More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5119 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5119  beta-lactamase  100 
 
 		 402 aa  838    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1520  Beta-lactamase  38.33 
 
 		 537 aa  231  2e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000638983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01195  penicillin-binding protein  34.15 
 
 		 559 aa  211  1e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.119719  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3688  beta-lactamase  32.39 
 
 		 543 aa  183  4.0000000000000006e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497517  normal  0.011807 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2177  beta-lactamase  32.39 
 
 		 543 aa  183  4.0000000000000006e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.816506 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2198  beta-lactamase  30.68 
 
 		 543 aa  169  9e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.176904  normal  0.0317754 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1712  beta-lactamase  30.06 
 
 		 477 aa  166  6.9999999999999995e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.419371  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  31.44 
 
 		 487 aa  154  2.9999999999999998e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3175  beta-lactamase  28.89 
 
 		 351 aa  149  9e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0119788  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  28.93 
 
 		 356 aa  147  4.0000000000000006e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1832  beta-lactamase  30 
 
 		 446 aa  139  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.29245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  30.77 
 
 		 578 aa  136  6.0000000000000005e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4671  alkaline D-peptidase, putative  28.31 
 
 		 330 aa  136  8e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.126225  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5243  beta-lactamase  29.81 
 
 		 362 aa  135  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11951  lipoprotein  29.38 
 
 		 371 aa  134  3e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2968  beta-lactamase  30.69 
 
 		 462 aa  133  6e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5264  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  26.4 
 
 		 493 aa  131  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.0797924 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2717  beta-lactamase  28.65 
 
 		 470 aa  131  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5443  putative beta-lactamase  28.46 
 
 		 364 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.65256  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2208  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.06 
 
 		 442 aa  129  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.474098  normal  0.561482 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1439  Beta-lactamase  27.57 
 
 		 330 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0862025  normal  0.346233 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4280  beta-lactamase  27.96 
 
 		 330 aa  125  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.161716 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0412  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  31.13 
 
 		 422 aa  125  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0622  beta-lactamase  31.16 
 
 		 377 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.357585  normal  0.0394741 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0473  penicillin-binding protein  30.13 
 
 		 421 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5985  beta-lactamase  26.48 
 
 		 342 aa  125  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0502  penicillin-binding protein  30.13 
 
 		 412 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0939  beta-lactamase  26.84 
 
 		 338 aa  125  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.18746 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0483  putative penicillin-binding protein  30.13 
 
 		 412 aa  124  3e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0505  putative penicillin-binding protein  32.6 
 
 		 415 aa  123  5e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0859162  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4818  putative penicillin-binding protein  32.22 
 
 		 416 aa  123  6e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.618322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2638  beta-lactamase  28.04 
 
 		 445 aa  123  6e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0416  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  29.8 
 
 		 421 aa  123  7e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0430511  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0419  beta-lactamase  31.54 
 
 		 416 aa  122  9e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0555  penicillin-binding protein, putative  30.46 
 
 		 413 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.389605  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0558  putative penicillin-binding protein  31.12 
 
 		 413 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.622752  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2294  penicillin-binding protein, putative  27.66 
 
 		 434 aa  117  3e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.272122  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1936  beta-lactamase  27.6 
 
 		 848 aa  117  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.178754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4346  Beta-lactamase  25.61 
 
 		 547 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2736  beta-lactamase  27.27 
 
 		 417 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.416885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3422  beta-lactamase  29.63 
 
 		 593 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.126074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3731  beta-lactamase  29.63 
 
 		 603 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.227339 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1357  beta-lactamase  25.5 
 
 		 378 aa  114  3e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0439  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  25.15 
 
 		 392 aa  112  9e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.919528 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6777  beta-lactamase  26.81 
 
 		 446 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0999  beta-lactamase  25.53 
 
 		 367 aa  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0117018 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3512  beta-lactamase  27.53 
 
 		 364 aa  108  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1906  beta-lactamase  27.83 
 
 		 369 aa  108  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0428  beta-lactamase  29.85 
 
 		 404 aa  108  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.354595  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3615  beta-lactamase  28.85 
 
 		 611 aa  108  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0663146 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0863  beta-lactamase  25.94 
 
 		 363 aa  108  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4350  Beta-lactamase  28.11 
 
 		 553 aa  107  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1460  beta-lactamase  24.55 
 
 		 523 aa  103  6e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0171679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04833  beta-lactamase  26.3 
 
 		 529 aa  102  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5150  beta-lactamase  24.85 
 
 		 369 aa  102  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.175198  normal  0.654906 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4043  beta-lactamase  27.3 
 
 		 361 aa  101  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3027  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  25.53 
 
 		 406 aa  100  5e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.899556  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0375  beta-lactamase  25.37 
 
 		 381 aa  100  6e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0759  putative beta-lactamase class C penicillin binding protein  31.98 
 
 		 498 aa  99.8  8e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445171  normal  0.118882 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0154  beta-lactamase  27.25 
 
 		 482 aa  99.4  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2573  fmtA-like protein, putative  27.25 
 
 		 482 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00911316  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2647  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  27.58 
 
 		 429 aa  98.2  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.180779  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4636  beta-lactamase  25.33 
 
 		 496 aa  98.6  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0606  serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  26.19 
 
 		 438 aa  98.2  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3751  beta-lactamase  26.59 
 
 		 395 aa  97.8  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000498352 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4159  beta-lactamase  25.06 
 
 		 544 aa  97.8  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0453527  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1457  beta-lactamase  24.38 
 
 		 325 aa  97.8  3e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.17461  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0099  D-stereospecific peptide hydrolase  29.15 
 
 		 443 aa  97.4  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000129924  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0973  beta-lactamase  25.82 
 
 		 514 aa  96.7  7e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0116  beta-lactamase  27.03 
 
 		 453 aa  96.7  7e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2768  beta-lactamase  22.93 
 
 		 483 aa  96.7  7e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2556  beta-lactamase  25.86 
 
 		 328 aa  95.9  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.400267 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3030  alkaline D-peptidase  29.69 
 
 		 388 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2755  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  29.52 
 
 		 388 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0494186  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2217  alkaline D-peptidase  29.01 
 
 		 388 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.66047e-16 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0343  beta-lactamase  27.08 
 
 		 482 aa  94.7  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0151  beta-lactamase  32.12 
 
 		 394 aa  94.7  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.288429 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8721  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  27.1 
 
 		 480 aa  93.6  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5167  beta-lactamase  23.14 
 
 		 713 aa  93.6  6e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.619685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1164  beta-lactamase  33.89 
 
 		 501 aa  92.8  9e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.255434 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2573  beta-lactamase  25.64 
 
 		 476 aa  92.4  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.369136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4325  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  25.51 
 
 		 405 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0248121  normal  0.0483573 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3069  alkaline D-peptidase  29.84 
 
 		 388 aa  92  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0417304  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2118  beta-lactamase  22.19 
 
 		 389 aa  92  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.146261  normal  0.0898893 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01828  beta-lactamase precursor  31.14 
 
 		 366 aa  92  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.284204  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2824  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  28.03 
 
 		 388 aa  91.7  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.130693  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4094  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  25.43 
 
 		 405 aa  91.3  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4170  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  25.43 
 
 		 405 aa  91.3  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0934  beta-lactamase  30.8 
 
 		 475 aa  90.9  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000419238  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0477  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidease, putative  29.05 
 
 		 385 aa  90.9  4e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.765713  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3215  beta-lactamase  26.05 
 
 		 405 aa  90.5  5e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000372743  hitchhiker  0.00147977 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2019  fmtA-like protein  23.75 
 
 		 505 aa  90.1  5e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.15249  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3027  alkaline D-peptidase  29.15 
 
 		 388 aa  90.5  5e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3247  beta-lactamase  23.94 
 
 		 513 aa  90.5  5e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0660544 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6092  beta-lactamase  31.9 
 
 		 419 aa  90.5  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.152854 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3206  beta-lactamase  28.66 
 
 		 389 aa  90.1  5e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3018  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  25.22 
 
 		 389 aa  90.1  6e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.470862  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2769  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  28.78 
 
 		 389 aa  89.7  8e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.48212  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3033  alkaline d-peptidase  28.78 
 
 		 388 aa  89.7  8e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.400662  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2516  beta-lactamase  25.87 
 
 		 498 aa  89.7  8e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000422279  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>