.85 
 
 		 489 aa  417  9.999999999999999e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.38383  normal  0.636637 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1619  hypothetical protein  53.91 
 
 		 454 aa  412  1e-114  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.892418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1615  hypothetical protein  53.73 
 
 		 452 aa  412  1e-114  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3654  polymorphic outer membrane protein  57.05 
 
 		 462 aa  410  1e-113  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00892124  hitchhiker  0.00240143 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2897  polymorphic outer membrane protein  56.6 
 
 		 459 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.966498  normal  0.981249 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3982  polymorphic outer membrane protein  60.12 
 
 		 496 aa  402  1e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.401558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0321  hypothetical protein  56.47 
 
 		 457 aa  401  9.999999999999999e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.584072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3415  hypothetical protein  57.75 
 
 		 455 aa  399  9.999999999999999e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.253351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4376  parallel beta-helix repeat-containing protein  56.14 
 
 		 464 aa  400  9.999999999999999e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.632591  decreased coverage  0.0000519323 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4374  polymorphic outer membrane protein  53.68 
 
 		 459 aa  400  9.999999999999999e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000585185 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4912  polymorphic outer membrane protein  58.71 
 
 		 446 aa  391  1e-107  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0139202 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4391  hypothetical protein  57.2 
 
 		 464 aa  389  1e-107  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0383  hypothetical protein  52.89 
 
 		 493 aa  389  1e-107  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0788229 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2925  parallel beta-helix repeat-containing protein  53.7 
 
 		 462 aa  387  1e-106  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3043  hypothetical protein  52.85 
 
 		 464 aa  387  1e-106  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0210  hypothetical protein  53.52 
 
 		 460 aa  387  1e-106  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0320  polymorphic membrane protein  59.35 
 
 		 361 aa  385  1e-106  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.960666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3011  polymorphic membrane protein  52.01 
 
 		 466 aa  385  1e-105  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.802976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1617  polymorphic membrane protein  48.05 
 
 		 505 aa  380  1e-104  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.926452  normal  0.174352 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1297  hypothetical protein  54.8 
 
 		 432 aa  377  1e-103  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.442891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4397  hypothetical protein  51.5 
 
 		 454 aa  374  1e-102  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.792915  normal  0.0309659 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4332  hypothetical protein  52.55 
 
 		 477 aa  362  6e-99  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252215  normal  0.0577257 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3647  hypothetical protein  51.04 
 
 		 464 aa  355  7.999999999999999e-97  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.279677  hitchhiker  0.00645734 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4920  hypothetical protein  51.68 
 
 		 468 aa  355  1e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0390615  normal  0.0715167 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1120  polymorphic outer membrane protein  55.01 
 
 		 441 aa  351  1e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00052776 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3075  polymorphic outer membrane protein  52.63 
 
 		 462 aa  350  3e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000356618 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4599  parallel beta-helix repeat-containing protein  53.28 
 
 		 478 aa  346  4e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.119679 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4219  hypothetical protein  50.32 
 
 		 466 aa  345  1e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.958199 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3990  hypothetical protein  48.09 
 
 		 439 aa  341  2e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1609  hypothetical protein  56.82 
 
 		 435 aa  340  2e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.44696  normal  0.0279779 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1045  polymorphic outer membrane protein  49.9 
 
 		 476 aa  327  3e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4774  hypothetical protein  50.31 
 
 		 473 aa  313  4.999999999999999e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0272932  decreased coverage  0.0000356618 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1620  polymorphic membrane protein  54.71 
 
 		 415 aa  312  1e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.890418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1605  polymorphic outer membrane protein  50.53 
 
 		 448 aa  311  1e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.7904  normal  0.0102473 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1610  polymorphic outer membrane protein  51.83 
 
 		 433 aa  311  1e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00898059 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3399  polymorphic outer membrane protein  40.53 
 
 		 483 aa  219  7e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3646  polymorphic outer membrane protein  39.13 
 
 		 509 aa  216  9e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.749989  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2509  hypothetical protein  41.67 
 
 		 476 aa  205  1e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.16291  normal  0.0412393 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1229  hypothetical protein  37.35 
 
 		 481 aa  193  7e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0257494  normal  0.865842 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2358  hypothetical protein  39.29 
 
 		 477 aa  181  2.9999999999999997e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.640506  normal  0.200266 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3285  hypothetical protein  35.37 
 
 		 532 aa  180  5.999999999999999e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.37025  hitchhiker  0.00171312 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3059  hypothetical protein  36.28 
 
 		 523 aa  175  1.9999999999999998e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.938529  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3668  hypothetical protein  40 
 
 		 501 aa  150  4e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2695  polymorphic membrane protein  29.55 
 
 		 483 aa  129  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0661586  hitchhiker  0.000503026 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2511  polymorphic membrane protein  29.59 
 
 		 477 aa  127  5e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.238754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3286  hypothetical protein  43.09 
 
 		 840 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.577779  hitchhiker  0.00794489 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3060  hypothetical protein  41.05 
 
 		 673 aa  105  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.103594 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1227  hypothetical protein  42.98 
 
 		 168 aa  77  0.0000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0203008  normal  0.739603 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2314  polymorphic outer membrane protein  28.27 
 
 		 541 aa  73.2  0.000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2841  polymorphic outer membrane protein  32.93 
 
 		 759 aa  70.1  0.00000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2258  hypothetical protein  28.36 
 
 		 530 aa  63.5  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1468  hypothetical protein  27.07 
 
 		 523 aa  58.2  0.0000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.92132  hitchhiker  0.00194181 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4725  polymorphic membrane protein  34.27 
 
 		 1037 aa  57.8  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.708929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1640  polymorphic outer membrane protein  28.79 
 
 		 767 aa  53.9  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2618  polymorphic outer membrane protein  24.07 
 
 		 863 aa  52  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2873  polymorphic outer membrane protein  35.82 
 
 		 717 aa  51.6  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.406525  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10338  probable extracellular nuclease  28.46 
 
 		 2160 aa  50.8  0.00005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2401  polymorphic outer membrane protein  39.24 
 
 		 362 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4272  hypothetical protein  26.34 
 
 		 852 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.176048  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1983  hypothetical protein  31.01 
 
 		 987 aa  49.3  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3328  polymorphic outer membrane protein  33.81 
 
 		 272 aa  48.9  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000184033 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15312  predicted protein  26.43 
 
 		 1359 aa  47.4  0.0006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0694  polymorphic membrane protein B/C family protein  28.14 
 
 		 1672 aa  47  0.0007  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2803  polymorphic outer membrane protein  24.81 
 
 		 527 aa  47  0.0008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.850053  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0201  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  32.64 
 
 		 884 aa  45.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2726  polymorphic outer membrane protein  25.56 
 
 		 593 aa  45.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0479266  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2253  polymorphic outer membrane protein  32.34 
 
 		 572 aa  45.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0130989  normal  0.262802 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2874  polymorphic outer membrane protein  38.53 
 
 		 412 aa  44.3  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.234984  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0765  hypothetical protein  50 
 
 		 294 aa  44.3  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2405  hypothetical protein  28.71 
 
 		 601 aa  44.7  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000140285  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2283  polymorphic outer membrane protein  25.97 
 
 		 1296 aa  43.5  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>