More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_3659 on replicon NC_013923
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013923  Nmag_3659  beta-lactamase  100 
 
 
374 aa  760    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2615  hypothetical protein  32.31 
 
 
793 aa  157  4e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.377093  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5607  hypothetical protein  35.78 
 
 
784 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1797  beta-lactamase  29.33 
 
 
391 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0148599  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4539  hypothetical protein  31.37 
 
 
796 aa  137  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00469106 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4406  hypothetical protein  31.37 
 
 
796 aa  137  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.343081  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0714  beta-lactamase  29.53 
 
 
392 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0925  beta-lactamase  32.13 
 
 
966 aa  133  6e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1529  beta-lactamase  29.03 
 
 
381 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.303701  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2687  beta-lactamase  28.95 
 
 
381 aa  129  7.000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000287138 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1870  beta-lactamase  32.34 
 
 
390 aa  127  2.0000000000000002e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.375615 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2047  hypothetical protein  32.98 
 
 
395 aa  127  3e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0829987  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35970  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  33 
 
 
582 aa  127  3e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.796833  normal  0.223324 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2616  beta-lactamase  32.9 
 
 
366 aa  125  8.000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.763267 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0925  beta-lactamase, putative  33.02 
 
 
790 aa  125  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5870  hypothetical protein  32.83 
 
 
785 aa  125  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1238  beta-lactamase  31.1 
 
 
361 aa  124  4e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0242548 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2172  beta-lactamase  30.12 
 
 
428 aa  123  5e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.65714  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1830  beta-lactamase  30.12 
 
 
452 aa  123  6e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.162579  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0954  Beta-lactamase  30.69 
 
 
416 aa  122  9e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0439  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidease, putative  28.1 
 
 
381 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.737656  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6218  hypothetical protein  33.13 
 
 
792 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3257  beta-lactamase  27.47 
 
 
430 aa  120  6e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0495  beta-lactamase  27.46 
 
 
471 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1790  beta-lactamase  26.74 
 
 
483 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0797219 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0591  beta-lactamase  29.75 
 
 
360 aa  115  8.999999999999998e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000780172  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2487  beta-lactamase  27.99 
 
 
408 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1697  beta-lactamase  27.94 
 
 
381 aa  115  1.0000000000000001e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.570462  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1364  beta-lactamase  29.66 
 
 
574 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.185265  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5895  beta-lactamase  27.54 
 
 
496 aa  114  3e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1874  beta-lactamase  26.51 
 
 
379 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00999528 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0270  beta-lactamase  31.03 
 
 
717 aa  113  6e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0660  beta-lactamase  26.79 
 
 
395 aa  113  7.000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.775643  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2604  beta-lactamase  30.08 
 
 
354 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.928872  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0477  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidease, putative  28 
 
 
385 aa  109  8.000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.765713  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0471  beta-lactamase  27.71 
 
 
336 aa  108  1e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2426  beta-lactamase  26.33 
 
 
459 aa  108  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00208801  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0627  beta-lactamase  29.17 
 
 
566 aa  108  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1366  beta-lactamase  30.3 
 
 
591 aa  107  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.416084  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0383  Beta-lactamase class C related penicillin binding protein  28.85 
 
 
337 aa  107  4e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1740  beta-lactamase  27.42 
 
 
379 aa  106  6e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1692  beta-lactamase  26.34 
 
 
531 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.499627  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2194  beta-lactamase  29.77 
 
 
334 aa  104  3e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.724545  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0439  beta-lactamase  29.12 
 
 
397 aa  104  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0784108 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2506  beta-lactamase  32.55 
 
 
344 aa  103  4e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2113  beta-lactamase  24.92 
 
 
597 aa  103  5e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.226997 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4038  beta-lactamase  35.62 
 
 
374 aa  102  8e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5392  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.15 
 
 
953 aa  102  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1715  beta-lactamase  26.33 
 
 
528 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.102688  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1761  beta-lactamase  26.33 
 
 
528 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.775747  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0444  beta-lactamase  27.62 
 
 
339 aa  101  2e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2255  beta-lactamase  27.42 
 
 
379 aa  100  3e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.234898  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0839  beta-lactamase  26.23 
 
 
1012 aa  100  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4206  glycoside hydrolase family 3 domain protein  26.92 
 
 
1018 aa  99.8  7e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4807  beta-lactamase  24.21 
 
 
434 aa  98.6  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1664  beta-lactamase  31.17 
 
 
348 aa  97.4  4e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.15284 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1850  Beta-lactamase class C or other penicillin binding protein  26.92 
 
 
338 aa  96.7  5e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000532294  hitchhiker  0.000116253 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20140  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  31.14 
 
 
371 aa  94.7  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.44906  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3459  beta-lactamase  28.03 
 
 
394 aa  94  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0213623 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5693  beta-lactamase  31.35 
 
 
415 aa  94.4  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.21234  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1130  beta-lactamase  27.73 
 
 
355 aa  92.8  9e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2362  beta-lactamase  29.9 
 
 
357 aa  92.4  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2590  beta-lactamase  31.12 
 
 
333 aa  92  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4515  beta-lactamase  30.38 
 
 
369 aa  91.7  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.942067 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1713  beta-lactamase  26.73 
 
 
347 aa  90.5  5e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1543  beta-lactamase  25.13 
 
 
651 aa  90.1  5e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3117  beta-lactamase  29.67 
 
 
361 aa  89.7  7e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.577011  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0479  beta-lactamase  24.1 
 
 
603 aa  89  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000533746  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11048  putative hydrolase/beta lactamase fusion protein  22.45 
 
 
971 aa  87  4e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.199531  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1629  hypothetical protein  25.82 
 
 
318 aa  87.4  4e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000178179  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1251  Beta-lactamase class C related penicillin binding protein  25.76 
 
 
377 aa  86.3  9e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000000000135632  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1729  hypothetical protein  26.5 
 
 
309 aa  84.7  0.000000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00956707  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4212  beta-lactamase  28.35 
 
 
343 aa  83.2  0.000000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0547  beta-lactamase  28.08 
 
 
375 aa  83.2  0.000000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.727644  normal  0.917223 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0624  beta-lactamase  28.22 
 
 
370 aa  81.6  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.540607  normal  0.110236 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0318  beta-lactamase  27.92 
 
 
365 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.180634 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0013  b-glucosidase  25.38 
 
 
990 aa  81.6  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3511  beta-lactamase  27.02 
 
 
364 aa  81.6  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.700919  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2298  beta-lactamase  25.42 
 
 
440 aa  80.1  0.00000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.322057  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4819  glycoside hydrolase family 3 protein  24.76 
 
 
997 aa  79.7  0.00000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3808  beta-lactamase  29.82 
 
 
323 aa  79  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00436578 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1551  beta-lactamase  27.24 
 
 
375 aa  77.4  0.0000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0670758  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2708  beta-lactamase  20.8 
 
 
992 aa  77.4  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5150  beta-lactamase  28.3 
 
 
369 aa  77  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.175198  normal  0.654906 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4160  hypothetical protein  26.4 
 
 
818 aa  77  0.0000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000766166  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2095  hypothetical protein  23.37 
 
 
484 aa  75.9  0.000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.187143  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0011  glycosy hydrolase family protein  26.15 
 
 
1003 aa  75.5  0.000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.417282 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0412  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  26.71 
 
 
422 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3394  Beta-lactamase  27.41 
 
 
394 aa  74.7  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3477  beta-lactamase  27.79 
 
 
394 aa  73.9  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0483  putative penicillin-binding protein  26.37 
 
 
412 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1201  beta-lactamase  23.33 
 
 
665 aa  73.6  0.000000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2716  hypothetical protein  24.29 
 
 
434 aa  73.2  0.000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0502  penicillin-binding protein  26.37 
 
 
412 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0473  penicillin-binding protein  26.37 
 
 
421 aa  73.2  0.000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2737  hypothetical protein  23.39 
 
 
432 aa  72.8  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0159  beta-lactamase  22.12 
 
 
410 aa  72.8  0.000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3541  beta-lactamase  28.41 
 
 
394 aa  72.8  0.000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.437558  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2671  hypothetical protein  23.39 
 
 
432 aa  72.4  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1249  hypothetical protein  23.97 
 
 
434 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.303061 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>