More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3141 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3141  beta-lactamase  100 
 
 		 447 aa  921    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2143  beta-lactamase  31.07 
 
 		 401 aa  135  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.559529  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1795  beta-lactamase  27.94 
 
 		 494 aa  127  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.478102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1856  beta-lactamase  30.84 
 
 		 498 aa  124  4e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2252  beta-lactamase  34.93 
 
 		 460 aa  112  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.119961  normal  0.0203286 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0951  beta-lactamase  27.36 
 
 		 345 aa  109  8.000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0224352  decreased coverage  0.0053447 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0739  beta-lactamase  26.36 
 
 		 381 aa  101  3e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3860  beta-lactamase  27.51 
 
 		 377 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.027383 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1301  beta-lactamase  28.85 
 
 		 417 aa  95.9  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4682  beta-lactamase  27.51 
 
 		 377 aa  95.5  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3840  Beta-lactamase  27.22 
 
 		 377 aa  94.4  4e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04022  beta-lactamase/D-alanine carboxypeptidase  26.04 
 
 		 377 aa  93.6  7e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03984  hypothetical protein  26.04 
 
 		 377 aa  93.6  7e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5668  beta-lactamase  26.04 
 
 		 377 aa  93.2  8e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.106194 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4621  beta-lactamase  26.92 
 
 		 377 aa  92.8  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0889352 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2481  beta-lactamase  24.59 
 
 		 359 aa  92.8  1e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4709  beta-lactamase  26.25 
 
 		 377 aa  92.8  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0086  beta-lactamase  26 
 
 		 409 aa  92.8  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.057609 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0089  beta-lactamase  26 
 
 		 409 aa  92.8  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0743599 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0339  beta-lactamase  24.77 
 
 		 385 aa  92.4  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000286576 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4394  beta-lactamase  25.44 
 
 		 377 aa  89.7  8e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2019  fmtA-like protein  26.36 
 
 		 505 aa  85.9  0.000000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.15249  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2336  beta-lactamase  23.88 
 
 		 359 aa  86.3  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4058  beta-lactamase  24.79 
 
 		 405 aa  85.9  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00809672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2207  beta-lactamase  26.06 
 
 		 404 aa  85.1  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.124088  hitchhiker  0.00264676 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1136  beta-lactamase  26.84 
 
 		 357 aa  84  0.000000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.167829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2550  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  24.14 
 
 		 489 aa  83.2  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3450  beta-lactamase  26.33 
 
 		 401 aa  81.3  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0601  beta-lactam binding protein AmpH  25.67 
 
 		 381 aa  79.7  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1621  beta-lactamase  23.24 
 
 		 426 aa  79  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.193235  normal  0.330681 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2038  beta-lactamase  32.26 
 
 		 378 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.666233 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  31.4 
 
 		 487 aa  77.8  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6651  beta-lactam binding protein AmpH  31.05 
 
 		 369 aa  78.2  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.448296  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1234  beta-lactamase  23.51 
 
 		 519 aa  74.3  0.000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.565811  normal  0.301621 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1929  beta-lactamase  26.44 
 
 		 407 aa  73.9  0.000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2968  beta-lactamase  28.64 
 
 		 462 aa  73.9  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3749  beta-lactamase  25.84 
 
 		 380 aa  73.9  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.794636  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3500  beta-lactamase  25.52 
 
 		 600 aa  73.9  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.623073  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3233  beta-lactamase  25.14 
 
 		 385 aa  73.2  0.000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0293  beta-lactam binding protein AmpH  25.14 
 
 		 385 aa  73.2  0.000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3256  beta-lactam binding protein AmpH  25.14 
 
 		 385 aa  73.2  0.000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.896265  normal  0.574239 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01490  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  30.09 
 
 		 460 aa  73.2  0.000000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.697704 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0398  beta-lactam binding protein AmpH  25.14 
 
 		 385 aa  73.2  0.000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.447104  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04833  beta-lactamase  26.34 
 
 		 529 aa  73.2  0.000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0448  beta-lactam binding protein AmpH  25.14 
 
 		 385 aa  73.2  0.000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0404  beta-lactam binding protein AmpH  25.14 
 
 		 385 aa  73.2  0.000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0439  beta-lactam binding protein AmpH  25.14 
 
 		 385 aa  73.2  0.000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2264  hypothetical protein  24.23 
 
 		 485 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.145649  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0116  beta-lactamase  23.1 
 
 		 453 aa  72.8  0.00000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4638  beta-lactamase  29.95 
 
 		 390 aa  72.8  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  27.86 
 
 		 578 aa  73.2  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1298  beta-lactamase  24.4 
 
 		 566 aa  72.8  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2585  beta-lactamase  24.48 
 
 		 390 aa  72.8  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6103  beta-lactamase  24.24 
 
 		 389 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0675  beta-lactamase  25.61 
 
 		 377 aa  72  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2060  beta-lactamase  24.84 
 
 		 485 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.258254  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2273  beta-lactamase  24.18 
 
 		 378 aa  70.9  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0504224 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3106  hypothetical protein  23.55 
 
 		 485 aa  70.9  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000134591 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5864  beta-lactamase  24.15 
 
 		 389 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00323  beta-lactamase/D-alanine carboxypeptidase  24.86 
 
 		 385 aa  70.1  0.00000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00327  hypothetical protein  24.86 
 
 		 385 aa  70.1  0.00000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1507  Beta-lactamase  25.32 
 
 		 595 aa  70.1  0.00000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1758  beta-lactamase  25.37 
 
 		 387 aa  70.1  0.00000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.858626 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4921  beta-lactamase  24.11 
 
 		 386 aa  69.7  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.240852 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4159  beta-lactamase  23.88 
 
 		 544 aa  69.7  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0453527  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2779  beta-lactamase  25.23 
 
 		 445 aa  69.7  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000737728  hitchhiker  0.0000305116 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2262  hypothetical protein  24.85 
 
 		 485 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.60427e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2218  hypothetical protein  24.69 
 
 		 485 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2029  beta-lactamase  26.17 
 
 		 394 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2081  hypothetical protein  24.85 
 
 		 485 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.765888  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2018  penicillin-binding protein  24.85 
 
 		 485 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.225321  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2208  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  25.15 
 
 		 442 aa  68.2  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.474098  normal  0.561482 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2235  hypothetical protein  24.85 
 
 		 485 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.336147  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2604  beta-lactamase  25.99 
 
 		 354 aa  67.4  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.928872  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1832  beta-lactamase  21.79 
 
 		 446 aa  67.4  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.29245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1776  beta-lactamase  25.51 
 
 		 390 aa  67  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0934  beta-lactamase  26.13 
 
 		 475 aa  67  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000419238  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01660  beta-lactamase  23.53 
 
 		 447 aa  67  0.0000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.142612  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2346  hypothetical protein  23.62 
 
 		 485 aa  67  0.0000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0051399  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7532  beta-lactamase  23.89 
 
 		 389 aa  66.6  0.0000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2018  penicillin-binding protein  24.85 
 
 		 485 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2266  beta-lactamase  25.66 
 
 		 394 aa  65.9  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.54757  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2638  beta-lactamase  24.93 
 
 		 445 aa  66.2  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0928  beta-lactam binding protein AmpH  30.97 
 
 		 373 aa  65.9  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.033671 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2836  beta-lactam binding protein AmpH  25.55 
 
 		 388 aa  66.2  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2758  beta-lactam binding protein AmpH  25.55 
 
 		 388 aa  66.2  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000277431  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41280  putative beta-lactamase  27.25 
 
 		 610 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.607486 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1447  beta-lactam binding protein AmpH  25.55 
 
 		 383 aa  66.2  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000414942  normal  0.794569 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2468  beta-lactamase  23.74 
 
 		 498 aa  65.1  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00176956  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1480  beta-lactamase  25.7 
 
 		 387 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0394716  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3476  beta-lactamase  29.89 
 
 		 474 aa  65.5  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1055  beta-lactamase  24.32 
 
 		 547 aa  65.5  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.427639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2516  beta-lactamase  23.74 
 
 		 498 aa  65.1  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000422279  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2383  beta-lactamase  24.67 
 
 		 394 aa  65.5  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0283495  hitchhiker  0.000989813 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0844  beta-lactam binding protein AmpH  27.72 
 
 		 388 aa  65.1  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0659143 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2573  fmtA-like protein, putative  26.13 
 
 		 482 aa  65.1  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00911316  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1414  putative beta-lactamase  27.07 
 
 		 399 aa  64.3  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.182511  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4671  alkaline D-peptidase, putative  28.22 
 
 		 330 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.126225  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3274  beta-lactamase  23.6 
 
 		 524 aa  63.9  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.847415 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2079  beta-lactamase  25 
 
 		 394 aa  63.9  0.000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.221207  hitchhiker  0.00000730378 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>