More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0617 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_0617  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  100 
 
 
1773 aa  3664    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.716673  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4322  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  43.31 
 
 
1797 aa  1368    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000460936  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0718  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  43.4 
 
 
1783 aa  1434    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.281324  normal  0.533675 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1484  hypothetical protein  28.93 
 
 
937 aa  224  9.999999999999999e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0188972  normal  0.663437 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4242  hypothetical protein  28.17 
 
 
903 aa  188  6e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.37715  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  28.48 
 
 
2552 aa  182  7e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0937  KP-43 peptidase  26.23 
 
 
1351 aa  144  9.999999999999999e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.215277  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0383  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.61 
 
 
1726 aa  141  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3524  peptidase S8 and S53  29.31 
 
 
1748 aa  136  5e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0087  S-layer domain protein  30.11 
 
 
1223 aa  134  1.0000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0130  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.55 
 
 
1231 aa  134  2.0000000000000002e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.231553  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2527  FG-GAP repeat protein  39.34 
 
 
1433 aa  132  5.0000000000000004e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000205902  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2129  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.78 
 
 
1328 aa  120  1.9999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3548  APHP domain-containing protein  29.04 
 
 
1613 aa  120  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.107963  normal  0.0158906 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3015  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.73 
 
 
835 aa  116  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000302047  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3099  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.45 
 
 
1016 aa  116  3e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4157  S-layer domain protein  30.99 
 
 
1204 aa  114  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00151258 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1341  conserved repeat domain protein  31.78 
 
 
1668 aa  112  5e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.831003 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2364  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.77 
 
 
1234 aa  112  9.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00562436  hitchhiker  0.0000368528 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2337  hypothetical protein  38.8 
 
 
1147 aa  111  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00625396  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1747  hypothetical protein  33.85 
 
 
495 aa  111  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5991  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.99 
 
 
1343 aa  110  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3748  hypothetical protein  35.96 
 
 
371 aa  109  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.012971  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2120  hypothetical protein  39.23 
 
 
362 aa  109  5e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2655  Spore coat protein CotH  38.67 
 
 
1174 aa  108  7e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4118  hypothetical protein  35.23 
 
 
755 aa  108  9e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.637469 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2409  hypothetical protein  35.75 
 
 
336 aa  105  7e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00135262  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4867  hypothetical protein  35.14 
 
 
657 aa  105  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.863369 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1660  hypothetical protein  35.8 
 
 
491 aa  104  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1942  hypothetical protein  32.57 
 
 
501 aa  103  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.507224 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2179  hypothetical protein  35.03 
 
 
541 aa  102  5e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0537  hypothetical protein  36.36 
 
 
1029 aa  101  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.244955  normal  0.441829 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3479  KP-43 peptidase  27.03 
 
 
697 aa  100  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1579  hypothetical protein  34.46 
 
 
394 aa  96.3  5e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.039353  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5990  hypothetical protein  29.47 
 
 
925 aa  95.9  6e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.671162 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0384  hypothetical protein  37.36 
 
 
700 aa  94.7  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000000171472  normal  0.22141 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0535  hypothetical protein  33.71 
 
 
1003 aa  93.6  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.525327 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4418  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.71 
 
 
2171 aa  93.2  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1757  hypothetical protein  31.15 
 
 
341 aa  93.2  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.154893 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1275  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.61 
 
 
509 aa  92.8  5e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0258128  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4417  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.33 
 
 
2182 aa  92.8  6e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0085  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.7 
 
 
866 aa  92.4  7e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5291  hypothetical protein  29.94 
 
 
736 aa  92  8e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.775862  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5728  Ig family protein  31.08 
 
 
646 aa  91.7  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.972475  normal  0.254446 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2283  polymorphic outer membrane protein  37.58 
 
 
1296 aa  91.3  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4535  hypothetical protein  33.15 
 
 
333 aa  90.1  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.896481 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2050  FG-GAP repeat protein  34.73 
 
 
1437 aa  90.1  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5604  hypothetical protein  29.82 
 
 
1294 aa  88.2  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3308  hypothetical protein  32.2 
 
 
340 aa  88.2  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3219  fibronectin type III domain-containing protein  26.45 
 
 
2030 aa  87.4  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.341316  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5663  hypothetical protein  31.43 
 
 
324 aa  87.4  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0821  hypothetical protein  29.72 
 
 
1055 aa  85.9  0.000000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.661621  normal  0.324111 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2139  CHU large protein, SAP or adhesin AidA-related  27.49 
 
 
688 aa  85.9  0.000000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.534536  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6007  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.66 
 
 
1015 aa  85.5  0.000000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00134837  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3347  hypothetical protein  38.6 
 
 
477 aa  85.1  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.702063  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1792  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  47.12 
 
 
686 aa  84  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0554398 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0572  hypothetical protein  29.8 
 
 
347 aa  84  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2183  hypothetical protein  33.33 
 
 
571 aa  83.6  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0532  hypothetical protein  29.03 
 
 
757 aa  83.6  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0519891  normal  0.677455 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2192  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.77 
 
 
576 aa  81.6  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5262  hypothetical protein  34.03 
 
 
1215 aa  81.6  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.653834  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8183  Subtilisin-like protein serine protease-like protein  29.35 
 
 
1239 aa  79.7  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.574663  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4312  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.85 
 
 
1253 aa  80.1  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.338305 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1827  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.34 
 
 
1054 aa  79.3  0.0000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.426628  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3502  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  33.07 
 
 
1106 aa  79  0.0000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.250656  hitchhiker  0.00117601 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3564  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.28 
 
 
1060 aa  79  0.0000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011774  BCG9842_A0040  minor extracellular protease epr  46.51 
 
 
297 aa  78.6  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0844257 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5606  hypothetical protein  34.19 
 
 
408 aa  78.6  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4541  hypothetical protein  37.4 
 
 
996 aa  78.2  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.444049  normal  0.286675 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1853  lipoprotein  31.21 
 
 
558 aa  77.4  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0367597  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1555  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.67 
 
 
1078 aa  77.8  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.11414  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4109  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.1 
 
 
520 aa  77.8  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.941558 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0927  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.16 
 
 
795 aa  77  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2829  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.09 
 
 
999 aa  77  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0476517  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1919  hypothetical protein  35.71 
 
 
308 aa  75.9  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.608638 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4214  hypothetical protein  27.67 
 
 
376 aa  75.5  0.000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.208947  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2773  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.96 
 
 
997 aa  75.5  0.000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0362893  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4181  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  40.43 
 
 
570 aa  75.5  0.000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.100139  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0357  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.62 
 
 
577 aa  75.1  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1626  hypothetical protein  33.47 
 
 
644 aa  74.7  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3003  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  43.12 
 
 
900 aa  74.7  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1027  hypothetical protein  29.44 
 
 
1525 aa  75.5  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.275206  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0723  hypothetical protein  27.33 
 
 
1318 aa  74.3  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.661776 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2471  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  24.93 
 
 
1489 aa  74.3  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0502  lipoprotein  35.95 
 
 
1575 aa  73.6  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.620204  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1569  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.76 
 
 
806 aa  73.6  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5651  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.38 
 
 
628 aa  73.6  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.460503  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6006  hypothetical protein  34.06 
 
 
366 aa  73.6  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6600  hypothetical protein  28.72 
 
 
398 aa  72.8  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3327  hypothetical protein  25.53 
 
 
428 aa  72  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.802157  normal  0.933717 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1758  lipoprotein  38.39 
 
 
933 aa  72  0.00000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.25404 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0352  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  32.89 
 
 
665 aa  71.2  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.259474  normal  0.181219 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2075  subtilisin  29.49 
 
 
485 aa  70.9  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.734666  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1065  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.82 
 
 
442 aa  70.5  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0314  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  33.97 
 
 
1172 aa  70.1  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.498901  normal  0.380582 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1867  lipoprotein  30.66 
 
 
634 aa  69.7  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1740  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.26 
 
 
1261 aa  68.9  0.0000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.791667  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2066  metallophosphoesterase  30.21 
 
 
686 aa  68.9  0.0000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2794  hypothetical protein  31.9 
 
 
725 aa  68.6  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.423654 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0627  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40 
 
 
1501 aa  68.6  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>