More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1664 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1664  beta-lactamase  100 
 
 		 348 aa  667    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.15284 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5693  beta-lactamase  65.86 
 
 		 415 aa  384  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.21234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35970  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  43.54 
 
 		 582 aa  232  7.000000000000001e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.796833  normal  0.223324 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0270  beta-lactamase  43.7 
 
 		 717 aa  220  3.9999999999999997e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1364  beta-lactamase  37.36 
 
 		 574 aa  210  3e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.185265  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0627  beta-lactamase  41 
 
 		 566 aa  210  3e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2615  hypothetical protein  35.71 
 
 		 793 aa  184  3e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.377093  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3117  beta-lactamase  41.52 
 
 		 361 aa  177  2e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.577011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1366  beta-lactamase  38.04 
 
 		 591 aa  175  9e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.416084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2362  beta-lactamase  40.75 
 
 		 357 aa  170  4e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2604  beta-lactamase  42.04 
 
 		 354 aa  170  4e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.928872  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1830  beta-lactamase  37.61 
 
 		 452 aa  169  8e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.162579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2172  beta-lactamase  37.61 
 
 		 428 aa  168  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.65714  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2194  beta-lactamase  40.92 
 
 		 334 aa  164  1.0000000000000001e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.724545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4515  beta-lactamase  44.63 
 
 		 369 aa  162  6e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.942067 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1870  beta-lactamase  39.04 
 
 		 390 aa  160  3e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.375615 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20140  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  41.42 
 
 		 371 aa  158  1e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.44906  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0591  beta-lactamase  38.18 
 
 		 360 aa  156  6e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000780172  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0925  beta-lactamase  39 
 
 		 966 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4038  beta-lactamase  44.67 
 
 		 374 aa  151  2e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4160  hypothetical protein  34.53 
 
 		 818 aa  150  5e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000766166  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0660  beta-lactamase  34.42 
 
 		 395 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.775643  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2590  beta-lactamase  40.06 
 
 		 333 aa  147  3e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2506  beta-lactamase  41.56 
 
 		 344 aa  147  4.0000000000000006e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0301  beta-lactamase  35.73 
 
 		 351 aa  145  9e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2047  hypothetical protein  33.96 
 
 		 395 aa  143  4e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0829987  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2687  beta-lactamase  36.86 
 
 		 381 aa  143  5e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000287138 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1529  beta-lactamase  36.18 
 
 		 381 aa  142  7e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.303701  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1249  hypothetical protein  33.33 
 
 		 434 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.303061 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1231  beta-lactamase  32.23 
 
 		 434 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5607  hypothetical protein  35.1 
 
 		 784 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4406  hypothetical protein  36.47 
 
 		 796 aa  139  7.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.343081  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4539  hypothetical protein  36.47 
 
 		 796 aa  139  7.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00469106 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2566  hypothetical protein  33.04 
 
 		 434 aa  139  8.999999999999999e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0954  Beta-lactamase  34.64 
 
 		 416 aa  138  1e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1874  beta-lactamase  31.2 
 
 		 379 aa  139  1e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999528 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1797  beta-lactamase  36.24 
 
 		 391 aa  137  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0148599  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2716  hypothetical protein  33.04 
 
 		 434 aa  137  2e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1697  beta-lactamase  33.01 
 
 		 381 aa  135  7.000000000000001e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.570462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6218  hypothetical protein  36.84 
 
 		 792 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2616  beta-lactamase  33.82 
 
 		 366 aa  135  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.763267 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0925  beta-lactamase, putative  37.05 
 
 		 790 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1740  beta-lactamase  32.56 
 
 		 379 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2585  hypothetical protein  31.98 
 
 		 433 aa  134  3e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2426  beta-lactamase  32.91 
 
 		 459 aa  134  3e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00208801  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5870  hypothetical protein  36.43 
 
 		 785 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2487  beta-lactamase  35.33 
 
 		 408 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1790  beta-lactamase  33.33 
 
 		 483 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0797219 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0714  beta-lactamase  33.33 
 
 		 392 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0439  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidease, putative  33.9 
 
 		 381 aa  130  3e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.737656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3660  hypothetical protein  31.98 
 
 		 434 aa  130  3e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0839  beta-lactamase  33.02 
 
 		 1012 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3459  beta-lactamase  37.91 
 
 		 394 aa  130  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0213623 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0383  Beta-lactamase class C related penicillin binding protein  31.99 
 
 		 337 aa  129  6e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2255  beta-lactamase  31.76 
 
 		 379 aa  129  9.000000000000001e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.234898  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1238  beta-lactamase  31.69 
 
 		 361 aa  128  1.0000000000000001e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0242548 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0444  beta-lactamase  32.31 
 
 		 339 aa  127  2.0000000000000002e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1543  beta-lactamase  28.38 
 
 		 651 aa  125  9e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0439  beta-lactamase  32.36 
 
 		 397 aa  125  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0784108 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0479  beta-lactamase  30.03 
 
 		 603 aa  124  3e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000533746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0477  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidease, putative  33.33 
 
 		 385 aa  122  8e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.765713  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4196  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.87 
 
 		 1002 aa  121  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.690171 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1201  beta-lactamase  27.84 
 
 		 665 aa  120  1.9999999999999998e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2113  beta-lactamase  27.47 
 
 		 597 aa  120  3e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.226997 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2711  hypothetical protein  29.34 
 
 		 432 aa  120  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.27035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2622  hypothetical protein  29.34 
 
 		 432 aa  119  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2671  hypothetical protein  29.34 
 
 		 432 aa  119  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2844  hypothetical protein  29.34 
 
 		 432 aa  119  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2737  hypothetical protein  29.34 
 
 		 432 aa  119  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2152  beta-lactamase  32.6 
 
 		 409 aa  118  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.129133 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0547  beta-lactamase  31.69 
 
 		 375 aa  117  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.727644  normal  0.917223 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4206  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.54 
 
 		 1018 aa  115  7.999999999999999e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3827  beta-lactamase  36.42 
 
 		 326 aa  115  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0809801  normal  0.0296333 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2095  hypothetical protein  27.81 
 
 		 484 aa  114  2.0000000000000002e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.187143  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0495  beta-lactamase  33.24 
 
 		 471 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3257  beta-lactamase  30.75 
 
 		 430 aa  115  2.0000000000000002e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4212  beta-lactamase  37.8 
 
 		 343 aa  112  9e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3808  beta-lactamase  35.26 
 
 		 323 aa  112  9e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00436578 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1850  Beta-lactamase class C or other penicillin binding protein  26.82 
 
 		 338 aa  112  1.0000000000000001e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000532294  hitchhiker  0.000116253 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0471  beta-lactamase  27.14 
 
 		 336 aa  110  5e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3512  beta-lactamase  35.05 
 
 		 547 aa  108  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.265184  normal  0.161703 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6825  beta-lactamase  34.79 
 
 		 382 aa  108  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2708  beta-lactamase  26.87 
 
 		 992 aa  107  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1018  beta-lactamase  33.91 
 
 		 461 aa  107  4e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.624623 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0456  beta-lactamase  29.96 
 
 		 395 aa  105  8e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1251  Beta-lactamase class C related penicillin binding protein  29.22 
 
 		 377 aa  105  9e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000000000135632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0253  beta-lactamase  32.4 
 
 		 395 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0579  beta-lactamase  29.51 
 
 		 395 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.521189  normal  0.351765 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0708  beta-lactamase  32.14 
 
 		 396 aa  103  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0410275  normal  0.41428 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0013  b-glucosidase  28.53 
 
 		 990 aa  103  5e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1713  beta-lactamase  30.43 
 
 		 347 aa  102  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5392  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.22 
 
 		 953 aa  102  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3541  beta-lactamase  38.41 
 
 		 394 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.437558  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11048  putative hydrolase/beta lactamase fusion protein  25.2 
 
 		 971 aa  100  3e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.199531  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34700  putative beta lactamase  32.71 
 
 		 391 aa  100  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00182422  normal  0.248771 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1690  beta-lactamase  29.78 
 
 		 426 aa  100  5e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3564  beta-lactamase  31.32 
 
 		 397 aa  99.8  6e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3394  Beta-lactamase  36.66 
 
 		 394 aa  99.8  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3130  beta-lactamase  35.28 
 
 		 304 aa  98.6  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1130  beta-lactamase  34.11 
 
 		 355 aa  99  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>