80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4118 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4118  hypothetical protein  100 
 
 		 755 aa  1574    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.637469 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5728  Ig family protein  46.12 
 
 		 646 aa  173  7.999999999999999e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.972475  normal  0.254446 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1942  hypothetical protein  42.86 
 
 		 501 aa  147  7.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.507224 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2409  hypothetical protein  44 
 
 		 336 aa  146  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00135262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2527  FG-GAP repeat protein  41.71 
 
 		 1433 aa  143  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000205902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1757  hypothetical protein  43.18 
 
 		 341 aa  141  3.9999999999999997e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.154893 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1341  conserved repeat domain protein  40.68 
 
 		 1668 aa  139  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.831003 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1747  hypothetical protein  43.2 
 
 		 495 aa  134  6.999999999999999e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3308  hypothetical protein  35.64 
 
 		 340 aa  132  3e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2337  hypothetical protein  41.38 
 
 		 1147 aa  131  5.0000000000000004e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00625396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1660  hypothetical protein  38.86 
 
 		 491 aa  128  4.0000000000000003e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5663  hypothetical protein  37.08 
 
 		 324 aa  127  5e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1579  hypothetical protein  35.92 
 
 		 394 aa  126  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.039353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4535  hypothetical protein  35.91 
 
 		 333 aa  126  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.896481 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2179  hypothetical protein  36.52 
 
 		 541 aa  123  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3748  hypothetical protein  41.42 
 
 		 371 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.012971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0535  hypothetical protein  34.46 
 
 		 1003 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.525327 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2655  Spore coat protein CotH  35.14 
 
 		 1174 aa  119  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2120  hypothetical protein  37.04 
 
 		 362 aa  118  5e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2283  polymorphic outer membrane protein  39.34 
 
 		 1296 aa  118  5e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4867  hypothetical protein  37.1 
 
 		 657 aa  116  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.863369 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0617  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.23 
 
 		 1773 aa  108  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.716673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1853  lipoprotein  39.75 
 
 		 558 aa  105  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0367597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5291  hypothetical protein  35.8 
 
 		 736 aa  105  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.775862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2050  FG-GAP repeat protein  36.42 
 
 		 1437 aa  105  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0532  hypothetical protein  31.56 
 
 		 757 aa  104  5e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0519891  normal  0.677455 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0384  hypothetical protein  34.81 
 
 		 700 aa  103  8e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000000171472  normal  0.22141 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0537  hypothetical protein  34.64 
 
 		 1029 aa  100  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.244955  normal  0.441829 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5606  hypothetical protein  35.87 
 
 		 408 aa  100  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2183  hypothetical protein  34.16 
 
 		 571 aa  99.4  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1919  hypothetical protein  55.06 
 
 		 308 aa  97.1  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.608638 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0352  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  30.13 
 
 		 665 aa  95.9  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.259474  normal  0.181219 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1580  hypothetical protein  31 
 
 		 601 aa  94  8e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000412506  normal  0.738361 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2139  CHU large protein, SAP or adhesin AidA-related  31.84 
 
 		 688 aa  93.2  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.534536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0821  hypothetical protein  34.07 
 
 		 1055 aa  92.4  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.661621  normal  0.324111 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1867  lipoprotein  34.57 
 
 		 634 aa  92  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5523  beta-lactamase  25.64 
 
 		 929 aa  90.1  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.904088  normal  0.44531 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3347  hypothetical protein  31.79 
 
 		 477 aa  89.4  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.702063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2794  hypothetical protein  31.9 
 
 		 725 aa  88.6  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.423654 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4541  hypothetical protein  31.58 
 
 		 996 aa  87  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.444049  normal  0.286675 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2105  glycoside hydrolase family 9  32.37 
 
 		 803 aa  85.9  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.867838  normal  0.536914 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0502  lipoprotein  42.5 
 
 		 1575 aa  85.1  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.620204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4609  hypothetical protein  32.78 
 
 		 543 aa  84.7  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.318539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6007  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.82 
 
 		 1015 aa  84.7  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00134837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2066  metallophosphoesterase  34.04 
 
 		 686 aa  83.2  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2528  hypothetical protein  33.13 
 
 		 221 aa  82.4  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00180911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2656  hypothetical protein  29.56 
 
 		 571 aa  82.4  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5262  hypothetical protein  32.64 
 
 		 1215 aa  82  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.653834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2027  hypothetical protein  29.65 
 
 		 693 aa  82  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1758  lipoprotein  32.58 
 
 		 933 aa  81.6  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.25404 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5604  hypothetical protein  33.15 
 
 		 1294 aa  80.5  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6006  hypothetical protein  36.03 
 
 		 366 aa  78.6  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4401  lipolytic protein G-D-S-L family  29.02 
 
 		 728 aa  79  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2349  hypothetical protein  33.14 
 
 		 230 aa  72.8  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0736668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0718  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.98 
 
 		 1783 aa  73.2  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.281324  normal  0.533675 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2437  hypothetical protein  29.29 
 
 		 846 aa  70.5  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4214  hypothetical protein  34.92 
 
 		 376 aa  70.1  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.208947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3003  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  28.14 
 
 		 900 aa  69.7  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0726  hypothetical protein  30.91 
 
 		 1263 aa  68.9  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.434756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4322  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.91 
 
 		 1797 aa  68.6  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000460936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1906  lipoprotein  28.73 
 
 		 647 aa  67.8  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4181  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  37.76 
 
 		 570 aa  67.4  0.0000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.100139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6114  hypothetical protein  30.33 
 
 		 367 aa  67.4  0.0000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.513941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0572  hypothetical protein  29.48 
 
 		 347 aa  67  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2259  Carbohydrate binding family 6  37.08 
 
 		 713 aa  64.3  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0723  hypothetical protein  28.79 
 
 		 1318 aa  63.2  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.661776 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6092  hypothetical protein  33.93 
 
 		 254 aa  60.1  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6627  hypothetical protein  25.71 
 
 		 523 aa  60.5  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.665855 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3327  hypothetical protein  27.54 
 
 		 428 aa  60.1  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.802157  normal  0.933717 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0385  metallophosphoesterase  28.89 
 
 		 701 aa  58.9  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00164005  normal  0.49014 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6753  hypothetical protein  27.51 
 
 		 876 aa  57.8  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.21551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1204  hypothetical protein  30.95 
 
 		 782 aa  56.2  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.980122 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2067  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  32.23 
 
 		 687 aa  54.7  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6600  hypothetical protein  31.62 
 
 		 398 aa  52  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3146  FG-GAP repeat protein  36.11 
 
 		 1337 aa  51.2  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3536  Carbohydrate binding family 6  34.25 
 
 		 726 aa  47.8  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.414252  normal  0.419471 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3148  FG-GAP repeat protein  31.94 
 
 		 1348 aa  46.6  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.589686  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05870  hypothetical protein  28.72 
 
 		 243 aa  46.2  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09473  fat protein-possibly involved in cell-cell attachment  38.03 
 
 		 1441 aa  45.4  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1784  hypothetical protein  29.25 
 
 		 550 aa  43.9  0.01  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.135796  normal  0.121637 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>