95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2314 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_2314  polymorphic outer membrane protein  100 
 
 
541 aa  1078    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2283  polymorphic outer membrane protein  33.51 
 
 
575 aa  163  6e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2988  polymorphic outer membrane protein  32.23 
 
 
575 aa  158  3e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0583035  hitchhiker  0.000382857 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2258  hypothetical protein  28.93 
 
 
530 aa  150  5e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2246  hypothetical protein  31.63 
 
 
591 aa  150  6e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.105015  normal  0.0180285 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0033  hypothetical protein  29.89 
 
 
591 aa  133  1.0000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3707  polymorphic outer membrane protein  28.36 
 
 
518 aa  120  4.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000878669  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2253  polymorphic outer membrane protein  29.3 
 
 
572 aa  113  9e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0130989  normal  0.262802 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3634  polymorphic outer membrane protein  29.39 
 
 
655 aa  108  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02579  hypothetical protein  29.95 
 
 
516 aa  102  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2897  polymorphic outer membrane protein  30.73 
 
 
459 aa  87.4  5e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.966498  normal  0.981249 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3329  polymorphic outer membrane protein  30.2 
 
 
558 aa  86.3  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000300518 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2393  polymorphic outer membrane protein  27.01 
 
 
659 aa  86.7  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4374  polymorphic outer membrane protein  32.53 
 
 
459 aa  84.7  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000585185 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3990  hypothetical protein  32.37 
 
 
439 aa  83.6  0.000000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2803  polymorphic outer membrane protein  33.45 
 
 
527 aa  82  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.850053  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2156  polymorphic outer membrane protein  28.07 
 
 
526 aa  82.4  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.927153  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0540  hypothetical protein  30.32 
 
 
1061 aa  81.3  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3191  hypothetical protein  29.2 
 
 
593 aa  80.5  0.00000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000124226  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2405  hypothetical protein  27.54 
 
 
601 aa  79  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000140285  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3399  polymorphic outer membrane protein  28.22 
 
 
483 aa  79.3  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3646  polymorphic outer membrane protein  30.03 
 
 
509 aa  78.6  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.749989  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2695  polymorphic membrane protein  28.99 
 
 
483 aa  78.6  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0661586  hitchhiker  0.000503026 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2726  polymorphic outer membrane protein  27.31 
 
 
593 aa  75.9  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0479266  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3668  hypothetical protein  29.64 
 
 
501 aa  73.9  0.000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0859  OmpA/MotB domain protein  29.27 
 
 
913 aa  73.9  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.181215 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2319  hypothetical protein  27.54 
 
 
1106 aa  73.9  0.000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.300784  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4219  hypothetical protein  27.99 
 
 
466 aa  73.2  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.958199 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1127  hypothetical protein  27.94 
 
 
461 aa  72.4  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.5274  normal  0.895772 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1615  hypothetical protein  29.11 
 
 
452 aa  70.1  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0754  fibronectin type III domain-containing protein  29.96 
 
 
2192 aa  70.1  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3043  hypothetical protein  27.96 
 
 
464 aa  68.9  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10338  probable extracellular nuclease  32.36 
 
 
2160 aa  69.3  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3408  polymorphic outer membrane protein  31.34 
 
 
461 aa  68.9  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1020  hypothetical protein  28.2 
 
 
435 aa  67  0.0000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3647  hypothetical protein  30.39 
 
 
464 aa  66.2  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.279677  hitchhiker  0.00645734 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4370  polymorphic outer membrane protein  28.24 
 
 
450 aa  65.9  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293469 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3987  hypothetical protein  31.25 
 
 
467 aa  65.9  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2511  polymorphic membrane protein  27.43 
 
 
477 aa  65.9  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.238754  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3086  polymorphic outer membrane protein  30.14 
 
 
665 aa  65.9  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1078  putative lipoprotein  30.46 
 
 
302 aa  65.1  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.839732  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2509  hypothetical protein  28.47 
 
 
476 aa  64.3  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.16291  normal  0.0412393 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1640  polymorphic outer membrane protein  29.31 
 
 
767 aa  63.9  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4430  polymorphic outer membrane protein  25.54 
 
 
465 aa  63.5  0.000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2873  polymorphic outer membrane protein  33.66 
 
 
717 aa  63.2  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.406525  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4272  hypothetical protein  27.39 
 
 
852 aa  63.2  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.176048  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1617  polymorphic membrane protein  28.46 
 
 
505 aa  62.4  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.926452  normal  0.174352 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1610  polymorphic outer membrane protein  31.22 
 
 
433 aa  61.6  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00898059 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3407  hypothetical protein  24.67 
 
 
454 aa  60.8  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4920  hypothetical protein  27.2 
 
 
468 aa  60.5  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0390615  normal  0.0715167 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3406  parallel beta-helix repeat-containing protein  27.39 
 
 
479 aa  59.7  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.525217  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3011  polymorphic membrane protein  34.01 
 
 
466 aa  58.9  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.802976  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0321  hypothetical protein  30.19 
 
 
457 aa  58.5  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.584072  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1229  hypothetical protein  28.27 
 
 
481 aa  58.2  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0257494  normal  0.865842 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2874  polymorphic outer membrane protein  32.19 
 
 
412 aa  57.8  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.234984  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1619  hypothetical protein  27.64 
 
 
454 aa  57.4  0.0000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.892418  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4397  hypothetical protein  29.57 
 
 
454 aa  57.4  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.792915  normal  0.0309659 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0244  hypothetical protein  29.06 
 
 
647 aa  56.2  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.601423  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4375  parallel beta-helix repeat-containing protein  26.25 
 
 
465 aa  56.6  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000665337 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0320  polymorphic membrane protein  26.87 
 
 
361 aa  55.8  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.960666  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2283  polymorphic outer membrane protein  27.6 
 
 
1296 aa  55.1  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0723  hypothetical protein  27.82 
 
 
1318 aa  55.1  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.661776 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1362  hypothetical protein  30.34 
 
 
1023 aa  55.1  0.000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0210  hypothetical protein  25.47 
 
 
460 aa  53.9  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2358  hypothetical protein  32.71 
 
 
477 aa  53.1  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.640506  normal  0.200266 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3654  polymorphic outer membrane protein  28.03 
 
 
462 aa  53.1  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00892124  hitchhiker  0.00240143 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4391  hypothetical protein  26.27 
 
 
464 aa  52.4  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1620  polymorphic membrane protein  26.27 
 
 
415 aa  52.4  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.890418  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3059  hypothetical protein  29.9 
 
 
523 aa  52.8  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.938529  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0383  hypothetical protein  30.43 
 
 
493 aa  52.4  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0788229 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2841  polymorphic outer membrane protein  33.72 
 
 
759 aa  51.2  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1626  hypothetical protein  29.09 
 
 
489 aa  51.2  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.38383  normal  0.636637 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15312  predicted protein  28.65 
 
 
1359 aa  50.8  0.00006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1704  polymorphic outer membrane protein  27.05 
 
 
1755 aa  50.1  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.041755  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3992  hypothetical protein  28.98 
 
 
457 aa  49.7  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.688493  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1575  putative lipoprotein  29.95 
 
 
384 aa  49.3  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.368277 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2925  parallel beta-helix repeat-containing protein  26.94 
 
 
462 aa  49.7  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3415  hypothetical protein  27.49 
 
 
455 aa  48.9  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.253351  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2401  polymorphic outer membrane protein  33.33 
 
 
362 aa  48.5  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1297  hypothetical protein  26.86 
 
 
432 aa  47.8  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.442891  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4376  parallel beta-helix repeat-containing protein  26.48 
 
 
464 aa  47.4  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.632591  decreased coverage  0.0000519323 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3801  Ig family protein  32.54 
 
 
1170 aa  47  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000269985  normal  0.432666 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2528  adhesin  32.26 
 
 
1252 aa  46.6  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1998  Hemolysin-type calcium-binding region  41.67 
 
 
817 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0671214 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1983  hypothetical protein  34.78 
 
 
987 aa  46.6  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1426  outer membrane autotransporter barrel domain protein  33.91 
 
 
1234 aa  45.8  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.221475  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1997  Hemolysin-type calcium-binding region  32.61 
 
 
786 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.177214 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1418  adhesin  33.91 
 
 
1234 aa  45.8  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000765921 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2373  adhesin  32.95 
 
 
1250 aa  45.8  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1468  hypothetical protein  28.29 
 
 
523 aa  45.8  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.92132  hitchhiker  0.00194181 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02159  adhesin  32.95 
 
 
1250 aa  45.8  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1120  polymorphic outer membrane protein  31.63 
 
 
441 aa  44.3  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00052776 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0201  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  25.47 
 
 
884 aa  44.3  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1921  hypothetical protein  31.87 
 
 
350 aa  43.9  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.884061  normal  0.370126 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4912  polymorphic outer membrane protein  28.73 
 
 
446 aa  43.9  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0139202 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>