130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0723 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0723  hypothetical protein  100 
 
 		 1318 aa  2667    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.661776 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0726  hypothetical protein  29.71 
 
 		 1263 aa  298  7e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.434756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0821  hypothetical protein  32.25 
 
 		 1055 aa  276  2.0000000000000002e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.661621  normal  0.324111 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2283  polymorphic outer membrane protein  33.66 
 
 		 1296 aa  261  5.0000000000000005e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5262  hypothetical protein  33.67 
 
 		 1215 aa  164  8.000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.653834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1919  hypothetical protein  35.76 
 
 		 308 aa  147  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.608638 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0754  fibronectin type III domain-containing protein  35.37 
 
 		 2192 aa  137  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1790  polymorphic membrane protein  28.96 
 
 		 799 aa  135  3.9999999999999996e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1788  polymorphic membrane protein  30.39 
 
 		 1092 aa  133  2.0000000000000002e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4272  hypothetical protein  29.52 
 
 		 852 aa  132  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.176048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5604  hypothetical protein  30.91 
 
 		 1294 aa  129  5e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3798  filamentous hemagglutinin outer membrane protein  30.65 
 
 		 1526 aa  116  3e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0575475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1787  polymorphic outer membrane protein  30.43 
 
 		 1332 aa  107  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5606  hypothetical protein  31.82 
 
 		 408 aa  95.9  5e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1875  polymorphic membrane protein  30.42 
 
 		 507 aa  94.7  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1921  hypothetical protein  29.68 
 
 		 350 aa  92.4  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.884061  normal  0.370126 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2515  hypothetical protein  31.28 
 
 		 441 aa  92  6e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1704  polymorphic outer membrane protein  27.74 
 
 		 1755 aa  91.3  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.041755  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2050  FG-GAP repeat protein  32.95 
 
 		 1437 aa  90.1  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3801  Ig family protein  29.4 
 
 		 1170 aa  87.4  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000269985  normal  0.432666 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2695  polymorphic membrane protein  28.51 
 
 		 483 aa  84  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0661586  hitchhiker  0.000503026 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1920  hypothetical protein  33.51 
 
 		 417 aa  83.6  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.409778 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1853  lipoprotein  32.77 
 
 		 558 aa  83.2  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0367597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0327  conserved repeat domain protein  28.86 
 
 		 743 aa  83.2  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2511  polymorphic membrane protein  29.05 
 
 		 477 aa  80.1  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.238754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0502  lipoprotein  37.67 
 
 		 1575 aa  79.7  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.620204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3327  hypothetical protein  30.98 
 
 		 428 aa  79  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.802157  normal  0.933717 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1942  hypothetical protein  35.59 
 
 		 501 aa  79  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.507224 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1035  hypothetical protein  31 
 
 		 1010 aa  77.8  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2803  polymorphic outer membrane protein  29.55 
 
 		 527 aa  77  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.850053  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2139  CHU large protein, SAP or adhesin AidA-related  26.35 
 
 		 688 aa  76.6  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.534536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0352  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  29.94 
 
 		 665 aa  75.9  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.259474  normal  0.181219 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2283  polymorphic outer membrane protein  29.33 
 
 		 575 aa  75.5  0.000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2527  FG-GAP repeat protein  31.95 
 
 		 1433 aa  75.1  0.000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000205902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1580  hypothetical protein  30.64 
 
 		 601 aa  74.7  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000412506  normal  0.738361 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0617  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.33 
 
 		 1773 aa  73.6  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.716673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1341  conserved repeat domain protein  26.67 
 
 		 1668 aa  72.8  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.831003 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1660  hypothetical protein  31.14 
 
 		 491 aa  72.4  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4322  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.18 
 
 		 1797 aa  71.6  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000460936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0537  hypothetical protein  28.57 
 
 		 1029 aa  71.2  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.244955  normal  0.441829 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3408  polymorphic outer membrane protein  26.27 
 
 		 461 aa  70.1  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1747  hypothetical protein  28.32 
 
 		 495 aa  70.1  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5663  hypothetical protein  28.12 
 
 		 324 aa  67.8  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1229  hypothetical protein  33.77 
 
 		 481 aa  67.4  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0257494  normal  0.865842 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0384  hypothetical protein  29.7 
 
 		 700 aa  67  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000000171472  normal  0.22141 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0718  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  23.23 
 
 		 1783 aa  67.4  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.281324  normal  0.533675 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0619  Polymorphic membrane protein  29.68 
 
 		 1216 aa  67  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.418961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0005  polymorphic outer membrane protein  26.1 
 
 		 775 aa  67  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000710623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4181  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  33.6 
 
 		 570 aa  66.6  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.100139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4535  hypothetical protein  31.65 
 
 		 333 aa  65.9  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.896481 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2618  polymorphic outer membrane protein  27.44 
 
 		 863 aa  65.5  0.000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6007  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.33 
 
 		 1015 aa  65.5  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00134837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2897  polymorphic outer membrane protein  27.56 
 
 		 459 aa  65.5  0.000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.966498  normal  0.981249 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2988  polymorphic outer membrane protein  30.07 
 
 		 575 aa  65.1  0.000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0583035  hitchhiker  0.000382857 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3647  hypothetical protein  35.14 
 
 		 464 aa  63.9  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.279677  hitchhiker  0.00645734 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2337  hypothetical protein  29.21 
 
 		 1147 aa  64.3  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00625396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1757  hypothetical protein  27.91 
 
 		 341 aa  62.8  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.154893 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6092  hypothetical protein  26.16 
 
 		 254 aa  63.2  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2183  hypothetical protein  30.37 
 
 		 571 aa  62.8  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4118  hypothetical protein  28.79 
 
 		 755 aa  63.2  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.637469 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2120  hypothetical protein  30.46 
 
 		 362 aa  62.4  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4920  hypothetical protein  28.1 
 
 		 468 aa  61.6  0.00000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0390615  normal  0.0715167 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4609  hypothetical protein  38.39 
 
 		 543 aa  60.8  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.318539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2105  glycoside hydrolase family 9  25.47 
 
 		 803 aa  61.2  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.867838  normal  0.536914 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2349  hypothetical protein  33.61 
 
 		 230 aa  60.8  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0736668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2253  polymorphic outer membrane protein  27.95 
 
 		 572 aa  60.5  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0130989  normal  0.262802 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2043  parallel beta-helix repeat-containing protein  24.29 
 
 		 2031 aa  60.5  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4214  hypothetical protein  32.77 
 
 		 376 aa  60.8  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.208947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5291  hypothetical protein  28.9 
 
 		 736 aa  60.5  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.775862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2066  metallophosphoesterase  31.4 
 
 		 686 aa  60.8  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2319  hypothetical protein  30.89 
 
 		 1106 aa  60.1  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.300784  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4430  polymorphic outer membrane protein  29.79 
 
 		 465 aa  60.1  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4397  hypothetical protein  29.45 
 
 		 454 aa  59.7  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.792915  normal  0.0309659 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0532  hypothetical protein  28.11 
 
 		 757 aa  59.7  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0519891  normal  0.677455 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3043  hypothetical protein  28.24 
 
 		 464 aa  59.3  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4370  polymorphic outer membrane protein  27.84 
 
 		 450 aa  59.7  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293469 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1758  lipoprotein  26.44 
 
 		 933 aa  59.3  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.25404 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2179  hypothetical protein  31.34 
 
 		 541 aa  59.3  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1120  polymorphic outer membrane protein  30.58 
 
 		 441 aa  59.3  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00052776 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3308  hypothetical protein  33.05 
 
 		 340 aa  59.3  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4541  hypothetical protein  27.22 
 
 		 996 aa  58.9  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.444049  normal  0.286675 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3329  polymorphic outer membrane protein  25.76 
 
 		 558 aa  58.9  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000300518 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5728  Ig family protein  30 
 
 		 646 aa  58.9  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.972475  normal  0.254446 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2528  hypothetical protein  29.82 
 
 		 221 aa  58.5  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00180911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2794  hypothetical protein  25.41 
 
 		 725 aa  57  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.423654 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4867  hypothetical protein  25.71 
 
 		 657 aa  56.6  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.863369 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2401  polymorphic outer membrane protein  37.68 
 
 		 362 aa  56.2  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2766  hypothetical protein  26.13 
 
 		 1106 aa  56.2  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000116349  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0385  metallophosphoesterase  29.07 
 
 		 701 aa  56.2  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00164005  normal  0.49014 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4332  hypothetical protein  32.61 
 
 		 477 aa  55.8  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252215  normal  0.0577257 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0572  hypothetical protein  29.38 
 
 		 347 aa  55.5  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6753  hypothetical protein  26.13 
 
 		 876 aa  55.1  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.21551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4219  hypothetical protein  26.97 
 
 		 466 aa  54.3  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.958199 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2409  hypothetical protein  28.16 
 
 		 336 aa  54.3  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00135262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1468  hypothetical protein  33.66 
 
 		 523 aa  54.3  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.92132  hitchhiker  0.00194181 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1610  polymorphic outer membrane protein  31.4 
 
 		 433 aa  54.3  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00898059 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6600  hypothetical protein  31.9 
 
 		 398 aa  53.9  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2314  polymorphic outer membrane protein  26.25 
 
 		 541 aa  53.5  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3654  polymorphic outer membrane protein  29.07 
 
 		 462 aa  53.1  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00892124  hitchhiker  0.00240143 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4774  hypothetical protein  31.88 
 
 		 473 aa  53.1  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0272932  decreased coverage  0.0000356618 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>