More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2208 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2638  beta-lactamase  79.21 
 
 		 445 aa  662    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2208  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  100 
 
 		 442 aa  900    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.474098  normal  0.561482 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0439  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  46 
 
 		 392 aa  353  2.9999999999999997e-96  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.919528 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  40 
 
 		 487 aa  241  2e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  41.29 
 
 		 578 aa  234  3e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2294  penicillin-binding protein, putative  37.38 
 
 		 434 aa  225  1e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.272122  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6777  beta-lactamase  36.34 
 
 		 446 aa  225  1e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0343  beta-lactamase  36.15 
 
 		 482 aa  219  6e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1712  beta-lactamase  33.87 
 
 		 477 aa  204  3e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.419371  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3422  beta-lactamase  39.18 
 
 		 593 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.126074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3731  beta-lactamase  38.56 
 
 		 603 aa  199  7.999999999999999e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.227339 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3615  beta-lactamase  38.65 
 
 		 611 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0663146 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  37.46 
 
 		 356 aa  189  9e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1832  beta-lactamase  31.08 
 
 		 446 aa  183  4.0000000000000006e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.29245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1936  beta-lactamase  34.59 
 
 		 848 aa  182  1e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.178754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0939  beta-lactamase  37.27 
 
 		 338 aa  181  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.18746 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4280  beta-lactamase  36.31 
 
 		 330 aa  175  9.999999999999999e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.161716 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2736  beta-lactamase  31.65 
 
 		 417 aa  175  9.999999999999999e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.416885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5985  beta-lactamase  32.11 
 
 		 342 aa  173  6.999999999999999e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3751  beta-lactamase  33.54 
 
 		 395 aa  169  8e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000498352 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1906  beta-lactamase  32.72 
 
 		 369 aa  168  2e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2717  beta-lactamase  34.88 
 
 		 470 aa  165  1.0000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5243  beta-lactamase  36.84 
 
 		 362 aa  164  3e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01195  penicillin-binding protein  31.09 
 
 		 559 aa  159  7e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.119719  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1457  beta-lactamase  33.77 
 
 		 325 aa  159  9e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.17461  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1520  Beta-lactamase  35.24 
 
 		 537 aa  159  1e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000638983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0622  beta-lactamase  34.08 
 
 		 377 aa  158  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.357585  normal  0.0394741 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3512  beta-lactamase  34.47 
 
 		 364 aa  158  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5443  putative beta-lactamase  33.52 
 
 		 364 aa  157  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.65256  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0473  penicillin-binding protein  31.85 
 
 		 421 aa  153  7e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0416  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  32.22 
 
 		 421 aa  152  8e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0430511  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2573  beta-lactamase  34.57 
 
 		 476 aa  153  8e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.369136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0483  putative penicillin-binding protein  32.22 
 
 		 412 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0502  penicillin-binding protein  31.85 
 
 		 412 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2177  beta-lactamase  32.17 
 
 		 543 aa  152  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.816506 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3688  beta-lactamase  32.17 
 
 		 543 aa  152  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497517  normal  0.011807 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0505  putative penicillin-binding protein  31.85 
 
 		 415 aa  151  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0859162  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0428  beta-lactamase  33.09 
 
 		 404 aa  151  2e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.354595  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4818  putative penicillin-binding protein  31.85 
 
 		 416 aa  151  3e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.618322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4152  beta-lactamase  31.95 
 
 		 378 aa  150  3e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0848463  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2968  beta-lactamase  31.12 
 
 		 462 aa  150  4e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0419  beta-lactamase  31.48 
 
 		 416 aa  150  4e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2357  beta-lactamase  30.09 
 
 		 381 aa  149  9e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0412  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  30.07 
 
 		 422 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1086  beta-lactamase  32.08 
 
 		 378 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0863  beta-lactamase  33.12 
 
 		 363 aa  147  3e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6092  beta-lactamase  33.33 
 
 		 419 aa  147  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.152854 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0558  putative penicillin-binding protein  31.85 
 
 		 413 aa  146  6e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.622752  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6206  beta-lactamase  34.69 
 
 		 321 aa  146  6e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.324563 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13238  penicillin-binding protein, putative  32.79 
 
 		 431 aa  146  8.000000000000001e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.652866  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3872  beta-lactamase  31.94 
 
 		 375 aa  145  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0555  penicillin-binding protein, putative  31.85 
 
 		 413 aa  144  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.389605  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4110  beta-lactamase  30.99 
 
 		 379 aa  144  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4174  beta-lactamase  30.99 
 
 		 378 aa  144  4e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000652338  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3175  beta-lactamase  29.97 
 
 		 351 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0119788  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2198  beta-lactamase  32.7 
 
 		 543 aa  141  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.176904  normal  0.0317754 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0151  beta-lactamase  33.73 
 
 		 394 aa  140  3.9999999999999997e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.288429 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5150  beta-lactamase  31.53 
 
 		 369 aa  140  6e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.175198  normal  0.654906 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2793  beta-lactamase  30.61 
 
 		 510 aa  138  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.879811  normal  0.340954 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3210  beta-lactamase  32.35 
 
 		 375 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.767379  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4788  beta-lactamase  27.39 
 
 		 400 aa  137  3.0000000000000003e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.416977  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0831  beta-lactamase  28.61 
 
 		 422 aa  136  6.0000000000000005e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.146809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2587  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  32.78 
 
 		 413 aa  136  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.607083  normal  0.306741 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4213  beta-lactamase  31.61 
 
 		 403 aa  136  7.000000000000001e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.161495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3498  beta-lactamase  30.82 
 
 		 375 aa  136  8e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4546  beta-lactamase  29.33 
 
 		 740 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.207661  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3264  beta-lactamase  30.82 
 
 		 377 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.664291  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2394  penicillin-binding protein  29.91 
 
 		 340 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.70958  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3208  beta-lactamase  31.49 
 
 		 377 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0230735  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2679  penicillin-binding protein  30.65 
 
 		 341 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4636  beta-lactamase  30.82 
 
 		 496 aa  134  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2080  beta-lactamase  35.11 
 
 		 370 aa  134  3e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.16247  normal  0.44675 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2742  beta-lactamase  30.25 
 
 		 376 aa  134  3e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0750006  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1777  beta-lactamase  31.54 
 
 		 343 aa  133  5e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00484911  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2469  penicillin-binding protein  30.3 
 
 		 340 aa  133  6e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.242822  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2650  penicillin-binding protein  30.3 
 
 		 340 aa  133  6e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3294  penicillin-binding protein  31.17 
 
 		 377 aa  133  7.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.678008  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3554  penicillin-binding protein  31.17 
 
 		 377 aa  133  7.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3511  putative penicillin-binding protein  31.17 
 
 		 377 aa  133  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1750  beta-lactamase  30.42 
 
 		 375 aa  132  9e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.339251  normal  0.99151 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2433  penicillin-binding protein  30.22 
 
 		 340 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0197006  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2668  penicillin-binding protein  30.61 
 
 		 348 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162016 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2415  beta-lactamase  28.88 
 
 		 442 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0834226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0999  beta-lactamase  29.73 
 
 		 367 aa  131  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0117018 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5119  beta-lactamase  28.92 
 
 		 402 aa  131  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2632  penicillin-binding protein  29.6 
 
 		 341 aa  131  3e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.149759  decreased coverage  0.000000240236 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3027  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  35.29 
 
 		 406 aa  130  3e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.899556  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3518  putative penicillin-binding protein  30.84 
 
 		 377 aa  130  6e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3507  penicillin-binding protein, putative  30.57 
 
 		 375 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4043  beta-lactamase  33.46 
 
 		 361 aa  128  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4919  beta-lactamase  32.48 
 
 		 415 aa  128  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.318437  normal  0.850487 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1234  beta-lactamase  30.45 
 
 		 519 aa  127  3e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.565811  normal  0.301621 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2721  penicillin-binding protein  29.5 
 
 		 340 aa  126  6e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0897232  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5167  beta-lactamase  32.52 
 
 		 713 aa  126  7e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.619685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0159  beta-lactamase  29.1 
 
 		 410 aa  125  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2259  beta-lactamase  37 
 
 		 416 aa  125  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.296569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2768  beta-lactamase  26.84 
 
 		 483 aa  125  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1357  beta-lactamase  27.87 
 
 		 378 aa  126  1e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3175  beta-lactamase  32.48 
 
 		 375 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.702373  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5169  beta-lactamase  36.8 
 
 		 382 aa  124  3e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>