More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_01490 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_01490  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  100 
 
 		 460 aa  932    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.697704 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1501  beta-lactamase  39.28 
 
 		 447 aa  279  6e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.130484  normal  0.872303 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7012  beta-lactamase  36.76 
 
 		 467 aa  221  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.858592 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2708  beta-lactamase  37.14 
 
 		 417 aa  218  2e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3187  beta-lactamase  34.38 
 
 		 454 aa  214  2.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000216369  hitchhiker  0.000000000911992 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1755  beta-lactamase  35.44 
 
 		 450 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4519  beta-lactamase  36.49 
 
 		 451 aa  211  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.302372  normal  0.700128 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33850  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  35.01 
 
 		 453 aa  203  4e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3287  beta-lactamase  36.91 
 
 		 463 aa  199  7e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0209216 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4863  beta-lactamase  36.1 
 
 		 441 aa  193  4e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.625101  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0759  putative beta-lactamase class C penicillin binding protein  33.75 
 
 		 498 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445171  normal  0.118882 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0860  beta-lactamase  33.42 
 
 		 457 aa  119  9e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.164383  normal  0.834143 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3247  beta-lactamase  28.18 
 
 		 513 aa  115  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0660544 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2991  beta-lactamase  29.14 
 
 		 475 aa  106  9e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0467  beta-lactamase  24.85 
 
 		 520 aa  102  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1234  beta-lactamase  29.25 
 
 		 519 aa  100  5e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.565811  normal  0.301621 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2312  beta-lactamase  29.86 
 
 		 406 aa  99.8  9e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2987  beta-lactamase  26.12 
 
 		 526 aa  99.4  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.204407  normal  0.639877 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0801  beta-lactamase  28.27 
 
 		 478 aa  99  1e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.87828  normal  0.048033 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3022  alkaline D-peptidase and alkaline D-peptidase fusion  29.97 
 
 		 720 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0802631  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15810  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  29.12 
 
 		 488 aa  97.4  4e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.091319  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5985  beta-lactamase  25.56 
 
 		 342 aa  97.1  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3018  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29 
 
 		 389 aa  97.1  6e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.470862  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3144  beta-lactamase  25.65 
 
 		 590 aa  96.7  8e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6210  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  30.07 
 
 		 391 aa  96.3  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.126759  normal  0.402021 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2616  beta-lactamase  24.56 
 
 		 353 aa  95.5  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3206  beta-lactamase  29.45 
 
 		 389 aa  94.7  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0099  D-stereospecific peptide hydrolase  28.88 
 
 		 443 aa  94.4  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000129924  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04833  beta-lactamase  27.88 
 
 		 529 aa  93.6  7e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1969  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  33.08 
 
 		 414 aa  93.6  7e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.980127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0570  alkaline D-peptidase  29.3 
 
 		 370 aa  93.2  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.126759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0727  alkaline D-peptidase  33.21 
 
 		 429 aa  91.7  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03210  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  30.62 
 
 		 521 aa  91.3  3e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.205122  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0201  beta-lactamase  26.03 
 
 		 530 aa  91.3  4e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.494145 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3032  beta-lactamase  33.33 
 
 		 507 aa  90.1  7e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.436003 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2717  beta-lactamase  26.61 
 
 		 470 aa  90.1  8e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0618  beta-lactamase  25.37 
 
 		 450 aa  89.7  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2576  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  29.37 
 
 		 389 aa  89  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.145811 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2650  beta-lactamase  27.74 
 
 		 497 aa  87.8  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0361544  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4308  beta-lactamase  28.65 
 
 		 459 aa  88.2  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0244726  normal  0.721784 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2051  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  26.91 
 
 		 385 aa  87.8  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.319079  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2296  alkaline D-peptidase  27.33 
 
 		 385 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000100431 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2019  fmtA-like protein  24.06 
 
 		 505 aa  87.4  5e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.15249  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2053  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  27.33 
 
 		 385 aa  87.4  5e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00880281  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1638  beta-lactamase  23.59 
 
 		 485 aa  87.4  5e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0331332  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0097  beta-lactamase  27.83 
 
 		 601 aa  87  6e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1867  beta-lactamase  27.8 
 
 		 517 aa  85.9  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0109165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6205  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.15 
 
 		 378 aa  86.3  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6467  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  27.74 
 
 		 551 aa  86.3  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.341842  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2587  putative penicillin-binding protein  20.06 
 
 		 463 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35213e-17 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2478  alkaline D-peptidase  30.39 
 
 		 388 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.431844  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2440  alkaline D-peptidase (D-stereospecific peptide hydrolase)  30.39 
 
 		 388 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00540718  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2409  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  30.39 
 
 		 388 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.37701  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2677  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  30.39 
 
 		 388 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000522854 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2661  alkaline d-peptidase  30.39 
 
 		 388 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2381  alkaline D-peptidase  27.25 
 
 		 385 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0825231  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3175  beta-lactamase  26.62 
 
 		 375 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.702373  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2860  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  27.27 
 
 		 385 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.28769  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3984  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.37 
 
 		 390 aa  84.7  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2400  penicillin-binding protein  20.06 
 
 		 481 aa  84.7  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443561  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4687  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.53 
 
 		 373 aa  84.7  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2575  penicillin-binding protein  20.06 
 
 		 481 aa  84.7  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2252  beta-lactamase  29.93 
 
 		 460 aa  84.3  0.000000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.119961  normal  0.0203286 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2093  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  26.62 
 
 		 407 aa  84  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0934  beta-lactamase  28.64 
 
 		 475 aa  84  0.000000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000419238  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2218  hypothetical protein  23.51 
 
 		 485 aa  84  0.000000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3030  alkaline D-peptidase  28.15 
 
 		 388 aa  83.2  0.000000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4159  beta-lactamase  26.76 
 
 		 544 aa  83.2  0.000000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0453527  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4133  beta-lactamase  26.22 
 
 		 822 aa  83.2  0.000000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.668063  normal  0.0496796 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0154  beta-lactamase  30 
 
 		 526 aa  82.8  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2343  beta-lactamase  23.64 
 
 		 803 aa  82.8  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.23617 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4368  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  28.62 
 
 		 416 aa  82.8  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041515 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01195  penicillin-binding protein  23.91 
 
 		 559 aa  82.4  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.119719  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0368  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  31 
 
 		 399 aa  82.8  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00562308  normal  0.495103 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2353  penicillin-binding protein  20.61 
 
 		 481 aa  82  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000218323  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1134  beta-lactamase  23.55 
 
 		 603 aa  82  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.260461 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0294  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  24.47 
 
 		 834 aa  82.4  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00108534  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2217  alkaline D-peptidase  27.78 
 
 		 388 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.66047e-16 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13238  penicillin-binding protein, putative  25.82 
 
 		 431 aa  81.3  0.00000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.652866  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2143  beta-lactamase  27.2 
 
 		 401 aa  81.6  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.559529  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1621  beta-lactamase  21.23 
 
 		 426 aa  81.3  0.00000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.193235  normal  0.330681 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1457  beta-lactamase  24.47 
 
 		 325 aa  80.9  0.00000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.17461  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2587  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  26.28 
 
 		 413 aa  80.9  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.607083  normal  0.306741 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2819  alkaline D-peptidase  27.68 
 
 		 388 aa  80.5  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118082  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2769  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  27.68 
 
 		 389 aa  80.5  0.00000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.48212  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3033  alkaline d-peptidase  27.68 
 
 		 388 aa  80.5  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.400662  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2539  beta-lactamase  26.73 
 
 		 567 aa  80.1  0.00000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.470437  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2316  penicillin-binding protein  20.73 
 
 		 481 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181197  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2060  beta-lactamase  22.39 
 
 		 485 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.258254  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3147  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  25.9 
 
 		 407 aa  80.1  0.00000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.943509  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2813  beta-lactamase  26.14 
 
 		 499 aa  79.7  0.00000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.119288 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1936  beta-lactamase  25.91 
 
 		 848 aa  79  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.178754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1018  beta-lactamase  27.92 
 
 		 461 aa  79.7  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.624623 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2727  beta-lactamase  24.64 
 
 		 486 aa  79.7  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3027  alkaline D-peptidase  27.04 
 
 		 388 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5715  beta-lactamase  26.99 
 
 		 437 aa  79  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3064  alkaline D-peptidase  25.57 
 
 		 388 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0312865  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2573  beta-lactamase  29.82 
 
 		 476 aa  79  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.369136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5173  putative beta lactamase family protein  27.08 
 
 		 462 aa  78.6  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.694377  normal  0.230482 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3986  hypothetical protein  29.7 
 
 		 369 aa  79  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.82683 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>