More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5523 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5523  beta-lactamase  100 
 
 		 929 aa  1919    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.904088  normal  0.44531 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0488  beta-lactamase  33.99 
 
 		 382 aa  160  8e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2617  beta-lactamase  31.69 
 
 		 352 aa  105  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00306284  normal  0.438823 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4118  hypothetical protein  25.64 
 
 		 755 aa  89.7  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.637469 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5714  beta-lactamase  26.45 
 
 		 446 aa  76.3  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5693  beta-lactamase  30.99 
 
 		 415 aa  72.4  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.21234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2573  beta-lactamase  31.36 
 
 		 476 aa  71.6  0.00000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.369136  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4308  beta-lactamase  36.29 
 
 		 459 aa  70.9  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0244726  normal  0.721784 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5715  beta-lactamase  26.48 
 
 		 437 aa  69.7  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0772  beta-lactamase  26.17 
 
 		 431 aa  69.7  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3873  amino acid adenylation domain protein  29.17 
 
 		 5698 aa  68.2  0.0000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.166545 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2231  beta-lactamase  25.5 
 
 		 384 aa  68.2  0.0000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3177  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  27.01 
 
 		 484 aa  68.2  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.075148  normal  0.866618 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5618  beta-lactamase  24.34 
 
 		 456 aa  67.8  0.0000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.357665  normal  0.013094 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3512  beta-lactamase  27.14 
 
 		 364 aa  67.8  0.0000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5870  hypothetical protein  27.54 
 
 		 785 aa  67.4  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0925  beta-lactamase, putative  27.18 
 
 		 790 aa  66.6  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2019  fmtA-like protein  24.89 
 
 		 505 aa  66.2  0.000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.15249  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0624  beta-lactamase  26.61 
 
 		 370 aa  65.9  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.540607  normal  0.110236 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3032  beta-lactamase  24.07 
 
 		 507 aa  66.2  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.436003 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0570  beta-lactamase  24.09 
 
 		 438 aa  65.5  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0831  beta-lactamase  24.24 
 
 		 445 aa  65.9  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.23283  normal  0.655791 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0589  beta-lactamase  24.19 
 
 		 438 aa  65.5  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6218  hypothetical protein  27.4 
 
 		 792 aa  65.1  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6025  beta-lactamase  25 
 
 		 460 aa  65.5  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.565651 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0538  beta-lactamase  22.76 
 
 		 433 aa  65.1  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0045  beta-lactamase  23.99 
 
 		 374 aa  65.1  0.000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.975073  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0011  beta-lactamase  20.75 
 
 		 427 aa  65.1  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000120746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0294  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  29.58 
 
 		 834 aa  65.1  0.000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00108534  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1896  beta-lactamase  24.37 
 
 		 425 aa  65.1  0.000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.227365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2480  beta-lactamase  23.35 
 
 		 411 aa  64.7  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26212 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37770  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  25.31 
 
 		 366 aa  64.7  0.000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.269534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3518  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  28.79 
 
 		 508 aa  63.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3485  beta-lactamase  25.41 
 
 		 440 aa  63.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.807296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0637  beta-lactamase  23.1 
 
 		 424 aa  63.2  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000302256  normal  0.230717 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0759  putative beta-lactamase class C penicillin binding protein  25.22 
 
 		 498 aa  63.5  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445171  normal  0.118882 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2389  cyclic peptide transporter  27.75 
 
 		 1032 aa  62.8  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5169  beta-lactamase  27.15 
 
 		 382 aa  62.8  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1876  beta-lactamase  33.57 
 
 		 493 aa  62.4  0.00000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35970  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  29.27 
 
 		 582 aa  62  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.796833  normal  0.223324 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1969  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  25.96 
 
 		 414 aa  62  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.980127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0961  twin-arginine translocation pathway signal  22.35 
 
 		 431 aa  62  0.00000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.205968  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3511  beta-lactamase  23.61 
 
 		 364 aa  61.6  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.700919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5348  beta-lactamase  24.4 
 
 		 414 aa  61.6  0.00000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.635001  normal  0.0848814 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3205  beta-lactamase  22.08 
 
 		 407 aa  61.6  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6088  beta-lactamase  24.08 
 
 		 406 aa  61.6  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.496561  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2359  beta-lactamase  22.48 
 
 		 411 aa  61.2  0.00000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4687  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.39 
 
 		 373 aa  61.2  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  29.29 
 
 		 578 aa  61.2  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1713  beta-lactamase  23.79 
 
 		 347 aa  60.8  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2265  beta-lactamase  24.07 
 
 		 407 aa  60.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3534  amino acid adenylation  27.16 
 
 		 2457 aa  60.5  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1460  beta-lactamase  26.58 
 
 		 523 aa  60.8  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0171679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8721  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  31.34 
 
 		 480 aa  60.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2708  Beta-lactamase  25.51 
 
 		 436 aa  60.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.259785  normal  0.385071 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3256  beta-lactamase  24.48 
 
 		 420 aa  59.7  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.748817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3669  beta-lactamase  30.72 
 
 		 507 aa  59.7  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0660  beta-lactamase  23.58 
 
 		 395 aa  60.1  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.775643  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5369  beta-lactamase  25.48 
 
 		 432 aa  59.7  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.545883 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3749  beta-lactamase  24.07 
 
 		 401 aa  60.1  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0280744 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0319  putative beta-lactamase  28.7 
 
 		 455 aa  59.7  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.833917  normal  0.501894 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2357  beta-lactamase  25.08 
 
 		 368 aa  59.3  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2315  beta-lactamase  27.53 
 
 		 440 aa  58.9  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00477679  hitchhiker  0.0000358597 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0412  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  26.04 
 
 		 422 aa  58.9  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0814  beta-lactamase  22.05 
 
 		 422 aa  58.9  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0349  beta-lactamase  24.8 
 
 		 407 aa  59.3  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0439  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidease, putative  27.56 
 
 		 381 aa  58.9  0.0000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.737656  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1364  beta-lactamase  24.82 
 
 		 574 aa  58.9  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.185265  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3477  beta-lactamase  23.36 
 
 		 409 aa  59.3  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.295738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0812  beta-lactamase  23.65 
 
 		 408 aa  58.9  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.623448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0627  beta-lactamase  27.04 
 
 		 566 aa  58.5  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3215  beta-lactamase  27.1 
 
 		 405 aa  58.5  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000372743  hitchhiker  0.00147977 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4649  Beta-lactamase  23.98 
 
 		 418 aa  58.5  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8711  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  24.71 
 
 		 383 aa  58.5  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0541056  normal  0.0995944 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3817  beta-lactamase  23.66 
 
 		 364 aa  58.5  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1923  beta-lactamase  29.23 
 
 		 389 aa  58.2  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0383  Beta-lactamase class C related penicillin binding protein  24.14 
 
 		 337 aa  58.2  0.0000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0471  beta-lactam binding protein AmpH  26.03 
 
 		 385 aa  57.8  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.598882  normal  0.181498 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5593  beta-lactamase  26.67 
 
 		 480 aa  57.8  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5607  hypothetical protein  25.73 
 
 		 784 aa  57.8  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3866  beta-lactamase  23.58 
 
 		 388 aa  57.8  0.0000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4865  beta-lactamase  24.48 
 
 		 405 aa  57.4  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00560097 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0555  penicillin-binding protein, putative  27.42 
 
 		 413 aa  57.4  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.389605  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3507  penicillin-binding protein, putative  31.25 
 
 		 375 aa  57.4  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6210  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  30.49 
 
 		 391 aa  57.8  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.126759  normal  0.402021 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3149  beta-lactamase  25.51 
 
 		 430 aa  57.4  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.360137  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2468  beta-lactamase  30.06 
 
 		 498 aa  57.4  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00176956  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5786  beta-lactamase family protein  24.39 
 
 		 420 aa  57.4  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0584533 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0419  beta-lactamase  26.53 
 
 		 416 aa  57.4  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2516  beta-lactamase  30.06 
 
 		 498 aa  57.4  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000422279  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2312  beta-lactamase  32.59 
 
 		 406 aa  57.4  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3157  beta-lactamase  26.16 
 
 		 345 aa  57.4  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00126272  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3517  beta-lactamase  22.71 
 
 		 447 aa  57.8  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3704  beta-lactamase  23.75 
 
 		 407 aa  56.6  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.136974  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1690  beta-lactamase  23.03 
 
 		 426 aa  57  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0468  beta-lactamase  21.63 
 
 		 455 aa  57  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000926021 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2440  beta-lactamase  24.19 
 
 		 422 aa  56.6  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4689  beta-lactamase  29.79 
 
 		 374 aa  57  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0791767  normal  0.116144 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3518  putative penicillin-binding protein  31.25 
 
 		 377 aa  56.6  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0558  putative penicillin-binding protein  27.42 
 
 		 413 aa  56.6  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.622752  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>