More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0973 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_0973  beta-lactamase  100 
 
 
514 aa  1049    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2389  cyclic peptide transporter  41.53 
 
 
1032 aa  379  1e-104  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1783  cyclic peptide transporter  37.9 
 
 
1055 aa  337  3.9999999999999995e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0903267  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2573  fmtA-like protein, putative  33.81 
 
 
482 aa  258  2e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00911316  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0154  beta-lactamase  34.01 
 
 
482 aa  258  2e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0934  beta-lactamase  37.67 
 
 
475 aa  253  6e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000419238  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2468  beta-lactamase  29.66 
 
 
498 aa  218  2e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00176956  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2516  beta-lactamase  29.66 
 
 
498 aa  218  2e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000422279  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2019  fmtA-like protein  29.81 
 
 
505 aa  201  1.9999999999999998e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.15249  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2400  penicillin-binding protein  28.92 
 
 
481 aa  163  6e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443561  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2575  penicillin-binding protein  28.92 
 
 
481 aa  163  6e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2353  penicillin-binding protein  28.88 
 
 
481 aa  158  3e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000218323  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2316  penicillin-binding protein  28.25 
 
 
481 aa  157  3e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181197  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2587  putative penicillin-binding protein  29.26 
 
 
463 aa  157  4e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35213e-17 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2579  penicillin-binding protein, putative  29.19 
 
 
483 aa  152  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0220569  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2384  beta-lactamase  27.75 
 
 
483 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5985  beta-lactamase  29.79 
 
 
342 aa  143  8e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2629  putative penicillin-binding protein  28.71 
 
 
490 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0110315  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2544  putative penicillin-binding protein  28.61 
 
 
483 aa  140  7e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0622  beta-lactamase  30.85 
 
 
377 aa  136  9e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.357585  normal  0.0394741 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2932  penicillin-binding protein  26.43 
 
 
513 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2650  beta-lactamase  29.38 
 
 
497 aa  133  6.999999999999999e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0361544  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3742  beta-lactamase  27.45 
 
 
478 aa  130  6e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.877046  normal  0.0540026 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04833  beta-lactamase  27.38 
 
 
529 aa  128  3e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2953  beta-lactamase  26.21 
 
 
513 aa  128  3e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8721  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  25.68 
 
 
480 aa  127  5e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1507  Beta-lactamase  28.09 
 
 
595 aa  127  7e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2997  beta-lactamase  26.01 
 
 
513 aa  125  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3032  beta-lactamase  27.07 
 
 
507 aa  126  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.436003 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0097  beta-lactamase  26.71 
 
 
601 aa  125  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5618  beta-lactamase  27.65 
 
 
456 aa  122  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.357665  normal  0.013094 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1946  Beta-lactamase  24.32 
 
 
588 aa  121  3e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3243  beta-lactamase family protein  25.39 
 
 
513 aa  121  3e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1018  beta-lactamase  26.14 
 
 
461 aa  120  4.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.624623 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0116  beta-lactamase  27.23 
 
 
453 aa  120  7.999999999999999e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2717  beta-lactamase  27.22 
 
 
470 aa  119  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0467  beta-lactamase  27.54 
 
 
520 aa  118  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  32.81 
 
 
578 aa  118  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5338  beta-lactamase  25.98 
 
 
525 aa  118  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.271651  normal  0.211898 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3698  beta-lactamase  24.48 
 
 
476 aa  117  6e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.884543  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1906  beta-lactamase  29.34 
 
 
369 aa  117  6e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  28.4 
 
 
487 aa  116  7.999999999999999e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0439  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  27.93 
 
 
392 aa  116  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.919528 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6025  beta-lactamase  25.73 
 
 
460 aa  115  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.565651 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3177  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  27.35 
 
 
484 aa  116  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.075148  normal  0.866618 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5243  beta-lactamase  27.88 
 
 
362 aa  115  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2143  beta-lactamase  27.12 
 
 
401 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.559529  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1712  beta-lactamase  26.51 
 
 
477 aa  115  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.419371  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2459  beta-lactamase  25.78 
 
 
466 aa  115  3e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11747  penicillin-binding protein  27.22 
 
 
539 aa  114  6e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.47398 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0860  beta-lactamase  24.93 
 
 
457 aa  112  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.164383  normal  0.834143 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3615  beta-lactamase  33.68 
 
 
611 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0663146 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2217  alkaline D-peptidase  30.85 
 
 
388 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  3.66047e-16 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1460  beta-lactamase  24.41 
 
 
523 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0171679  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2409  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  28.38 
 
 
388 aa  111  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.37701  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3517  beta-lactamase  27.02 
 
 
447 aa  111  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1710  beta-lactamase  27.03 
 
 
463 aa  111  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.903063 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5327  beta-lactamase  28.25 
 
 
440 aa  110  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.620258 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3518  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  25.19 
 
 
508 aa  111  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3731  beta-lactamase  32.49 
 
 
603 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.227339 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1457  beta-lactamase  27.78 
 
 
325 aa  110  5e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.17461  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2053  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  28.23 
 
 
385 aa  110  8.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00880281  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3064  alkaline D-peptidase  31.21 
 
 
388 aa  109  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0312865  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1798  beta-lactamase  32.35 
 
 
426 aa  109  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.491739  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2051  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  28.23 
 
 
385 aa  109  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.319079  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2755  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  29.29 
 
 
388 aa  109  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0494186  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2968  beta-lactamase  25.33 
 
 
462 aa  109  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3030  alkaline D-peptidase  30.5 
 
 
388 aa  109  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2819  alkaline D-peptidase  30.14 
 
 
388 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118082  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2769  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  30.85 
 
 
389 aa  108  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.48212  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4591  beta-lactamase  29.17 
 
 
675 aa  108  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.434255  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2916  penicillin-binding protein  24.75 
 
 
691 aa  108  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3033  alkaline d-peptidase  30.14 
 
 
388 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.400662  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3027  alkaline D-peptidase  30.85 
 
 
388 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5593  beta-lactamase  23.01 
 
 
480 aa  108  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3422  beta-lactamase  32.99 
 
 
593 aa  108  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.126074  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2093  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  27.95 
 
 
407 aa  108  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1164  beta-lactamase  26.9 
 
 
501 aa  108  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.255434 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3175  beta-lactamase  28.25 
 
 
375 aa  108  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.702373  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3069  alkaline D-peptidase  29.79 
 
 
388 aa  108  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0417304  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2989  penicillin-binding protein  24.75 
 
 
691 aa  108  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3214  penicillin-binding protein  24.75 
 
 
691 aa  108  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.38843  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2296  alkaline D-peptidase  27.97 
 
 
385 aa  108  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000100431 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5715  beta-lactamase  26.37 
 
 
437 aa  108  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1465  beta-lactamase  26.13 
 
 
657 aa  107  4e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.16455  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09923  hypothetical protein  25.69 
 
 
591 aa  107  5e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.916627  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3022  alkaline D-peptidase and alkaline D-peptidase fusion  26.37 
 
 
720 aa  107  5e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0802631  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1298  beta-lactamase  26.39 
 
 
566 aa  107  5e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2440  alkaline D-peptidase (D-stereospecific peptide hydrolase)  28.37 
 
 
388 aa  107  6e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00540718  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2677  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  28.37 
 
 
388 aa  107  6e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000522854 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2775  beta-lactamase  25.77 
 
 
472 aa  107  7e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.987091 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3147  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  27.75 
 
 
407 aa  107  7e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.943509  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01195  penicillin-binding protein  25.37 
 
 
559 aa  107  7e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.119719  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2478  alkaline D-peptidase  28.37 
 
 
388 aa  107  7e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.431844  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2661  alkaline d-peptidase  28.37 
 
 
388 aa  107  7e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2259  beta-lactamase  32.13 
 
 
416 aa  106  9e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.296569  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5771  beta-lactamase  28.29 
 
 
711 aa  106  9e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2036  putative penicillin-binding protein  24.49 
 
 
691 aa  106  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3702  beta-lactamase  26.85 
 
 
430 aa  106  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3206  beta-lactamase  28.34 
 
 
389 aa  105  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>