More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2143 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2143  beta-lactamase  100 
 
 		 401 aa  807    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.559529  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0951  beta-lactamase  37.46 
 
 		 345 aa  157  3e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0224352  decreased coverage  0.0053447 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1351  beta-lactamase class C-like protein  28.78 
 
 		 384 aa  143  5e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.512666 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1795  beta-lactamase  29.06 
 
 		 494 aa  142  7e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.478102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0759  putative beta-lactamase class C penicillin binding protein  32.07 
 
 		 498 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445171  normal  0.118882 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0116  beta-lactamase  31.36 
 
 		 453 aa  140  3e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4058  beta-lactamase  31.14 
 
 		 405 aa  138  2e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00809672  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3141  beta-lactamase  31.07 
 
 		 447 aa  135  9.999999999999999e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  31.14 
 
 		 487 aa  134  1.9999999999999998e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3274  beta-lactamase  29 
 
 		 524 aa  133  5e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.847415 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4257  beta-lactamase  33.13 
 
 		 464 aa  131  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.240658 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1507  Beta-lactamase  32.15 
 
 		 595 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0097  beta-lactamase  29.01 
 
 		 601 aa  129  6e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1164  beta-lactamase  27.98 
 
 		 501 aa  129  8.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.255434 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  30.92 
 
 		 578 aa  129  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1946  Beta-lactamase  29.41 
 
 		 588 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2252  beta-lactamase  30.36 
 
 		 460 aa  128  2.0000000000000002e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.119961  normal  0.0203286 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2953  beta-lactamase  30.03 
 
 		 513 aa  125  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0622  beta-lactamase  29.8 
 
 		 377 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.357585  normal  0.0394741 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0636  beta-lactam binding protein AmpH  29.9 
 
 		 380 aa  123  7e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.259822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1018  beta-lactamase  30.64 
 
 		 461 aa  121  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.624623 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2758  beta-lactam binding protein AmpH  30.43 
 
 		 388 aa  121  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000277431  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2550  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  33.24 
 
 		 489 aa  122  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1447  beta-lactam binding protein AmpH  30.82 
 
 		 383 aa  121  1.9999999999999998e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000414942  normal  0.794569 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2836  beta-lactam binding protein AmpH  30.43 
 
 		 388 aa  121  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1755  beta-lactamase  32.37 
 
 		 450 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2997  beta-lactamase  29.59 
 
 		 513 aa  119  7e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2932  penicillin-binding protein  26.94 
 
 		 513 aa  119  9e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3422  beta-lactamase  34.49 
 
 		 593 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.126074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3500  beta-lactamase  28.12 
 
 		 600 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.623073  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  30.06 
 
 		 356 aa  117  5e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2481  beta-lactamase  27.47 
 
 		 359 aa  116  6e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1832  beta-lactamase  26.95 
 
 		 446 aa  116  6.9999999999999995e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.29245  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2336  beta-lactamase  28.44 
 
 		 359 aa  116  6.9999999999999995e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0973  beta-lactamase  27.12 
 
 		 514 aa  116  6.9999999999999995e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2207  beta-lactamase  28.94 
 
 		 404 aa  116  7.999999999999999e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.124088  hitchhiker  0.00264676 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5327  beta-lactamase  32.72 
 
 		 440 aa  116  8.999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.620258 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3615  beta-lactamase  33.53 
 
 		 611 aa  116  8.999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0663146 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3243  beta-lactamase family protein  28.4 
 
 		 513 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3027  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.27 
 
 		 406 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.899556  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0831  beta-lactamase  30.14 
 
 		 422 aa  114  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.146809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1298  beta-lactamase  26.11 
 
 		 566 aa  114  3e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3731  beta-lactamase  34.18 
 
 		 603 aa  114  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.227339 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1514  beta-lactamase  27.97 
 
 		 620 aa  114  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00027695  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03210  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  31.33 
 
 		 521 aa  114  4.0000000000000004e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.205122  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4519  beta-lactamase  30.77 
 
 		 451 aa  113  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.302372  normal  0.700128 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1364  beta-lactamase  28.16 
 
 		 574 aa  113  6e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.185265  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5167  beta-lactamase  30.42 
 
 		 713 aa  113  6e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.619685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41280  putative beta-lactamase  29.55 
 
 		 610 aa  113  6e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.607486 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1234  beta-lactamase  28.61 
 
 		 519 aa  112  8.000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.565811  normal  0.301621 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0201  beta-lactamase  28.61 
 
 		 530 aa  112  8.000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.494145 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1783  cyclic peptide transporter  26 
 
 		 1055 aa  112  9e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0903267  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0863  beta-lactamase  31.87 
 
 		 363 aa  112  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0343  beta-lactamase  32.26 
 
 		 482 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0439  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.68 
 
 		 392 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.919528 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1638  beta-lactamase  27.59 
 
 		 485 aa  111  3e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0331332  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2727  beta-lactamase  27.76 
 
 		 486 aa  111  3e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33850  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  30.77 
 
 		 453 aa  110  4.0000000000000004e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2053  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  26.86 
 
 		 385 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00880281  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0099  D-stereospecific peptide hydrolase  27.27 
 
 		 443 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000129924  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2264  hypothetical protein  24.71 
 
 		 485 aa  110  5e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.145649  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1830  beta-lactamase  29.87 
 
 		 452 aa  110  6e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.162579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2172  beta-lactamase  29.87 
 
 		 428 aa  110  6e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.65714  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1357  beta-lactamase  30.72 
 
 		 378 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0999  beta-lactamase  29.63 
 
 		 367 aa  109  9.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0117018 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2019  fmtA-like protein  26.99 
 
 		 505 aa  108  1e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.15249  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4621  beta-lactamase  26.65 
 
 		 377 aa  109  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0889352 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1301  beta-lactamase  33.44 
 
 		 417 aa  108  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207216  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2051  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  26.57 
 
 		 385 aa  108  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.319079  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2381  alkaline D-peptidase  26.89 
 
 		 385 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0825231  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3860  beta-lactamase  26.65 
 
 		 377 aa  108  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.027383 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11747  penicillin-binding protein  27.56 
 
 		 539 aa  108  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.47398 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4133  beta-lactamase  27.08 
 
 		 822 aa  108  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.668063  normal  0.0496796 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2262  hypothetical protein  24.13 
 
 		 485 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.60427e-26 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6008  beta-lactamase  30.09 
 
 		 389 aa  108  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2294  penicillin-binding protein, putative  28.23 
 
 		 434 aa  107  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.272122  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2060  beta-lactamase  25.95 
 
 		 485 aa  107  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.258254  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3512  beta-lactamase  27.79 
 
 		 364 aa  107  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2650  beta-lactamase  30.14 
 
 		 497 aa  107  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0361544  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2415  beta-lactamase  27.16 
 
 		 442 aa  107  4e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0834226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3147  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  28.34 
 
 		 407 aa  107  4e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.943509  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3840  Beta-lactamase  26.65 
 
 		 377 aa  107  5e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2081  hypothetical protein  24.13 
 
 		 485 aa  107  5e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.765888  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2018  penicillin-binding protein  24.12 
 
 		 485 aa  107  5e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2235  hypothetical protein  24.13 
 
 		 485 aa  107  5e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.336147  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0618  beta-lactamase  27.58 
 
 		 450 aa  106  6e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2346  hypothetical protein  24.85 
 
 		 485 aa  106  7e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0051399  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2093  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  28.66 
 
 		 407 aa  106  8e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0154  beta-lactamase  27.46 
 
 		 482 aa  106  9e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2573  fmtA-like protein, putative  27.16 
 
 		 482 aa  105  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00911316  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2018  penicillin-binding protein  23.84 
 
 		 485 aa  105  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.225321  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3175  beta-lactamase  26.49 
 
 		 375 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.702373  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5985  beta-lactamase  24.93 
 
 		 342 aa  105  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7012  beta-lactamase  31.6 
 
 		 467 aa  105  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.858592 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2968  beta-lactamase  28.8 
 
 		 462 aa  105  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2296  alkaline D-peptidase  26.29 
 
 		 385 aa  105  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000100431 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5150  beta-lactamase  29.71 
 
 		 369 aa  104  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.175198  normal  0.654906 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1501  beta-lactamase  29.74 
 
 		 447 aa  105  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.130484  normal  0.872303 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4682  beta-lactamase  26.4 
 
 		 377 aa  105  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2860  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  28.01 
 
 		 385 aa  104  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.28769  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>