More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2616 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2616  beta-lactamase  100 
 
 		 353 aa  716    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0439  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  33.97 
 
 		 392 aa  143  4e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.919528 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1507  Beta-lactamase  28.78 
 
 		 595 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0097  beta-lactamase  27.84 
 
 		 601 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2650  beta-lactamase  28.71 
 
 		 497 aa  130  5.0000000000000004e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0361544  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1946  Beta-lactamase  26.53 
 
 		 588 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5150  beta-lactamase  25.96 
 
 		 369 aa  125  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.175198  normal  0.654906 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  29.81 
 
 		 578 aa  124  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3742  beta-lactamase  26.71 
 
 		 478 aa  123  6e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.877046  normal  0.0540026 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  30.19 
 
 		 487 aa  121  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1783  cyclic peptide transporter  29.28 
 
 		 1055 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0903267  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2389  cyclic peptide transporter  28.77 
 
 		 1032 aa  120  4.9999999999999996e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2019  fmtA-like protein  26.15 
 
 		 505 aa  119  9.999999999999999e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.15249  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11747  penicillin-binding protein  27.25 
 
 		 539 aa  116  6e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.47398 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0863  beta-lactamase  23.93 
 
 		 363 aa  115  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2516  beta-lactamase  27.43 
 
 		 498 aa  114  3e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000422279  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0801  beta-lactamase  28.57 
 
 		 478 aa  114  3e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.87828  normal  0.048033 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2468  beta-lactamase  27.43 
 
 		 498 aa  114  3e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00176956  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0467  beta-lactamase  26.67 
 
 		 520 aa  113  4.0000000000000004e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0759  putative beta-lactamase class C penicillin binding protein  25.84 
 
 		 498 aa  113  5e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445171  normal  0.118882 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4519  beta-lactamase  24.01 
 
 		 451 aa  112  8.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.302372  normal  0.700128 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2579  penicillin-binding protein, putative  30.03 
 
 		 483 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0220569  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1263  beta-lactamase-like protein  24.43 
 
 		 455 aa  111  1.0000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1230  beta-lactamase  24.43 
 
 		 455 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1621  beta-lactamase  24.53 
 
 		 426 aa  112  1.0000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.193235  normal  0.330681 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0939  beta-lactamase  25.85 
 
 		 338 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.18746 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4213  beta-lactamase  24.12 
 
 		 403 aa  110  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.161495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1055  beta-lactamase  27.66 
 
 		 547 aa  110  4.0000000000000004e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.427639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1788  beta-lactamase  23.1 
 
 		 560 aa  110  4.0000000000000004e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.358741  normal  0.761746 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2953  beta-lactamase  26.63 
 
 		 513 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2997  beta-lactamase  26.93 
 
 		 513 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2316  penicillin-binding protein  28.69 
 
 		 481 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181197  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2384  beta-lactamase  30.22 
 
 		 483 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2587  putative penicillin-binding protein  29.7 
 
 		 463 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35213e-17 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4636  beta-lactamase  27.16 
 
 		 496 aa  110  5e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2353  penicillin-binding protein  30.48 
 
 		 481 aa  110  5e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000218323  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8721  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  26.3 
 
 		 480 aa  110  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2968  beta-lactamase  25.72 
 
 		 462 aa  109  6e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2932  penicillin-binding protein  26.63 
 
 		 513 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2400  penicillin-binding protein  29.13 
 
 		 481 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443561  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2575  penicillin-binding protein  29.13 
 
 		 481 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3206  beta-lactamase  29.29 
 
 		 389 aa  108  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2208  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  26.89 
 
 		 442 aa  108  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.474098  normal  0.561482 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1755  beta-lactamase  25.68 
 
 		 450 aa  108  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2539  beta-lactamase  25.8 
 
 		 567 aa  108  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.470437  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1712  beta-lactamase  28.66 
 
 		 477 aa  108  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.419371  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3243  beta-lactamase family protein  26.63 
 
 		 513 aa  107  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3175  beta-lactamase  28.98 
 
 		 375 aa  107  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.702373  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3247  beta-lactamase  26.45 
 
 		 513 aa  107  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0660544 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1839  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  24.73 
 
 		 681 aa  107  3e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000051234  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  23.51 
 
 		 356 aa  107  3e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9203  beta-lactamase  25.81 
 
 		 635 aa  107  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.606578 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4280  beta-lactamase  27.07 
 
 		 330 aa  106  5e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.161716 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0973  beta-lactamase  27.76 
 
 		 514 aa  106  5e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0622  beta-lactamase  27.02 
 
 		 377 aa  106  7e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.357585  normal  0.0394741 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3422  beta-lactamase  29.43 
 
 		 593 aa  105  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.126074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1830  beta-lactamase  27.02 
 
 		 452 aa  105  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.162579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01660  beta-lactamase  23.51 
 
 		 447 aa  105  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.142612  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0099  D-stereospecific peptide hydrolase  31.07 
 
 		 443 aa  105  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000129924  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2172  beta-lactamase  28.43 
 
 		 428 aa  104  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.65714  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3274  beta-lactamase  27.14 
 
 		 524 aa  105  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.847415 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2717  beta-lactamase  26.12 
 
 		 470 aa  104  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1460  beta-lactamase  24.51 
 
 		 523 aa  104  2e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0171679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5985  beta-lactamase  24.92 
 
 		 342 aa  104  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1936  beta-lactamase  28.15 
 
 		 848 aa  103  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.178754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4919  beta-lactamase  26.33 
 
 		 415 aa  103  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.318437  normal  0.850487 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3032  beta-lactamase  27.93 
 
 		 507 aa  103  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.436003 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1414  putative beta-lactamase  22.04 
 
 		 399 aa  103  4e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.182511  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2381  alkaline D-peptidase  28.95 
 
 		 385 aa  103  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0825231  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3147  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  29.47 
 
 		 407 aa  103  4e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.943509  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3688  beta-lactamase  25.83 
 
 		 543 aa  103  5e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497517  normal  0.011807 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2177  beta-lactamase  25.83 
 
 		 543 aa  103  5e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.816506 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3751  beta-lactamase  28.09 
 
 		 395 aa  103  6e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000498352 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2198  beta-lactamase  26.45 
 
 		 543 aa  103  6e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.176904  normal  0.0317754 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01195  penicillin-binding protein  24.48 
 
 		 559 aa  102  7e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.119719  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5593  beta-lactamase  26.3 
 
 		 480 aa  102  7e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3287  beta-lactamase  23.94 
 
 		 463 aa  103  7e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0209216 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2629  putative penicillin-binding protein  30.68 
 
 		 490 aa  102  8e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0110315  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2296  alkaline D-peptidase  28.62 
 
 		 385 aa  102  8e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000100431 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0151  beta-lactamase  26.01 
 
 		 394 aa  102  9e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.288429 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2573  beta-lactamase  26.75 
 
 		 476 aa  102  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.369136  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2053  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  28.85 
 
 		 385 aa  102  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00880281  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2824  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.87 
 
 		 388 aa  102  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.130693  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1018  beta-lactamase  23.42 
 
 		 461 aa  102  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.624623 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2573  fmtA-like protein, putative  22.51 
 
 		 482 aa  101  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00911316  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3069  alkaline D-peptidase  29.53 
 
 		 388 aa  101  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0417304  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2051  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  28.52 
 
 		 385 aa  101  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.319079  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3018  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.41 
 
 		 389 aa  101  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.470862  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2755  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  29.53 
 
 		 388 aa  101  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0494186  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33850  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  24.52 
 
 		 453 aa  101  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2093  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  29.02 
 
 		 407 aa  101  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3830  beta-lactamase  26.42 
 
 		 658 aa  101  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223137  normal  0.372687 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2143  beta-lactamase  26.18 
 
 		 401 aa  101  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.559529  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0126  beta-lactamase  24.85 
 
 		 456 aa  101  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3117  beta-lactamase  28.69 
 
 		 361 aa  101  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.577011  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2080  beta-lactamase  24.14 
 
 		 370 aa  101  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.16247  normal  0.44675 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1832  beta-lactamase  27.56 
 
 		 446 aa  101  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.29245  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0201  beta-lactamase  23.82 
 
 		 530 aa  101  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.494145 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0505  putative penicillin-binding protein  35.12 
 
 		 415 aa  100  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0859162  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2638  beta-lactamase  26.94 
 
 		 445 aa  100  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>