More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2616 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_2616  beta-lactamase  100 
 
 
366 aa  751    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.763267 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0925  beta-lactamase  42.25 
 
 
966 aa  261  1e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1874  beta-lactamase  38.18 
 
 
379 aa  244  9.999999999999999e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00999528 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0660  beta-lactamase  38.15 
 
 
395 aa  243  3.9999999999999997e-63  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.775643  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2255  beta-lactamase  37.57 
 
 
379 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.234898  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1697  beta-lactamase  37.57 
 
 
381 aa  243  5e-63  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.570462  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1740  beta-lactamase  38.26 
 
 
379 aa  240  4e-62  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0477  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidease, putative  36.03 
 
 
385 aa  232  8.000000000000001e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.765713  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0439  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidease, putative  35.01 
 
 
381 aa  213  2.9999999999999995e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.737656  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1364  beta-lactamase  36.29 
 
 
574 aa  209  6e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.185265  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1238  beta-lactamase  36.29 
 
 
361 aa  201  9.999999999999999e-51  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0242548 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2615  hypothetical protein  35.86 
 
 
793 aa  201  1.9999999999999998e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.377093  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2604  beta-lactamase  38 
 
 
354 aa  200  3.9999999999999996e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.928872  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5392  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.14 
 
 
953 aa  194  2e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2172  beta-lactamase  38.17 
 
 
428 aa  189  5.999999999999999e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.65714  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1830  beta-lactamase  38.17 
 
 
452 aa  189  7e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.162579  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0627  beta-lactamase  37.79 
 
 
566 aa  189  8e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1870  beta-lactamase  35.78 
 
 
390 aa  187  2e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.375615 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4539  hypothetical protein  36 
 
 
796 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00469106 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0547  beta-lactamase  34.62 
 
 
375 aa  184  2.0000000000000003e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.727644  normal  0.917223 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4406  hypothetical protein  36 
 
 
796 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.343081  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0591  beta-lactamase  35.77 
 
 
360 aa  183  3e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000780172  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1790  beta-lactamase  35.33 
 
 
483 aa  181  2e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0797219 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2113  beta-lactamase  30.79 
 
 
597 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.226997 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4206  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.03 
 
 
1018 aa  177  2e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2047  hypothetical protein  37.74 
 
 
395 aa  176  7e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0829987  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0714  beta-lactamase  33.81 
 
 
392 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0839  beta-lactamase  30.31 
 
 
1012 aa  172  6.999999999999999e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0925  beta-lactamase, putative  36.23 
 
 
790 aa  171  1e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1439  hypothetical protein  29.28 
 
 
1007 aa  171  1e-41  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00938781 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3117  beta-lactamase  36.14 
 
 
361 aa  171  2e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.577011  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3459  beta-lactamase  34.03 
 
 
394 aa  170  4e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0213623 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1797  beta-lactamase  33.05 
 
 
391 aa  170  4e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0148599  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1529  beta-lactamase  35.36 
 
 
381 aa  169  7e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.303701  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2426  beta-lactamase  36.01 
 
 
459 aa  168  1e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00208801  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35970  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  36.84 
 
 
582 aa  168  1e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.796833  normal  0.223324 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3541  beta-lactamase  35.42 
 
 
394 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.437558  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3257  beta-lactamase  32.87 
 
 
430 aa  167  2.9999999999999998e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0270  beta-lactamase  32.17 
 
 
717 aa  166  6.9999999999999995e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3477  beta-lactamase  34.9 
 
 
394 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2687  beta-lactamase  35.28 
 
 
381 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000287138 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2362  beta-lactamase  34.53 
 
 
357 aa  163  5.0000000000000005e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5607  hypothetical protein  33.91 
 
 
784 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0479  beta-lactamase  30.73 
 
 
603 aa  162  1e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000533746  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4196  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.11 
 
 
1002 aa  161  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.690171 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6218  hypothetical protein  38.49 
 
 
792 aa  161  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0013  b-glucosidase  29.1 
 
 
990 aa  160  2e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1715  beta-lactamase  30.16 
 
 
528 aa  160  4e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.102688  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1761  beta-lactamase  30.16 
 
 
528 aa  160  4e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.775747  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5870  hypothetical protein  36.99 
 
 
785 aa  159  8e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0954  Beta-lactamase  35.03 
 
 
416 aa  157  3e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0301  beta-lactamase  34.66 
 
 
351 aa  157  3e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1692  beta-lactamase  29.42 
 
 
531 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.499627  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5693  beta-lactamase  35.74 
 
 
415 aa  155  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.21234  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11048  putative hydrolase/beta lactamase fusion protein  26.74 
 
 
971 aa  155  2e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.199531  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0439  beta-lactamase  33.33 
 
 
397 aa  154  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0784108 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3394  Beta-lactamase  33.59 
 
 
394 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1543  beta-lactamase  31.66 
 
 
651 aa  150  3e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4515  beta-lactamase  34.97 
 
 
369 aa  150  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.942067 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2487  beta-lactamase  33.43 
 
 
408 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1231  beta-lactamase  32.35 
 
 
434 aa  146  5e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1249  hypothetical protein  32.35 
 
 
434 aa  146  5e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.303061 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2585  hypothetical protein  30.35 
 
 
433 aa  146  6e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2566  hypothetical protein  30.35 
 
 
434 aa  146  6e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2716  hypothetical protein  30.35 
 
 
434 aa  146  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1366  beta-lactamase  35.91 
 
 
591 aa  146  7.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.416084  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5895  beta-lactamase  29.02 
 
 
496 aa  145  9e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1201  beta-lactamase  30.47 
 
 
665 aa  145  1e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2708  beta-lactamase  25.13 
 
 
992 aa  144  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2622  hypothetical protein  32.38 
 
 
432 aa  144  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3660  hypothetical protein  32.03 
 
 
434 aa  143  5e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2844  hypothetical protein  32.48 
 
 
432 aa  142  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2737  hypothetical protein  32.48 
 
 
432 aa  141  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2671  hypothetical protein  32.48 
 
 
432 aa  142  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1850  Beta-lactamase class C or other penicillin binding protein  30.42 
 
 
338 aa  141  1.9999999999999998e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000532294  hitchhiker  0.000116253 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2711  hypothetical protein  32.48 
 
 
432 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.27035  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20140  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  36.7 
 
 
371 aa  140  3e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.44906  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0495  beta-lactamase  28.27 
 
 
471 aa  140  3e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2095  hypothetical protein  29.55 
 
 
484 aa  138  1e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.187143  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1664  beta-lactamase  35.97 
 
 
348 aa  139  1e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.15284 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2506  beta-lactamase  34.57 
 
 
344 aa  137  2e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0471  beta-lactamase  31.41 
 
 
336 aa  136  7.000000000000001e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4819  glycoside hydrolase family 3 protein  26.44 
 
 
997 aa  135  9.999999999999999e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4160  hypothetical protein  29.95 
 
 
818 aa  134  3e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000766166  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0011  glycosy hydrolase family protein  32.49 
 
 
1003 aa  133  3.9999999999999996e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.417282 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0383  Beta-lactamase class C related penicillin binding protein  34.64 
 
 
337 aa  133  5e-30  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2194  beta-lactamase  31.16 
 
 
334 aa  132  7.999999999999999e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.724545  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3659  beta-lactamase  31.8 
 
 
374 aa  126  5e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4807  beta-lactamase  25.71 
 
 
434 aa  124  3e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1483  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.01 
 
 
976 aa  122  9.999999999999999e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.430226  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1251  Beta-lactamase class C related penicillin binding protein  26.84 
 
 
377 aa  117  1.9999999999999998e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000000000135632  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0444  beta-lactamase  27.78 
 
 
339 aa  117  3.9999999999999997e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1713  beta-lactamase  32.48 
 
 
347 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4038  beta-lactamase  30.79 
 
 
374 aa  111  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1130  beta-lactamase  27.86 
 
 
355 aa  110  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2590  beta-lactamase  31.4 
 
 
333 aa  107  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3130  beta-lactamase  31.79 
 
 
304 aa  107  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3512  beta-lactamase  29.51 
 
 
547 aa  107  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.265184  normal  0.161703 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0624  beta-lactamase  28.49 
 
 
370 aa  106  5e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.540607  normal  0.110236 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3511  beta-lactamase  27.99 
 
 
364 aa  105  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.700919  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>