42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3707 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_3707  polymorphic outer membrane protein  100 
 
 		 518 aa  1043    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000878669  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0033  hypothetical protein  32.83 
 
 		 591 aa  183  7e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2393  polymorphic outer membrane protein  32.77 
 
 		 659 aa  181  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3086  polymorphic outer membrane protein  33.33 
 
 		 665 aa  174  5e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3634  polymorphic outer membrane protein  32.33 
 
 		 655 aa  167  4e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2246  hypothetical protein  31.61 
 
 		 591 aa  150  7e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.105015  normal  0.0180285 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2156  polymorphic outer membrane protein  33.12 
 
 		 526 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.927153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2283  polymorphic outer membrane protein  27.99 
 
 		 575 aa  141  3e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2988  polymorphic outer membrane protein  28.81 
 
 		 575 aa  132  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0583035  hitchhiker  0.000382857 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2314  polymorphic outer membrane protein  27.65 
 
 		 541 aa  128  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2253  polymorphic outer membrane protein  28.31 
 
 		 572 aa  127  4.0000000000000003e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0130989  normal  0.262802 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02579  hypothetical protein  26.63 
 
 		 516 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1640  polymorphic outer membrane protein  26.28 
 
 		 767 aa  70.9  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2841  polymorphic outer membrane protein  28.08 
 
 		 759 aa  64.7  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0540  hypothetical protein  25.19 
 
 		 1061 aa  63.2  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3191  hypothetical protein  25.78 
 
 		 593 aa  61.6  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000124226  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0754  fibronectin type III domain-containing protein  30.84 
 
 		 2192 aa  61.2  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2258  hypothetical protein  24.82 
 
 		 530 aa  60.5  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2405  hypothetical protein  25.54 
 
 		 601 aa  60.5  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000140285  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2348  hypothetical protein  29.7 
 
 		 545 aa  58.5  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0859  OmpA/MotB domain protein  28.03 
 
 		 913 aa  57.4  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.181215 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4219  hypothetical protein  30.51 
 
 		 466 aa  57.4  0.0000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.958199 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3132  polymorphic membrane protein  29.55 
 
 		 546 aa  55.8  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2873  polymorphic outer membrane protein  30.49 
 
 		 717 aa  55.5  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.406525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3043  hypothetical protein  26.87 
 
 		 464 aa  53.9  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2803  polymorphic outer membrane protein  28.09 
 
 		 527 aa  53.9  0.000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.850053  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2593  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  29.5 
 
 		 1197 aa  53.1  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0238559  normal  0.0624657 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2726  polymorphic outer membrane protein  27.75 
 
 		 593 aa  52.4  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0479266  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3399  polymorphic outer membrane protein  28.26 
 
 		 483 aa  51.2  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_54658  predicted protein  39.53 
 
 		 422 aa  51.2  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0000768502  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4998  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  31.32 
 
 		 1800 aa  49.7  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.329522  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0756  polymorphic outer membrane protein  33.57 
 
 		 2042 aa  49.7  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.442384  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1078  putative lipoprotein  29.09 
 
 		 302 aa  49.3  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.839732  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10338  probable extracellular nuclease  32.18 
 
 		 2160 aa  48.1  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5974  cysteine-rich repeat protein  27.6 
 
 		 731 aa  47.8  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.681553 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0244  hypothetical protein  27.24 
 
 		 647 aa  45.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.601423  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2283  polymorphic outer membrane protein  61.11 
 
 		 1296 aa  45.4  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2874  polymorphic outer membrane protein  31.85 
 
 		 412 aa  45.4  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.234984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2897  polymorphic outer membrane protein  25.44 
 
 		 459 aa  45.1  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.966498  normal  0.981249 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2401  polymorphic outer membrane protein  31.9 
 
 		 362 aa  44.7  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1362  hypothetical protein  27.42 
 
 		 1023 aa  44.7  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4397  hypothetical protein  26.72 
 
 		 454 aa  43.9  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.792915  normal  0.0309659 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>