121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_2528 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02159  adhesin  95.29 
 
 		 1250 aa  2332    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1426  outer membrane autotransporter barrel domain protein  95.87 
 
 		 1234 aa  2311    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.221475  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3367  adhesin  95.47 
 
 		 1234 aa  2306    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2373  adhesin  95.85 
 
 		 1250 aa  2345    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2528  adhesin  100 
 
 		 1252 aa  2517    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1418  adhesin  95.55 
 
 		 1234 aa  2308    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000765921 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2384  adhesin  82.62 
 
 		 1254 aa  2020    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.985186 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4206  outer membrane autotransporter  31.58 
 
 		 1594 aa  231  5e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2148  putative lipoprotein/autotransporter domain-containing protein  31.23 
 
 		 1806 aa  231  7e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.589392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1711  outer membrane autotransporter domain-containing protein  30.93 
 
 		 1327 aa  223  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01481  hypothetical protein  30.93 
 
 		 466 aa  213  2e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4201  outer membrane autotransporter  31.12 
 
 		 1579 aa  213  2e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.597985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2510  outer membrane autotransporter  29.72 
 
 		 2637 aa  212  3e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.995236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0743  outer membrane autotransporter  31.01 
 
 		 4312 aa  211  7e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0673  putative autotransporter protein  30.59 
 
 		 4391 aa  210  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1980  autotransporter (AT) family porin  28.74 
 
 		 773 aa  210  1e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0125961  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03531  hypothetical protein  26.18 
 
 		 1165 aa  202  3e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.1665  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03479  hypothetical protein  26.18 
 
 		 1165 aa  202  3e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.112471  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0374  putative outer membrane autotransporter  29.83 
 
 		 1327 aa  202  3e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.514292  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0332  putative outer membrane autotransporter  29.83 
 
 		 1327 aa  202  5e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0377  putative outer membrane autotransporter  30.24 
 
 		 1349 aa  201  9e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.120406 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2454  ShdA  28.21 
 
 		 3322 aa  195  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2662  ShdA  29.25 
 
 		 2057 aa  188  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.285141  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0318  outer membrane autotransporter  34.62 
 
 		 989 aa  187  1.0000000000000001e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000433697 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3228  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.07 
 
 		 868 aa  169  2.9999999999999998e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00110064  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0217  outer membrane protein IcsA  25.19 
 
 		 1102 aa  162  5e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01154  hypothetical protein  31.79 
 
 		 338 aa  155  4e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3981  outer membrane autotransporter barrel domain  30.41 
 
 		 955 aa  154  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3962  outer membrane autotransporter barrel domain  29.97 
 
 		 955 aa  152  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1312  autotransporter (AT) family porin  31.67 
 
 		 306 aa  145  4e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000904355  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2817  outer membrane autotransporter  26.44 
 
 		 950 aa  137  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2288  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.54 
 
 		 806 aa  137  1.9999999999999998e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.540701 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1662  pertactin family protein  33.87 
 
 		 1626 aa  136  3e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.459563 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0173  outer membrane autotransporter  25.56 
 
 		 1113 aa  126  3e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0108054  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4504  outer membrane autotransporter  27.68 
 
 		 1012 aa  125  4e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.590771  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3770  Outer membrane autotransporter barrel  27.89 
 
 		 1234 aa  124  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0372  Outer membrane autotransporter barrel  27.9 
 
 		 1277 aa  124  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.617347  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2767  outer membrane autotransporter  27.63 
 
 		 1108 aa  122  6e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1053  outer membrane autotransporter  27.73 
 
 		 3415 aa  113  2.0000000000000002e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1148  outer membrane autotransporter  28.23 
 
 		 3420 aa  112  5e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0586  outer membrane autotransporter  28.93 
 
 		 2926 aa  106  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3036  outer membrane autotransporter  25.77 
 
 		 995 aa  103  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2797  outer membrane autotransporter  26.71 
 
 		 818 aa  101  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0467702  normal  0.0793019 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2655  outer membrane autotransporter  26.8 
 
 		 819 aa  99.8  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0561  outer membrane autotransporter  24.73 
 
 		 997 aa  98.6  7e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3069  outer membrane autotransporter  26.41 
 
 		 825 aa  98.2  8e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.27692  normal  0.553853 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0499  putative autotransporter protein  24.66 
 
 		 1004 aa  97.4  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0763  outer membrane autotransporter  26.98 
 
 		 1254 aa  97.4  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3513  outer membrane autotransporter  27.85 
 
 		 1268 aa  97.1  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.273383  normal  0.696988 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0695  putative autotransporter protein  26.74 
 
 		 1259 aa  96.3  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.931243  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3865  outer membrane autotransporter  27.27 
 
 		 1269 aa  96.3  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4307  outer membrane autotransporter  26.29 
 
 		 1099 aa  96.3  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.157591  hitchhiker  0.00000542564 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0734  outer membrane autotransporter barrel domain protein  29.52 
 
 		 1086 aa  96.3  4e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.837049 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3775  putative autotransporter protein  26.38 
 
 		 1285 aa  95.9  5e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3532  outer membrane autotransporter  25.9 
 
 		 1571 aa  94.4  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0694  putative autotransporter protein  26.67 
 
 		 1259 aa  92.4  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0152  outermembrane transporter  34.18 
 
 		 861 aa  90.1  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.0000458443  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2810  outer membrane autotransporter  26.63 
 
 		 2578 aa  90.1  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4985  Outer membrane autotransporter barrel  27.01 
 
 		 1093 aa  89.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.68858  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3175  outer membrane autotransporter  27.01 
 
 		 1093 aa  89.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0115385 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4858  outer membrane autotransporter  26.63 
 
 		 2906 aa  89.7  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4855  outer membrane autotransporter  26.63 
 
 		 1861 aa  88.6  8e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4055  putative autotransporter protein  26.21 
 
 		 1067 aa  84  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1059  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25 
 
 		 1023 aa  83.2  0.00000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3095  outer membrane autotransporter  23.23 
 
 		 1028 aa  78.2  0.0000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.446562  normal  0.576928 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1979  Outer membrane autotransporter barrel  30.28 
 
 		 947 aa  76.6  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0897948  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1463  outer membrane autotransporter  25.36 
 
 		 733 aa  76.3  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.458818  normal  0.71316 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3370  outer membrane autotransporter  33.87 
 
 		 1068 aa  75.9  0.000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2013  outer membrane autotransporter  27.34 
 
 		 1593 aa  75.5  0.000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2225  autotransporter, putative  26.05 
 
 		 773 aa  75.1  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.192143  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1489  outer membrane autotransporter  24.03 
 
 		 729 aa  74.7  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2710  outer membrane autotransporter  27.32 
 
 		 1748 aa  72.8  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2011  autotransporter, putative  25.05 
 
 		 769 aa  71.2  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2844  outer membrane autotransporter barrel domain protein  44.62 
 
 		 1357 aa  70.9  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.241851  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0568  outer membrane autotransporter  27.12 
 
 		 1770 aa  70.1  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3759  outer membrane autotransporter barrel  28.68 
 
 		 1753 aa  68.9  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1341  Outer membrane autotransporter barrel  25.99 
 
 		 1040 aa  67.8  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.108803  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0107  outer membrane autotransporter  26.05 
 
 		 1070 aa  68.2  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3408  Outer membrane autotransporter barrel  24.59 
 
 		 709 aa  67  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.560212  normal  0.144243 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0614  Outer membrane autotransporter barrel  26.74 
 
 		 1741 aa  66.6  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0347869 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0594  outer membrane autotransporter  26.48 
 
 		 1770 aa  66.6  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367872  normal  0.807711 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0640  outer membrane autotransporter  25.16 
 
 		 1763 aa  65.9  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0190  Outer membrane autotransporter barrel  27.14 
 
 		 1762 aa  65.9  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.487352  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0673  outer membrane autotransporter  27.14 
 
 		 1762 aa  65.9  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3827  outer membrane autotransporter  24.11 
 
 		 731 aa  65.9  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4077  putative autotransporter protein  25.17 
 
 		 1070 aa  65.5  0.000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00997828 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2034  Outer membrane autotransporter barrel  24.12 
 
 		 732 aa  61.6  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.449525 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2985  putative autotransporter protein  24.68 
 
 		 638 aa  61.6  0.00000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3064  outer membrane autotransporter  24.68 
 
 		 638 aa  61.6  0.00000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0916  outer membrane autotransporter  30.07 
 
 		 1144 aa  58.9  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.753371 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1330  outer membrane autotransporter barrel domain protein  43.24 
 
 		 1122 aa  58.5  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1888  putative autotransporter protein  24.37 
 
 		 638 aa  57.8  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0815512  hitchhiker  0.00028295 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1276  Outer membrane autotransporter barrel protein  33.99 
 
 		 1049 aa  57  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0821611 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1880  outer membrane autotransporter  25.33 
 
 		 730 aa  55.5  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.396897 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3451  outer membrane autotransporter  34.46 
 
 		 909 aa  53.5  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0836  hypothetical protein  44.19 
 
 		 268 aa  53.1  0.00003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000351202 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3399  polymorphic outer membrane protein  28.84 
 
 		 483 aa  53.1  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01153  hypothetical protein  32.64 
 
 		 506 aa  52.8  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.580835  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1267  hypothetical protein  32.64 
 
 		 506 aa  52.8  0.00005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0117469  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2875  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.46 
 
 		 1848 aa  52.4  0.00006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.189813 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>