67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2348 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3132  polymorphic membrane protein  78.75 
 
 		 546 aa  775    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2348  hypothetical protein  100 
 
 		 545 aa  1057    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2841  polymorphic outer membrane protein  29.73 
 
 		 759 aa  108  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1640  polymorphic outer membrane protein  29.22 
 
 		 767 aa  101  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0756  polymorphic outer membrane protein  37.16 
 
 		 2042 aa  94.7  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.442384  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3191  hypothetical protein  33.58 
 
 		 593 aa  91.3  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000124226  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2873  polymorphic outer membrane protein  31.39 
 
 		 717 aa  87  7e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.406525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2319  hypothetical protein  29.89 
 
 		 1106 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.300784  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0754  fibronectin type III domain-containing protein  31.55 
 
 		 2192 aa  80.9  0.00000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0540  hypothetical protein  27.69 
 
 		 1061 aa  80.5  0.00000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2874  polymorphic outer membrane protein  31.91 
 
 		 412 aa  79.3  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.234984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2405  hypothetical protein  32.57 
 
 		 601 aa  71.6  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000140285  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2283  polymorphic outer membrane protein  31.97 
 
 		 1296 aa  70.5  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3707  polymorphic outer membrane protein  29.7 
 
 		 518 aa  69.7  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000878669  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2726  polymorphic outer membrane protein  29.3 
 
 		 593 aa  67.8  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0479266  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2246  hypothetical protein  33.33 
 
 		 591 aa  67  0.0000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.105015  normal  0.0180285 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0859  OmpA/MotB domain protein  33.51 
 
 		 913 aa  65.5  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.181215 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0033  hypothetical protein  29.8 
 
 		 591 aa  65.5  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5974  cysteine-rich repeat protein  32.38 
 
 		 731 aa  62  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.681553 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2283  polymorphic outer membrane protein  29.47 
 
 		 575 aa  61.6  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2393  polymorphic outer membrane protein  28.96 
 
 		 659 aa  60.8  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1035  hypothetical protein  27.96 
 
 		 1010 aa  60.8  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0244  hypothetical protein  31.13 
 
 		 647 aa  60.8  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.601423  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4725  polymorphic membrane protein  30.77 
 
 		 1037 aa  60.5  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.708929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3646  polymorphic outer membrane protein  28.68 
 
 		 509 aa  59.7  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.749989  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4998  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  38.46 
 
 		 1800 aa  59.7  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.329522  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2988  polymorphic outer membrane protein  29.78 
 
 		 575 aa  57.8  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0583035  hitchhiker  0.000382857 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3634  polymorphic outer membrane protein  52.38 
 
 		 655 aa  57.4  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2599  hypothetical protein  35.38 
 
 		 726 aa  56.2  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0807  hypothetical protein  37.5 
 
 		 587 aa  56.2  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0970671  normal  0.272045 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3399  polymorphic outer membrane protein  29.8 
 
 		 483 aa  56.2  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2156  polymorphic outer membrane protein  30.17 
 
 		 526 aa  55.1  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.927153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4022  conserved repeat domain protein  36.21 
 
 		 1989 aa  52.8  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3112  hypothetical protein  33.33 
 
 		 744 aa  53.1  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0359338  normal  0.0662145 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1997  Hemolysin-type calcium-binding region  35.33 
 
 		 786 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.177214 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2481  conserved repeat domain protein  35.9 
 
 		 3921 aa  52.8  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0327  conserved repeat domain protein  28.08 
 
 		 743 aa  52.4  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2258  hypothetical protein  31.58 
 
 		 530 aa  52.8  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4920  hypothetical protein  32.97 
 
 		 468 aa  51.6  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0390615  normal  0.0715167 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3328  polymorphic outer membrane protein  29.73 
 
 		 272 aa  51.6  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000184033 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2474  conserved repeat domain protein  38.39 
 
 		 1293 aa  51.6  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.558033  hitchhiker  0.00737149 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4226  conserved repeat domain protein  42.37 
 
 		 983 aa  50.8  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.405356 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2358  hypothetical protein  28.35 
 
 		 477 aa  50.8  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.640506  normal  0.200266 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1788  polymorphic membrane protein  29.58 
 
 		 1092 aa  50.4  0.00008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1787  polymorphic outer membrane protein  29.26 
 
 		 1332 aa  50.4  0.00008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2509  hypothetical protein  30.05 
 
 		 476 aa  50.1  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.16291  normal  0.0412393 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2314  polymorphic outer membrane protein  27.08 
 
 		 541 aa  49.7  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1704  polymorphic outer membrane protein  25.56 
 
 		 1755 aa  48.9  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.041755  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3668  hypothetical protein  31.58 
 
 		 501 aa  49.3  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1229  hypothetical protein  29.22 
 
 		 481 aa  48.5  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0257494  normal  0.865842 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4856  hypothetical protein  43.16 
 
 		 1315 aa  47.8  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.212334  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2253  polymorphic outer membrane protein  29.43 
 
 		 572 aa  47.8  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0130989  normal  0.262802 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  27.85 
 
 		 1750 aa  47.8  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3043  hypothetical protein  30.95 
 
 		 464 aa  47  0.0009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2970  hypothetical protein  35 
 
 		 167 aa  47  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0032208  hitchhiker  0.0000171806 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4391  hypothetical protein  35.71 
 
 		 464 aa  46.6  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02579  hypothetical protein  29.6 
 
 		 516 aa  45.8  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3329  polymorphic outer membrane protein  25.06 
 
 		 558 aa  46.2  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000300518 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4370  polymorphic outer membrane protein  32.26 
 
 		 450 aa  45.1  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293469 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1998  Hemolysin-type calcium-binding region  38.2 
 
 		 817 aa  45.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0671214 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0312  hypothetical protein  36.44 
 
 		 775 aa  45.1  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0887413  decreased coverage  0.00223033 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10338  probable extracellular nuclease  30.47 
 
 		 2160 aa  44.3  0.006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3086  polymorphic outer membrane protein  46.03 
 
 		 665 aa  44.3  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0759  hypothetical protein  32.47 
 
 		 907 aa  44.3  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.747993 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0376  hypothetical protein  33.33 
 
 		 870 aa  43.9  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2393  hypothetical protein  33.03 
 
 		 1809 aa  43.9  0.008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1806  hypothetical protein  34.65 
 
 		 621 aa  43.5  0.009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>