More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2768 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2768  beta-lactamase  100 
 
 		 483 aa  972    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4636  beta-lactamase  29.72 
 
 		 496 aa  216  7e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  28.23 
 
 		 487 aa  180  4.999999999999999e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  27.44 
 
 		 578 aa  156  7e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1712  beta-lactamase  28.24 
 
 		 477 aa  148  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.419371  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2553  beta-lactamase  25.48 
 
 		 478 aa  143  6e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0939  beta-lactamase  26.67 
 
 		 338 aa  142  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.18746 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4280  beta-lactamase  26.95 
 
 		 330 aa  141  3e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.161716 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0071  beta-lactamase  25.07 
 
 		 373 aa  139  2e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.902729  normal  0.844307 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5985  beta-lactamase  30.77 
 
 		 342 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  27.48 
 
 		 356 aa  138  3.0000000000000003e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3817  beta-lactamase  28.41 
 
 		 364 aa  133  7.999999999999999e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0439  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  28.48 
 
 		 392 aa  129  9.000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.919528 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3751  beta-lactamase  29.91 
 
 		 395 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000498352 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0622  beta-lactamase  26.48 
 
 		 377 aa  127  6e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.357585  normal  0.0394741 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2208  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  27.54 
 
 		 442 aa  125  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.474098  normal  0.561482 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2638  beta-lactamase  28.61 
 
 		 445 aa  125  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2968  beta-lactamase  26.85 
 
 		 462 aa  125  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3688  beta-lactamase  29.6 
 
 		 543 aa  123  7e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497517  normal  0.011807 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2177  beta-lactamase  29.6 
 
 		 543 aa  123  7e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.816506 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5443  putative beta-lactamase  25.23 
 
 		 364 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.65256  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1906  beta-lactamase  29.02 
 
 		 369 aa  113  6e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0831  beta-lactamase  25.97 
 
 		 422 aa  112  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.146809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2717  beta-lactamase  24.41 
 
 		 470 aa  112  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2736  beta-lactamase  29.81 
 
 		 417 aa  110  5e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.416885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5150  beta-lactamase  24.4 
 
 		 369 aa  110  7.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.175198  normal  0.654906 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2294  penicillin-binding protein, putative  27.74 
 
 		 434 aa  107  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.272122  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2433  penicillin-binding protein  29.41 
 
 		 340 aa  107  4e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0197006  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2668  penicillin-binding protein  29.41 
 
 		 348 aa  107  4e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162016 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12878  beta-lactamase, putative  24.31 
 
 		 504 aa  107  6e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5107  beta-lactamase  30.63 
 
 		 338 aa  107  7e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.434559  normal  0.256673 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0416  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  29.3 
 
 		 421 aa  106  8e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0430511  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2469  penicillin-binding protein  29.41 
 
 		 340 aa  106  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.242822  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0159  beta-lactamase  28.52 
 
 		 410 aa  106  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2650  penicillin-binding protein  29.41 
 
 		 340 aa  106  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0428  beta-lactamase  30.15 
 
 		 404 aa  105  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.354595  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4511  beta-lactamase  22.74 
 
 		 555 aa  106  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.480191  normal  0.743211 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4191  beta-lactamase  24.83 
 
 		 386 aa  105  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.249358 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0505  putative penicillin-binding protein  29.57 
 
 		 415 aa  105  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0859162  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0473  penicillin-binding protein  28.94 
 
 		 421 aa  105  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2394  penicillin-binding protein  29.41 
 
 		 340 aa  105  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.70958  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0502  penicillin-binding protein  28.94 
 
 		 412 aa  105  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6777  beta-lactamase  26.38 
 
 		 446 aa  105  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0483  putative penicillin-binding protein  28.94 
 
 		 412 aa  105  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3512  beta-lactamase  26.52 
 
 		 364 aa  104  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2679  penicillin-binding protein  29.66 
 
 		 341 aa  104  4e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5243  beta-lactamase  26.91 
 
 		 362 aa  104  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0555  penicillin-binding protein, putative  29.96 
 
 		 413 aa  103  5e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.389605  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0973  beta-lactamase  29.39 
 
 		 514 aa  103  6e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0419  beta-lactamase  28.12 
 
 		 416 aa  103  8e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0954  Beta-lactamase  25.08 
 
 		 416 aa  103  8e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0412  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  29.57 
 
 		 422 aa  103  9e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1018  beta-lactamase  23.08 
 
 		 461 aa  103  9e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.624623 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1520  Beta-lactamase  27.19 
 
 		 537 aa  103  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000638983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2996  beta-lactamase  27.98 
 
 		 479 aa  102  1e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.168493 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2632  penicillin-binding protein  29.36 
 
 		 341 aa  102  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.149759  decreased coverage  0.000000240236 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4818  putative penicillin-binding protein  29.18 
 
 		 416 aa  102  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.618322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0558  putative penicillin-binding protein  28.79 
 
 		 413 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.622752  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4159  beta-lactamase  25.93 
 
 		 544 aa  101  3e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0453527  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4919  beta-lactamase  28.12 
 
 		 415 aa  100  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.318437  normal  0.850487 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2793  beta-lactamase  31.28 
 
 		 510 aa  100  6e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.879811  normal  0.340954 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3264  beta-lactamase  31.79 
 
 		 377 aa  99.4  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.664291  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01195  penicillin-binding protein  26.56 
 
 		 559 aa  99.8  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.119719  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4882  beta-lactamase  31.22 
 
 		 497 aa  98.6  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04833  beta-lactamase  26.22 
 
 		 529 aa  98.6  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1783  cyclic peptide transporter  32.64 
 
 		 1055 aa  99  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0903267  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0863  beta-lactamase  23.17 
 
 		 363 aa  98.2  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2080  beta-lactamase  24.2 
 
 		 370 aa  97.4  4e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.16247  normal  0.44675 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2721  penicillin-binding protein  28.83 
 
 		 340 aa  97.4  5e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0897232  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3518  putative penicillin-binding protein  31.47 
 
 		 377 aa  97.4  5e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3210  beta-lactamase  30.46 
 
 		 375 aa  97.4  6e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.767379  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2573  beta-lactamase  24.92 
 
 		 476 aa  97.4  6e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.369136  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3032  beta-lactamase  27.42 
 
 		 507 aa  96.7  8e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.436003 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3208  beta-lactamase  29.7 
 
 		 377 aa  96.7  8e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0230735  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3294  penicillin-binding protein  29.7 
 
 		 377 aa  96.7  9e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.678008  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5119  beta-lactamase  22.93 
 
 		 402 aa  96.7  9e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3554  penicillin-binding protein  29.7 
 
 		 377 aa  96.7  9e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3511  putative penicillin-binding protein  29.7 
 
 		 377 aa  96.7  9e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2198  beta-lactamase  25.67 
 
 		 543 aa  96.3  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.176904  normal  0.0317754 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6206  beta-lactamase  22.08 
 
 		 321 aa  95.9  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.324563 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3615  beta-lactamase  27.33 
 
 		 611 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0663146 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4213  beta-lactamase  25 
 
 		 403 aa  95.9  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.161495  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3507  penicillin-binding protein, putative  30.96 
 
 		 375 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3731  beta-lactamase  28.57 
 
 		 603 aa  95.5  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.227339 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4043  beta-lactamase  28.37 
 
 		 361 aa  94.7  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6092  beta-lactamase  27.37 
 
 		 419 aa  94.7  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.152854 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0925  beta-lactamase  28.16 
 
 		 966 aa  94.4  4e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0999  beta-lactamase  23.78 
 
 		 367 aa  94.4  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0117018 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3247  beta-lactamase  24.75 
 
 		 513 aa  94.4  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0660544 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2384  beta-lactamase  26.88 
 
 		 483 aa  94.4  4e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11951  lipoprotein  24.9 
 
 		 371 aa  94.4  4e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3498  beta-lactamase  28.71 
 
 		 375 aa  94  5e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2389  cyclic peptide transporter  31.11 
 
 		 1032 aa  94  6e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2987  beta-lactamase  23.55 
 
 		 526 aa  93.6  8e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.204407  normal  0.639877 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3422  beta-lactamase  27.27 
 
 		 593 aa  93.2  8e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.126074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1832  beta-lactamase  23.67 
 
 		 446 aa  92.4  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.29245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1867  beta-lactamase  26.32 
 
 		 517 aa  92.8  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0109165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4697  beta-lactamase  25.61 
 
 		 345 aa  92.4  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.168974  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2316  penicillin-binding protein  25.39 
 
 		 481 aa  92.4  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181197  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0759  putative beta-lactamase class C penicillin binding protein  26.49 
 
 		 498 aa  92  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445171  normal  0.118882 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>