13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2766 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2766  hypothetical protein  100 
 
 		 1106 aa  2232    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000116349  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1704  polymorphic outer membrane protein  24.44 
 
 		 1755 aa  57.8  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.041755  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0723  hypothetical protein  26.13 
 
 		 1318 aa  56.2  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.661776 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3649  fibronectin type III domain-containing protein  35.79 
 
 		 700 aa  56.2  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.483287  normal  0.101583 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1787  polymorphic outer membrane protein  33.33 
 
 		 1332 aa  55.1  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3111  hypothetical protein  27.78 
 
 		 446 aa  52  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2051  hypothetical protein  32.8 
 
 		 1076 aa  49.3  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.890498  normal  0.473227 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2640  hypothetical protein  34.95 
 
 		 497 aa  48.1  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.310714  normal  0.0812139 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1788  polymorphic membrane protein  44.44 
 
 		 1092 aa  47.8  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4084  hypothetical protein  26.11 
 
 		 392 aa  47  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.104378  normal  0.0942398 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2850  hypothetical protein  30.08 
 
 		 665 aa  46.6  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0361  hypothetical protein  25.64 
 
 		 341 aa  46.2  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2283  polymorphic outer membrane protein  31.11 
 
 		 1296 aa  45.1  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>