More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5693 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_5693  beta-lactamase  100 
 
 
415 aa  780    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.21234  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1664  beta-lactamase  66.67 
 
 
348 aa  402  1e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.15284 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35970  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  41.23 
 
 
582 aa  224  3e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.796833  normal  0.223324 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1364  beta-lactamase  37.94 
 
 
574 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.185265  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0270  beta-lactamase  42.49 
 
 
717 aa  210  3e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0627  beta-lactamase  38.78 
 
 
566 aa  203  4e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1366  beta-lactamase  41.08 
 
 
591 aa  195  1e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.416084  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2615  hypothetical protein  38.04 
 
 
793 aa  186  6e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.377093  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3117  beta-lactamase  37.57 
 
 
361 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.577011  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2604  beta-lactamase  41.14 
 
 
354 aa  170  5e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.928872  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1740  beta-lactamase  36.09 
 
 
379 aa  169  1e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20140  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  39.83 
 
 
371 aa  169  1e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.44906  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0925  beta-lactamase  38.92 
 
 
966 aa  169  1e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1870  beta-lactamase  37.6 
 
 
390 aa  168  2e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.375615 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2362  beta-lactamase  38.08 
 
 
357 aa  159  6e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1830  beta-lactamase  37.31 
 
 
452 aa  159  7e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.162579  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2172  beta-lactamase  37.2 
 
 
428 aa  159  7e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.65714  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1874  beta-lactamase  36.39 
 
 
379 aa  157  3e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00999528 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1697  beta-lactamase  36.31 
 
 
381 aa  156  6e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.570462  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4539  hypothetical protein  38.13 
 
 
796 aa  155  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00469106 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4406  hypothetical protein  38.13 
 
 
796 aa  155  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.343081  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0660  beta-lactamase  33.15 
 
 
395 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.775643  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0301  beta-lactamase  36.67 
 
 
351 aa  152  8e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4515  beta-lactamase  41.5 
 
 
369 aa  150  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.942067 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0439  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidease, putative  33.53 
 
 
381 aa  150  5e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.737656  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0714  beta-lactamase  35.64 
 
 
392 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5870  hypothetical protein  38.41 
 
 
785 aa  146  6e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2616  beta-lactamase  34.1 
 
 
366 aa  144  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.763267 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4038  beta-lactamase  40.68 
 
 
374 aa  144  3e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0954  Beta-lactamase  34.16 
 
 
416 aa  144  4e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1790  beta-lactamase  34.91 
 
 
483 aa  144  4e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0797219 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6218  hypothetical protein  37.54 
 
 
792 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0925  beta-lactamase, putative  36.14 
 
 
790 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0591  beta-lactamase  36.2 
 
 
360 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000780172  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2506  beta-lactamase  39.32 
 
 
344 aa  139  1e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0477  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidease, putative  32.22 
 
 
385 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.765713  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2194  beta-lactamase  38.98 
 
 
334 aa  137  3.0000000000000003e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.724545  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2426  beta-lactamase  34.38 
 
 
459 aa  136  6.0000000000000005e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00208801  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2255  beta-lactamase  32.13 
 
 
379 aa  135  9e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.234898  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2152  beta-lactamase  36.11 
 
 
409 aa  135  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.129133 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0439  beta-lactamase  36.31 
 
 
397 aa  135  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0784108 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34700  putative beta lactamase  36.62 
 
 
391 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00182422  normal  0.248771 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5607  hypothetical protein  35.28 
 
 
784 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1252  beta-lactamase  36.36 
 
 
389 aa  133  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0579433 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1231  beta-lactamase  31.7 
 
 
434 aa  130  6e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2585  hypothetical protein  32.08 
 
 
433 aa  129  7.000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1249  hypothetical protein  31.7 
 
 
434 aa  129  8.000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.303061 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1238  beta-lactamase  33.78 
 
 
361 aa  129  1.0000000000000001e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0242548 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2113  beta-lactamase  28.68 
 
 
597 aa  127  3e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.226997 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2566  hypothetical protein  31.41 
 
 
434 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4160  hypothetical protein  32.19 
 
 
818 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000766166  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0547  beta-lactamase  31.83 
 
 
375 aa  127  4.0000000000000003e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.727644  normal  0.917223 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2716  hypothetical protein  31.41 
 
 
434 aa  127  5e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1105  beta-lactamase  35.17 
 
 
389 aa  126  7e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2711  hypothetical protein  31.58 
 
 
432 aa  126  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.27035  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2737  hypothetical protein  31.58 
 
 
432 aa  126  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2844  hypothetical protein  31.58 
 
 
432 aa  126  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2671  hypothetical protein  31.58 
 
 
432 aa  126  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0479  beta-lactamase  30.06 
 
 
603 aa  125  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000533746  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1543  beta-lactamase  30.31 
 
 
651 aa  125  1e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3459  beta-lactamase  34.83 
 
 
394 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0213623 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0383  Beta-lactamase class C related penicillin binding protein  31.99 
 
 
337 aa  124  2e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2622  hypothetical protein  31.29 
 
 
432 aa  125  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1797  beta-lactamase  32.76 
 
 
391 aa  124  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0148599  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2047  hypothetical protein  29.38 
 
 
395 aa  124  4e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0829987  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1692  beta-lactamase  32.32 
 
 
531 aa  124  4e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.499627  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0495  beta-lactamase  34.84 
 
 
471 aa  124  4e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3660  hypothetical protein  31.21 
 
 
434 aa  123  7e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1715  beta-lactamase  31.79 
 
 
528 aa  122  8e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.102688  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1201  beta-lactamase  27.6 
 
 
665 aa  122  8e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1761  beta-lactamase  31.79 
 
 
528 aa  122  8e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.775747  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0839  beta-lactamase  29.94 
 
 
1012 aa  122  8e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1529  beta-lactamase  34.43 
 
 
381 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.303701  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1979  beta-lactamase  35.79 
 
 
398 aa  121  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.663801  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2589  beta-lactamase  35.79 
 
 
398 aa  121  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.224311  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2487  beta-lactamase  32.13 
 
 
408 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6825  beta-lactamase  36.41 
 
 
382 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0708  beta-lactamase  35.92 
 
 
396 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0410275  normal  0.41428 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3564  beta-lactamase  32.92 
 
 
397 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5895  beta-lactamase  31.59 
 
 
496 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3750  beta-lactamase  35.26 
 
 
397 aa  117  5e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.697979  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1850  Beta-lactamase class C or other penicillin binding protein  29.62 
 
 
338 aa  116  8.999999999999998e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000532294  hitchhiker  0.000116253 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2687  beta-lactamase  33.77 
 
 
381 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000287138 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2590  beta-lactamase  35.59 
 
 
333 aa  113  6e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4206  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.38 
 
 
1018 aa  113  7.000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2095  hypothetical protein  28 
 
 
484 aa  112  1.0000000000000001e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.187143  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0013  b-glucosidase  29.02 
 
 
990 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2956  esterase  34.1 
 
 
384 aa  111  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0198492  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2613  beta-lactamase  35.03 
 
 
398 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0402  beta-lactamase  35.46 
 
 
392 aa  111  3e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00394756  normal  0.302831 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2637  beta-lactamase  34.27 
 
 
398 aa  111  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3034  beta-lactamase  35.31 
 
 
413 aa  109  7.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396527  normal  0.941046 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5392  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.89 
 
 
953 aa  109  8.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3541  beta-lactamase  36.13 
 
 
394 aa  109  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.437558  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3257  beta-lactamase  29.69 
 
 
430 aa  109  1e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1018  beta-lactamase  33.44 
 
 
461 aa  108  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.624623 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35880  Beta-lactamase-like protein  32.26 
 
 
396 aa  107  3e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.184718  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4045  beta-lactamase  33.42 
 
 
393 aa  107  5e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2708  beta-lactamase  24.8 
 
 
992 aa  107  5e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1251  Beta-lactamase class C related penicillin binding protein  28.12 
 
 
377 aa  105  1e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000000000135632  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>