More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG1729 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG1729  hypothetical protein  100 
 
 
309 aa  637    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00956707  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1629  hypothetical protein  56.07 
 
 
318 aa  327  1.0000000000000001e-88  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000178179  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2334  hypothetical protein  46.71 
 
 
318 aa  266  2.9999999999999995e-70  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000883594  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0444  beta-lactamase  32.06 
 
 
339 aa  161  1e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1251  Beta-lactamase class C related penicillin binding protein  33.55 
 
 
377 aa  157  2e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000000000135632  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0383  Beta-lactamase class C related penicillin binding protein  32.1 
 
 
337 aa  150  3e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1850  Beta-lactamase class C or other penicillin binding protein  33.85 
 
 
338 aa  137  2e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000532294  hitchhiker  0.000116253 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0925  beta-lactamase  29.66 
 
 
966 aa  125  6e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4406  hypothetical protein  29.2 
 
 
796 aa  122  8e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.343081  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4539  hypothetical protein  29.2 
 
 
796 aa  122  8e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00469106 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0925  beta-lactamase, putative  29.1 
 
 
790 aa  122  8e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0439  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidease, putative  28.7 
 
 
381 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.737656  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2615  hypothetical protein  30.69 
 
 
793 aa  119  4.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.377093  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2426  beta-lactamase  30.41 
 
 
459 aa  119  7e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00208801  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35970  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  30.07 
 
 
582 aa  118  9.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.796833  normal  0.223324 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2487  beta-lactamase  27.25 
 
 
408 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0660  beta-lactamase  29.47 
 
 
395 aa  115  8.999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.775643  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5607  hypothetical protein  31.34 
 
 
784 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1830  beta-lactamase  28.53 
 
 
452 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.162579  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1790  beta-lactamase  27.83 
 
 
483 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0797219 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4212  beta-lactamase  28.97 
 
 
343 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2172  beta-lactamase  28.53 
 
 
428 aa  114  3e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.65714  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2047  hypothetical protein  27.13 
 
 
395 aa  109  7.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0829987  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1874  beta-lactamase  28.79 
 
 
379 aa  107  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00999528 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1797  beta-lactamase  29 
 
 
391 aa  107  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0148599  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0954  Beta-lactamase  27.1 
 
 
416 aa  106  4e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2362  beta-lactamase  27.86 
 
 
357 aa  106  4e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3117  beta-lactamase  27.63 
 
 
361 aa  106  5e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.577011  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1740  beta-lactamase  26.99 
 
 
379 aa  104  1e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6218  hypothetical protein  32.13 
 
 
792 aa  103  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0714  beta-lactamase  26.56 
 
 
392 aa  102  6e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5870  hypothetical protein  31.65 
 
 
785 aa  101  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1364  beta-lactamase  29.93 
 
 
574 aa  100  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.185265  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0495  beta-lactamase  26.83 
 
 
471 aa  100  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2255  beta-lactamase  27.19 
 
 
379 aa  99  1e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.234898  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0270  beta-lactamase  26.69 
 
 
717 aa  98.2  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1238  beta-lactamase  24.78 
 
 
361 aa  98.2  2e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0242548 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4515  beta-lactamase  27.05 
 
 
369 aa  97.1  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.942067 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1870  beta-lactamase  24.49 
 
 
390 aa  95.9  8e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.375615 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1697  beta-lactamase  27.33 
 
 
381 aa  95.5  1e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.570462  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1130  beta-lactamase  26.27 
 
 
355 aa  94.4  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0471  beta-lactamase  27.91 
 
 
336 aa  94  3e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0301  beta-lactamase  24.46 
 
 
351 aa  92.8  6e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0220  putative secreted esterase  26.71 
 
 
339 aa  92.8  7e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.146113  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1543  beta-lactamase  25.47 
 
 
651 aa  92.4  9e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1366  beta-lactamase  26.64 
 
 
591 aa  91.7  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.416084  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0477  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidease, putative  24.85 
 
 
385 aa  90.1  4e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.765713  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0627  beta-lactamase  27.01 
 
 
566 aa  90.1  4e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2616  beta-lactamase  25.15 
 
 
366 aa  89.7  6e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.763267 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5895  beta-lactamase  26.02 
 
 
496 aa  86.7  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1692  beta-lactamase  25.78 
 
 
531 aa  86.3  6e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.499627  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1715  beta-lactamase  24.76 
 
 
528 aa  85.9  8e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.102688  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1761  beta-lactamase  24.76 
 
 
528 aa  85.9  8e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.775747  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2604  beta-lactamase  27.01 
 
 
354 aa  84.3  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.928872  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3257  beta-lactamase  24.74 
 
 
430 aa  84  0.000000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4038  beta-lactamase  25.62 
 
 
374 aa  83.2  0.000000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1529  beta-lactamase  27.34 
 
 
381 aa  82.8  0.000000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.303701  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3659  beta-lactamase  25.8 
 
 
374 aa  80.9  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2687  beta-lactamase  26.57 
 
 
381 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000287138 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4206  glycoside hydrolase family 3 domain protein  24.48 
 
 
1018 aa  80.1  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2194  beta-lactamase  26.37 
 
 
334 aa  80.5  0.00000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.724545  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4160  hypothetical protein  26.48 
 
 
818 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000766166  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0547  beta-lactamase  22.87 
 
 
375 aa  80.1  0.00000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.727644  normal  0.917223 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2716  hypothetical protein  22.71 
 
 
434 aa  79  0.00000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2566  hypothetical protein  22.71 
 
 
434 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0839  beta-lactamase  24.93 
 
 
1012 aa  78.6  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0591  beta-lactamase  22.12 
 
 
360 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000780172  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1201  beta-lactamase  24 
 
 
665 aa  77  0.0000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1249  hypothetical protein  25.93 
 
 
434 aa  77.4  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.303061 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1664  beta-lactamase  25 
 
 
348 aa  76.6  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.15284 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1231  beta-lactamase  26.52 
 
 
434 aa  76.3  0.0000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2585  hypothetical protein  22.71 
 
 
433 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0011  glycosy hydrolase family protein  23.5 
 
 
1003 aa  74.7  0.000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.417282 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3660  hypothetical protein  22.44 
 
 
434 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2113  beta-lactamase  24.47 
 
 
597 aa  74.3  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.226997 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5392  Beta-N-acetylhexosaminidase  22.76 
 
 
953 aa  73.6  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3459  beta-lactamase  22.81 
 
 
394 aa  72.4  0.000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0213623 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2506  beta-lactamase  23.72 
 
 
344 aa  71.6  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0439  beta-lactamase  23.45 
 
 
397 aa  71.6  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0784108 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0013  b-glucosidase  22.22 
 
 
990 aa  71.2  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0097  beta-lactamase  24.36 
 
 
601 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5693  beta-lactamase  23.78 
 
 
415 aa  70.1  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.21234  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3512  beta-lactamase  27.35 
 
 
547 aa  70.5  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.265184  normal  0.161703 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4788  beta-lactamase  26.33 
 
 
400 aa  70.5  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.416977  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3827  beta-lactamase  21.99 
 
 
326 aa  69.7  0.00000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0809801  normal  0.0296333 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20140  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  24.32 
 
 
371 aa  69.3  0.00000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.44906  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0831  beta-lactamase  24.21 
 
 
422 aa  68.9  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.146809  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2737  hypothetical protein  21.17 
 
 
432 aa  68.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2587  putative penicillin-binding protein  26.7 
 
 
463 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35213e-17 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11747  penicillin-binding protein  24.91 
 
 
539 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.47398 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2711  hypothetical protein  21.17 
 
 
432 aa  68.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.27035  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2844  hypothetical protein  21.17 
 
 
432 aa  68.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2671  hypothetical protein  21.17 
 
 
432 aa  68.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2579  penicillin-binding protein, putative  27.22 
 
 
483 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0220569  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2629  putative penicillin-binding protein  26.7 
 
 
490 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0110315  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2143  beta-lactamase  22.88 
 
 
401 aa  68.2  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.559529  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0417  beta-lactam binding protein AmpH  28.44 
 
 
385 aa  68.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.144637 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2622  hypothetical protein  21.17 
 
 
432 aa  68.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0479  beta-lactamase  23.91 
 
 
603 aa  68.2  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000533746  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2316  penicillin-binding protein  26.7 
 
 
481 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181197  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>