More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0544 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  100 
 
 		 578 aa  1182    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  55.35 
 
 		 487 aa  522  1e-147  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6777  beta-lactamase  41.67 
 
 		 446 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3731  beta-lactamase  32.69 
 
 		 603 aa  274  3e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.227339 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3615  beta-lactamase  31.94 
 
 		 611 aa  267  4e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0663146 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3422  beta-lactamase  32.69 
 
 		 593 aa  266  5e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.126074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0439  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  43.27 
 
 		 392 aa  251  2e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.919528 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2294  penicillin-binding protein, putative  37.1 
 
 		 434 aa  249  1e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.272122  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2208  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  41.29 
 
 		 442 aa  234  2.0000000000000002e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.474098  normal  0.561482 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2638  beta-lactamase  41.61 
 
 		 445 aa  234  4.0000000000000004e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1832  beta-lactamase  35.96 
 
 		 446 aa  229  1e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.29245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2736  beta-lactamase  38.89 
 
 		 417 aa  219  1e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.416885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1906  beta-lactamase  36.97 
 
 		 369 aa  211  3e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4636  beta-lactamase  30.38 
 
 		 496 aa  203  7e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0343  beta-lactamase  37.69 
 
 		 482 aa  193  6e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2793  beta-lactamase  28.63 
 
 		 510 aa  192  1e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.879811  normal  0.340954 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1712  beta-lactamase  34.48 
 
 		 477 aa  184  4.0000000000000006e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.419371  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01195  penicillin-binding protein  31.11 
 
 		 559 aa  182  2e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.119719  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0622  beta-lactamase  34.35 
 
 		 377 aa  181  4e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.357585  normal  0.0394741 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2742  beta-lactamase  34.43 
 
 		 376 aa  180  8e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0750006  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3264  beta-lactamase  41.18 
 
 		 377 aa  179  9e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.664291  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5243  beta-lactamase  32.88 
 
 		 362 aa  179  1e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1936  beta-lactamase  34.34 
 
 		 848 aa  177  4e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.178754  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3294  penicillin-binding protein  40.86 
 
 		 377 aa  177  7e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.678008  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3511  putative penicillin-binding protein  40.86 
 
 		 377 aa  177  7e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3554  penicillin-binding protein  40.86 
 
 		 377 aa  177  7e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3208  beta-lactamase  40.47 
 
 		 377 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0230735  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2415  beta-lactamase  34.42 
 
 		 442 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0834226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3498  beta-lactamase  40.08 
 
 		 375 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0831  beta-lactamase  28.77 
 
 		 422 aa  171  3e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.146809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1750  beta-lactamase  39.69 
 
 		 375 aa  171  3e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.339251  normal  0.99151 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3518  putative penicillin-binding protein  40 
 
 		 377 aa  171  3e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0618  beta-lactamase  33.25 
 
 		 450 aa  171  3e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3507  penicillin-binding protein, putative  40 
 
 		 375 aa  171  4e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0505  putative penicillin-binding protein  35.82 
 
 		 415 aa  170  8e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0859162  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  32.29 
 
 		 356 aa  169  1e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3210  beta-lactamase  38.13 
 
 		 375 aa  168  2.9999999999999998e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.767379  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0419  beta-lactamase  35.07 
 
 		 416 aa  168  2.9999999999999998e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5443  putative beta-lactamase  30.71 
 
 		 364 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.65256  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0416  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  36.33 
 
 		 421 aa  167  5.9999999999999996e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0430511  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1457  beta-lactamase  33.13 
 
 		 325 aa  167  6.9999999999999995e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.17461  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2573  beta-lactamase  33.62 
 
 		 476 aa  166  9e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.369136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4280  beta-lactamase  33.85 
 
 		 330 aa  166  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.161716 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0473  penicillin-binding protein  35.96 
 
 		 421 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3872  beta-lactamase  32.73 
 
 		 375 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3688  beta-lactamase  31.19 
 
 		 543 aa  165  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497517  normal  0.011807 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0502  penicillin-binding protein  35.96 
 
 		 412 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3751  beta-lactamase  34.52 
 
 		 395 aa  165  2.0000000000000002e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000498352 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0483  putative penicillin-binding protein  35.96 
 
 		 412 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2177  beta-lactamase  31.19 
 
 		 543 aa  165  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.816506 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1086  beta-lactamase  32.44 
 
 		 378 aa  164  3e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4818  putative penicillin-binding protein  35.21 
 
 		 416 aa  164  3e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.618322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4174  beta-lactamase  31.34 
 
 		 378 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000652338  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4152  beta-lactamase  31.64 
 
 		 378 aa  164  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0848463  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0412  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  35.21 
 
 		 422 aa  163  7e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1520  Beta-lactamase  32.3 
 
 		 537 aa  163  8.000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000638983  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4110  beta-lactamase  31.04 
 
 		 379 aa  162  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0558  putative penicillin-binding protein  34.83 
 
 		 413 aa  161  3e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.622752  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0555  penicillin-binding protein, putative  35.21 
 
 		 413 aa  160  5e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.389605  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0939  beta-lactamase  34.16 
 
 		 338 aa  160  5e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.18746 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0099  D-stereospecific peptide hydrolase  32.38 
 
 		 443 aa  160  6e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000129924  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0428  beta-lactamase  34.34 
 
 		 404 aa  160  8e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.354595  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2576  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  33.33 
 
 		 389 aa  160  8e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.145811 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2768  beta-lactamase  27.44 
 
 		 483 aa  156  9e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13238  penicillin-binding protein, putative  33.92 
 
 		 431 aa  155  2e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.652866  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2717  beta-lactamase  30.75 
 
 		 470 aa  155  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12878  beta-lactamase, putative  31.42 
 
 		 504 aa  154  2.9999999999999998e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2539  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  31.07 
 
 		 445 aa  154  4e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3018  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  36.39 
 
 		 389 aa  154  5.9999999999999996e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.470862  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5985  beta-lactamase  31.35 
 
 		 342 aa  153  8e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5150  beta-lactamase  31.48 
 
 		 369 aa  153  8.999999999999999e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.175198  normal  0.654906 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4637  beta-lactamase  30.17 
 
 		 491 aa  153  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1777  beta-lactamase  35.69 
 
 		 343 aa  150  8e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00484911  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3030  alkaline D-peptidase  35.16 
 
 		 388 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3512  beta-lactamase  32.13 
 
 		 364 aa  148  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2217  alkaline D-peptidase  35.16 
 
 		 388 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.66047e-16 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0999  beta-lactamase  30.96 
 
 		 367 aa  148  3e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0117018 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2968  beta-lactamase  28.82 
 
 		 462 aa  146  1e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1357  beta-lactamase  29.75 
 
 		 378 aa  146  1e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3206  beta-lactamase  34.27 
 
 		 389 aa  146  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2053  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  34.68 
 
 		 385 aa  145  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00880281  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4043  beta-lactamase  36.4 
 
 		 361 aa  145  3e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6092  beta-lactamase  30.33 
 
 		 419 aa  144  5e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.152854 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4919  beta-lactamase  32.63 
 
 		 415 aa  143  7e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.318437  normal  0.850487 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2296  alkaline D-peptidase  34.87 
 
 		 385 aa  143  7e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000100431 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0863  beta-lactamase  29.51 
 
 		 363 aa  143  8e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2093  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  35.19 
 
 		 407 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2860  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  35.19 
 
 		 385 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.28769  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2051  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  34.21 
 
 		 385 aa  141  3e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.319079  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6206  beta-lactamase  31.8 
 
 		 321 aa  140  3.9999999999999997e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.324563 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3175  beta-lactamase  35.38 
 
 		 375 aa  141  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.702373  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2381  alkaline D-peptidase  34.24 
 
 		 385 aa  140  7e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0825231  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3147  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  34.74 
 
 		 407 aa  139  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.943509  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1094  beta-lactamase  34.31 
 
 		 349 aa  139  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3027  alkaline D-peptidase  35.66 
 
 		 388 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2819  alkaline D-peptidase  35.66 
 
 		 388 aa  137  4e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118082  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2769  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  35.66 
 
 		 389 aa  138  4e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.48212  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3033  alkaline d-peptidase  35.66 
 
 		 388 aa  137  4e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.400662  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0159  beta-lactamase  30.27 
 
 		 410 aa  137  4e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2668  penicillin-binding protein  30.9 
 
 		 348 aa  137  4e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162016 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>