More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01195 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_01195  penicillin-binding protein  100 
 
 
559 aa  1160    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.119719  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3688  beta-lactamase  35.57 
 
 
543 aa  323  5e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497517  normal  0.011807 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2177  beta-lactamase  35.57 
 
 
543 aa  323  5e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.816506 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1520  Beta-lactamase  35.67 
 
 
537 aa  322  9.999999999999999e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000638983  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2198  beta-lactamase  29.82 
 
 
543 aa  247  4.9999999999999997e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.176904  normal  0.0317754 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5119  beta-lactamase  34.15 
 
 
402 aa  211  2e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  34.68 
 
 
356 aa  208  2e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4346  Beta-lactamase  28.44 
 
 
547 aa  200  5e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3175  beta-lactamase  34.47 
 
 
351 aa  200  6e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0119788  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5443  putative beta-lactamase  32.27 
 
 
364 aa  188  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.65256  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5264  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  33.33 
 
 
493 aa  184  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.0797924 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  31.11 
 
 
578 aa  182  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4350  Beta-lactamase  26.54 
 
 
553 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1712  beta-lactamase  31.36 
 
 
477 aa  177  4e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.419371  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  31.3 
 
 
487 aa  176  9.999999999999999e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5243  beta-lactamase  34.23 
 
 
362 aa  171  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2968  beta-lactamase  31.92 
 
 
462 aa  171  2e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11951  lipoprotein  35.78 
 
 
371 aa  169  9e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0939  beta-lactamase  30.86 
 
 
338 aa  167  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.18746 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4671  alkaline D-peptidase, putative  35.19 
 
 
330 aa  164  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.126225  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5985  beta-lactamase  33.33 
 
 
342 aa  164  3e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2208  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.66 
 
 
442 aa  160  7e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.474098  normal  0.561482 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1936  beta-lactamase  30.19 
 
 
848 aa  158  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.178754  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4280  beta-lactamase  31.4 
 
 
330 aa  159  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.161716 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2717  beta-lactamase  31.55 
 
 
470 aa  158  3e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1439  Beta-lactamase  33.23 
 
 
330 aa  154  5e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0862025  normal  0.346233 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2294  penicillin-binding protein, putative  29.48 
 
 
434 aa  149  9e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.272122  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2081  hypothetical protein  30.43 
 
 
485 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.765888  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2235  hypothetical protein  30.43 
 
 
485 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.336147  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2262  hypothetical protein  30.16 
 
 
485 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.60427e-26 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2638  beta-lactamase  30.52 
 
 
445 aa  149  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6777  beta-lactamase  26.7 
 
 
446 aa  147  6e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2018  penicillin-binding protein  29.89 
 
 
485 aa  147  7.0000000000000006e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.225321  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2018  penicillin-binding protein  30.52 
 
 
485 aa  146  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3512  beta-lactamase  29.36 
 
 
364 aa  147  7.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2264  hypothetical protein  29.35 
 
 
485 aa  146  1e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.145649  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0439  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.77 
 
 
392 aa  145  1e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.919528 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1357  beta-lactamase  29.21 
 
 
378 aa  145  2e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2218  hypothetical protein  30.41 
 
 
485 aa  145  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1311  beta-lactamase  30.26 
 
 
669 aa  144  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2346  hypothetical protein  29.62 
 
 
485 aa  143  6e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0051399  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1832  beta-lactamase  27.36 
 
 
446 aa  142  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.29245  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3247  beta-lactamase  27.55 
 
 
513 aa  141  3.9999999999999997e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0660544 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4636  beta-lactamase  27.14 
 
 
496 aa  139  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0622  beta-lactamase  30.52 
 
 
377 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.357585  normal  0.0394741 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3106  hypothetical protein  30.21 
 
 
485 aa  137  5e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000134591 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3615  beta-lactamase  25.78 
 
 
611 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0663146 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1638  beta-lactamase  28.26 
 
 
485 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0331332  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2736  beta-lactamase  32.2 
 
 
417 aa  134  5e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.416885  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3422  beta-lactamase  29.5 
 
 
593 aa  134  6e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.126074  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3731  beta-lactamase  29.5 
 
 
603 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.227339 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2516  beta-lactamase  29.08 
 
 
498 aa  131  3e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000422279  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1839  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  29.31 
 
 
681 aa  131  3e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000051234  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2468  beta-lactamase  29.08 
 
 
498 aa  131  3e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00176956  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2019  fmtA-like protein  28.43 
 
 
505 aa  131  4.0000000000000003e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.15249  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4308  beta-lactamase  27.44 
 
 
650 aa  130  5.0000000000000004e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.805936  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2659  beta-lactamase  28.7 
 
 
662 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0999  beta-lactamase  29.26 
 
 
367 aa  129  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0117018 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0618  beta-lactamase  28.33 
 
 
450 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0473  penicillin-binding protein  34.17 
 
 
421 aa  128  3e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0416  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  34.17 
 
 
421 aa  128  3e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0430511  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0483  putative penicillin-binding protein  34.17 
 
 
412 aa  128  3e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0502  penicillin-binding protein  34.17 
 
 
412 aa  128  3e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0467  beta-lactamase  30.89 
 
 
520 aa  128  3e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2060  beta-lactamase  28.24 
 
 
485 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.258254  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0116  beta-lactamase  27.33 
 
 
453 aa  127  4.0000000000000003e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0059  beta-lactamase  28.2 
 
 
383 aa  127  5e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0476107  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04833  beta-lactamase  28.03 
 
 
529 aa  127  5e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2556  beta-lactamase  29.25 
 
 
328 aa  127  6e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.400267 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09928  putative non-ribosomal peptide synthetase  28.29 
 
 
483 aa  127  7e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.206304  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2415  beta-lactamase  29.64 
 
 
442 aa  126  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0834226  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3751  beta-lactamase  29.63 
 
 
395 aa  126  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000498352 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0335  hypothetical protein  30.82 
 
 
533 aa  124  4e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0505  putative penicillin-binding protein  33.17 
 
 
415 aa  124  5e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0859162  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0412  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  32.66 
 
 
422 aa  123  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2259  beta-lactamase  31.6 
 
 
416 aa  122  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.296569  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0759  putative beta-lactamase class C penicillin binding protein  27.06 
 
 
498 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445171  normal  0.118882 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6206  beta-lactamase  30.79 
 
 
321 aa  122  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.324563 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2539  beta-lactamase  28.89 
 
 
567 aa  121  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.470437  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0558  putative penicillin-binding protein  32.66 
 
 
413 aa  121  3e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.622752  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2793  beta-lactamase  29.43 
 
 
510 aa  121  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.879811  normal  0.340954 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1710  beta-lactamase  29.1 
 
 
463 aa  120  7.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.903063 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3817  beta-lactamase  27.71 
 
 
364 aa  120  7.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0555  penicillin-binding protein, putative  32.66 
 
 
413 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.389605  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1906  beta-lactamase  30.13 
 
 
369 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4818  putative penicillin-binding protein  31.66 
 
 
416 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.618322  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1234  beta-lactamase  27.75 
 
 
519 aa  119  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.565811  normal  0.301621 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3742  beta-lactamase  30.18 
 
 
478 aa  119  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.877046  normal  0.0540026 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2813  beta-lactamase  27.89 
 
 
499 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.119288 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0419  beta-lactamase  32.16 
 
 
416 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1507  Beta-lactamase  28.8 
 
 
595 aa  118  3e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2987  beta-lactamase  29.65 
 
 
526 aa  118  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.204407  normal  0.639877 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1031  beta-lactamase  27.42 
 
 
358 aa  117  6e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0095  beta-lactamase  27.91 
 
 
580 aa  116  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1164  beta-lactamase  25.99 
 
 
501 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.255434 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1621  beta-lactamase  27.41 
 
 
426 aa  115  3e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.193235  normal  0.330681 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0428  beta-lactamase  34.67 
 
 
404 aa  115  3e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.354595  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4788  beta-lactamase  30.23 
 
 
400 aa  114  3e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.416977  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0294  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  25.61 
 
 
834 aa  114  4.0000000000000004e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00108534  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01828  beta-lactamase precursor  33.03 
 
 
366 aa  114  6e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.284204  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>