More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1543 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_1543  beta-lactamase  100 
 
 		 651 aa  1323    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1201  beta-lactamase  43.74 
 
 		 665 aa  462  1e-129  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1231  beta-lactamase  46.64 
 
 		 434 aa  403  1e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2716  hypothetical protein  46.64 
 
 		 434 aa  404  1e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1249  hypothetical protein  46.64 
 
 		 434 aa  402  1e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.303061 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2585  hypothetical protein  46.4 
 
 		 433 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2737  hypothetical protein  47.07 
 
 		 432 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2566  hypothetical protein  46.4 
 
 		 434 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2671  hypothetical protein  46.83 
 
 		 432 aa  398  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2622  hypothetical protein  46.83 
 
 		 432 aa  397  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2844  hypothetical protein  46.83 
 
 		 432 aa  398  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2711  hypothetical protein  47.07 
 
 		 432 aa  399  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.27035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3660  hypothetical protein  46.17 
 
 		 434 aa  395  1e-108  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2095  hypothetical protein  42.04 
 
 		 484 aa  349  8e-95  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.187143  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4160  hypothetical protein  34.67 
 
 		 818 aa  306  1.0000000000000001e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000766166  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0925  beta-lactamase  30.59 
 
 		 966 aa  184  3e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1364  beta-lactamase  32.89 
 
 		 574 aa  179  2e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.185265  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35970  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  31.96 
 
 		 582 aa  177  4e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.796833  normal  0.223324 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4206  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.33 
 
 		 1018 aa  176  9.999999999999999e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0839  beta-lactamase  32.2 
 
 		 1012 aa  176  1.9999999999999998e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1238  beta-lactamase  31.9 
 
 		 361 aa  172  2e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0242548 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2172  beta-lactamase  31.1 
 
 		 428 aa  172  2e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.65714  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1830  beta-lactamase  31.1 
 
 		 452 aa  172  2e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.162579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0660  beta-lactamase  31.22 
 
 		 395 aa  169  2e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.775643  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0270  beta-lactamase  30.45 
 
 		 717 aa  166  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0627  beta-lactamase  31.54 
 
 		 566 aa  164  5.0000000000000005e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1366  beta-lactamase  32.02 
 
 		 591 aa  160  8e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.416084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0479  beta-lactamase  31.2 
 
 		 603 aa  159  1e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000533746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0477  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidease, putative  29.97 
 
 		 385 aa  153  1e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.765713  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1740  beta-lactamase  29.7 
 
 		 379 aa  152  2e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2615  hypothetical protein  31.27 
 
 		 793 aa  149  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.377093  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3117  beta-lactamase  28.46 
 
 		 361 aa  148  3e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.577011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5392  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.32 
 
 		 953 aa  148  3e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2604  beta-lactamase  28.95 
 
 		 354 aa  147  9e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.928872  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0013  b-glucosidase  28.38 
 
 		 990 aa  145  3e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5607  hypothetical protein  30.82 
 
 		 784 aa  144  4e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0439  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidease, putative  27.81 
 
 		 381 aa  143  8e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.737656  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1790  beta-lactamase  28.28 
 
 		 483 aa  143  9.999999999999999e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0797219 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0925  beta-lactamase, putative  27.72 
 
 		 790 aa  141  3e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1874  beta-lactamase  29.62 
 
 		 379 aa  140  7e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999528 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2047  hypothetical protein  27.59 
 
 		 395 aa  139  2e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0829987  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1439  hypothetical protein  27.91 
 
 		 1007 aa  139  2e-31  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00938781 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6218  hypothetical protein  30.43 
 
 		 792 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2487  beta-lactamase  28.07 
 
 		 408 aa  138  3.0000000000000003e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2113  beta-lactamase  29.79 
 
 		 597 aa  138  4e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.226997 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0714  beta-lactamase  27.32 
 
 		 392 aa  137  8e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0011  glycosy hydrolase family protein  27.25 
 
 		 1003 aa  136  9.999999999999999e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.417282 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5870  hypothetical protein  29.64 
 
 		 785 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0591  beta-lactamase  30.56 
 
 		 360 aa  134  3.9999999999999996e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000780172  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2255  beta-lactamase  28.34 
 
 		 379 aa  134  6e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.234898  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1797  beta-lactamase  28.3 
 
 		 391 aa  133  7.999999999999999e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0148599  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2426  beta-lactamase  29.58 
 
 		 459 aa  133  1.0000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00208801  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0954  Beta-lactamase  30.23 
 
 		 416 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1850  Beta-lactamase class C or other penicillin binding protein  29.19 
 
 		 338 aa  131  3e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000532294  hitchhiker  0.000116253 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2616  beta-lactamase  31.66 
 
 		 366 aa  131  5.0000000000000004e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.763267 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2687  beta-lactamase  27.81 
 
 		 381 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000287138 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4196  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.54 
 
 		 1002 aa  130  8.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.690171 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1715  beta-lactamase  26.79 
 
 		 528 aa  130  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.102688  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1761  beta-lactamase  26.79 
 
 		 528 aa  130  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.775747  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3257  beta-lactamase  29.62 
 
 		 430 aa  129  1.0000000000000001e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1870  beta-lactamase  26.88 
 
 		 390 aa  129  2.0000000000000002e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.375615 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2362  beta-lactamase  28.21 
 
 		 357 aa  129  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11048  putative hydrolase/beta lactamase fusion protein  27.31 
 
 		 971 aa  129  2.0000000000000002e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.199531  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0383  Beta-lactamase class C related penicillin binding protein  28.61 
 
 		 337 aa  129  2.0000000000000002e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0547  beta-lactamase  28.01 
 
 		 375 aa  129  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.727644  normal  0.917223 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4539  hypothetical protein  29.69 
 
 		 796 aa  128  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00469106 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4406  hypothetical protein  29.69 
 
 		 796 aa  128  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.343081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1529  beta-lactamase  27.81 
 
 		 381 aa  128  4.0000000000000003e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.303701  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5693  beta-lactamase  30.94 
 
 		 415 aa  125  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.21234  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1664  beta-lactamase  28.38 
 
 		 348 aa  125  3e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.15284 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3512  beta-lactamase  28.32 
 
 		 547 aa  122  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.265184  normal  0.161703 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4515  beta-lactamase  31.46 
 
 		 369 aa  122  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.942067 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1692  beta-lactamase  26.45 
 
 		 531 aa  121  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.499627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0301  beta-lactamase  25.47 
 
 		 351 aa  120  7e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1697  beta-lactamase  28.8 
 
 		 381 aa  120  7.999999999999999e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.570462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0439  beta-lactamase  24.88 
 
 		 397 aa  117  6.9999999999999995e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0784108 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2194  beta-lactamase  29.85 
 
 		 334 aa  116  1.0000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.724545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2506  beta-lactamase  29.34 
 
 		 344 aa  112  2.0000000000000002e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4819  glycoside hydrolase family 3 protein  29.1 
 
 		 997 aa  111  4.0000000000000004e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0495  beta-lactamase  24.06 
 
 		 471 aa  109  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2708  beta-lactamase  27.22 
 
 		 992 aa  106  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0444  beta-lactamase  26.91 
 
 		 339 aa  105  3e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3459  beta-lactamase  26.71 
 
 		 394 aa  105  4e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0213623 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0637  beta-lactamase  29.46 
 
 		 424 aa  101  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000302256  normal  0.230717 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3517  beta-lactamase  26.21 
 
 		 447 aa  99.4  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4807  beta-lactamase  26.38 
 
 		 434 aa  98.2  4e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2019  fmtA-like protein  29.64 
 
 		 505 aa  97.8  5e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.15249  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3541  beta-lactamase  26.28 
 
 		 394 aa  97.4  6e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.437558  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1881  beta-lactamase  24.62 
 
 		 613 aa  97.4  8e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.234575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0582  beta-lactamase  24.84 
 
 		 431 aa  96.3  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5895  beta-lactamase  24.46 
 
 		 496 aa  96.3  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3006  beta-lactamase  26 
 
 		 423 aa  95.5  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3606  beta-lactamase  27.68 
 
 		 419 aa  94.7  4e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000041879  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1251  Beta-lactamase class C related penicillin binding protein  26.43 
 
 		 377 aa  94.7  5e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000000000135632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1923  beta-lactamase  26.48 
 
 		 389 aa  94.4  7e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1729  hypothetical protein  25.47 
 
 		 309 aa  92.4  2e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00956707  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3751  beta-lactamase  25.33 
 
 		 395 aa  92.8  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000498352 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3477  beta-lactamase  26.02 
 
 		 394 aa  92.4  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3394  Beta-lactamase  26.74 
 
 		 394 aa  92.4  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2516  beta-lactamase  28.63 
 
 		 498 aa  91.7  4e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000422279  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>