77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5728 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5728  Ig family protein  100 
 
 		 646 aa  1277    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.972475  normal  0.254446 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0535  hypothetical protein  45.62 
 
 		 1003 aa  176  9.999999999999999e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.525327 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4118  hypothetical protein  46.12 
 
 		 755 aa  173  7.999999999999999e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.637469 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2337  hypothetical protein  46.2 
 
 		 1147 aa  159  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00625396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1757  hypothetical protein  48.78 
 
 		 341 aa  158  3e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.154893 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2409  hypothetical protein  45 
 
 		 336 aa  157  5.0000000000000005e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00135262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1341  conserved repeat domain protein  43.26 
 
 		 1668 aa  155  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.831003 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4535  hypothetical protein  41.99 
 
 		 333 aa  145  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.896481 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1942  hypothetical protein  43.02 
 
 		 501 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.507224 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1579  hypothetical protein  40.56 
 
 		 394 aa  139  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.039353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1747  hypothetical protein  42.29 
 
 		 495 aa  137  4e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3308  hypothetical protein  36.36 
 
 		 340 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0537  hypothetical protein  40.19 
 
 		 1029 aa  133  7.999999999999999e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.244955  normal  0.441829 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0384  hypothetical protein  42.31 
 
 		 700 aa  133  7.999999999999999e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000000171472  normal  0.22141 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2120  hypothetical protein  39.66 
 
 		 362 aa  128  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0532  hypothetical protein  35.91 
 
 		 757 aa  127  6e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0519891  normal  0.677455 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3748  hypothetical protein  39.77 
 
 		 371 aa  126  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.012971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1660  hypothetical protein  39.11 
 
 		 491 aa  124  5e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2527  FG-GAP repeat protein  40.34 
 
 		 1433 aa  124  6e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000205902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2179  hypothetical protein  35.79 
 
 		 541 aa  124  7e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2183  hypothetical protein  39.01 
 
 		 571 aa  123  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2050  FG-GAP repeat protein  40 
 
 		 1437 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5291  hypothetical protein  35.75 
 
 		 736 aa  118  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.775862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4867  hypothetical protein  41.82 
 
 		 657 aa  118  3.9999999999999997e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.863369 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2283  polymorphic outer membrane protein  34.57 
 
 		 1296 aa  115  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5663  hypothetical protein  35.71 
 
 		 324 aa  110  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3746  Ig family protein  32.19 
 
 		 3542 aa  104  4e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1919  hypothetical protein  36.59 
 
 		 308 aa  102  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.608638 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2655  Spore coat protein CotH  31.67 
 
 		 1174 aa  101  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4541  hypothetical protein  32.46 
 
 		 996 aa  92  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.444049  normal  0.286675 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0617  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.08 
 
 		 1773 aa  91.7  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.716673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1758  lipoprotein  34.75 
 
 		 933 aa  90.1  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.25404 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6007  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.23 
 
 		 1015 aa  89.7  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00134837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5606  hypothetical protein  41.28 
 
 		 408 aa  89  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3347  hypothetical protein  36.11 
 
 		 477 aa  89.4  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.702063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0821  hypothetical protein  32.2 
 
 		 1055 aa  88.6  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.661621  normal  0.324111 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4609  hypothetical protein  31.53 
 
 		 543 aa  86.3  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.318539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1648  hypothetical protein  30.69 
 
 		 707 aa  84.3  0.000000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.255436  normal  0.0205712 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2105  glycoside hydrolase family 9  31.58 
 
 		 803 aa  84  0.000000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.867838  normal  0.536914 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1853  lipoprotein  33.33 
 
 		 558 aa  82.4  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0367597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2139  CHU large protein, SAP or adhesin AidA-related  28.65 
 
 		 688 aa  81.3  0.00000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.534536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3003  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  40.38 
 
 		 900 aa  80.5  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1867  lipoprotein  33.33 
 
 		 634 aa  79.3  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0502  lipoprotein  36.2 
 
 		 1575 aa  78.2  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.620204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2528  hypothetical protein  39.82 
 
 		 221 aa  76.6  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00180911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4401  lipolytic protein G-D-S-L family  28.96 
 
 		 728 aa  75.9  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6006  hypothetical protein  30.81 
 
 		 366 aa  76.3  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5604  hypothetical protein  35.48 
 
 		 1294 aa  75.5  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1580  hypothetical protein  33.87 
 
 		 601 aa  75.5  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000412506  normal  0.738361 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2066  metallophosphoesterase  32.82 
 
 		 686 aa  74.3  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4181  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  30.57 
 
 		 570 aa  74.3  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.100139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4214  hypothetical protein  37.9 
 
 		 376 aa  73.9  0.000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.208947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5262  hypothetical protein  30.32 
 
 		 1215 aa  72.8  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.653834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0718  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.82 
 
 		 1783 aa  71.2  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.281324  normal  0.533675 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1906  lipoprotein  29.52 
 
 		 647 aa  71.2  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2027  hypothetical protein  26.97 
 
 		 693 aa  70.1  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4322  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.37 
 
 		 1797 aa  68.9  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000460936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0726  hypothetical protein  31.03 
 
 		 1263 aa  68.9  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.434756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0352  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  28.65 
 
 		 665 aa  67.8  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.259474  normal  0.181219 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6753  hypothetical protein  31.18 
 
 		 876 aa  67.4  0.0000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.21551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6600  hypothetical protein  28.04 
 
 		 398 aa  66.6  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2656  hypothetical protein  30.56 
 
 		 571 aa  66.2  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0572  hypothetical protein  28.14 
 
 		 347 aa  65.1  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6114  hypothetical protein  29.15 
 
 		 367 aa  64.3  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.513941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2437  hypothetical protein  29.82 
 
 		 846 aa  63.5  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6092  hypothetical protein  31.45 
 
 		 254 aa  62.8  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2349  hypothetical protein  36.61 
 
 		 230 aa  60.1  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0736668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0723  hypothetical protein  30 
 
 		 1318 aa  59.3  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.661776 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2067  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  34.55 
 
 		 687 aa  58.2  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0385  metallophosphoesterase  24.38 
 
 		 701 aa  58.5  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00164005  normal  0.49014 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2794  hypothetical protein  24.88 
 
 		 725 aa  57.8  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.423654 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6627  hypothetical protein  26.59 
 
 		 523 aa  58.2  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.665855 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3327  hypothetical protein  27.68 
 
 		 428 aa  49.7  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.802157  normal  0.933717 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6992  hypothetical protein  21.81 
 
 		 1087 aa  47.8  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160611  normal  0.0433397 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0312  hypothetical protein  35.16 
 
 		 3563 aa  44.7  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61904 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2450  APHP  36.78 
 
 		 1619 aa  44.7  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.804574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3148  FG-GAP repeat protein  33.77 
 
 		 1348 aa  43.9  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.589686  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>